63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0231 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0231  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  441  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3034  hypothetical protein  79.25 
 
 
217 aa  360  7.0000000000000005e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3514  hypothetical protein  78.57 
 
 
212 aa  353  1e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.994561  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2864  hypothetical protein  61.32 
 
 
212 aa  285  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2558  hypothetical protein  60.85 
 
 
212 aa  285  5e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0491  hypothetical protein  61.14 
 
 
211 aa  281  7.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2387  hypothetical protein  61.14 
 
 
213 aa  280  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000400557  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1905  hypothetical protein  58.77 
 
 
212 aa  273  1.0000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1562  hypothetical protein  59.72 
 
 
212 aa  264  8.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1596  hypothetical protein  59.24 
 
 
212 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000160674  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000920  ribose 5-phosphate isomerase  53.55 
 
 
211 aa  226  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0781  hypothetical protein  54.72 
 
 
211 aa  226  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2483  hypothetical protein  50.94 
 
 
212 aa  222  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0612  hypothetical protein  52.13 
 
 
212 aa  219  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2204  hypothetical protein  49.77 
 
 
212 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.663487  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2490  hypothetical protein  49.77 
 
 
212 aa  216  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00174175  hitchhiker  0.0000400283 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2095  hypothetical protein  49.77 
 
 
212 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338918  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1188  hypothetical protein  49.53 
 
 
212 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000157328  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2148  hypothetical protein  49.53 
 
 
212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.484462  hitchhiker  2.8697e-19 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2094  hypothetical protein  49.53 
 
 
212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  hitchhiker  5.6242699999999994e-21 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1312  hypothetical protein  49.53 
 
 
212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000032652 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2088  hypothetical protein  49.06 
 
 
212 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000131835 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03282  hypothetical protein  49.71 
 
 
185 aa  185  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.26871  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1068  ribose 5-phosphate isomerase RpiB  35.11 
 
 
139 aa  98.6  7e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2385  ribose 5-phosphate isomerase B  34.17 
 
 
149 aa  58.5  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941182  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2239  ribose-5-phosphate isomerase  29.58 
 
 
145 aa  55.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0792  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  30.97 
 
 
150 aa  53.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0447104  normal  0.0700549 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D05  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  31.85 
 
 
171 aa  53.5  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.305214  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2314  ribose-5-phosphate isomerase  34.21 
 
 
149 aa  52.8  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2065  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  35.85 
 
 
149 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1794  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  31.61 
 
 
171 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.623849  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2093  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  29.92 
 
 
171 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2225  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  38.21 
 
 
171 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2264  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  38.21 
 
 
171 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  29.77 
 
 
143 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0809  ribose 5-phosphate isomerase B  25.77 
 
 
148 aa  48.5  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2692  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  29.09 
 
 
157 aa  47.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0651624  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3456  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  37.8 
 
 
171 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0972  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  30.93 
 
 
149 aa  47.4  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0070  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  34.51 
 
 
176 aa  47  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000149222  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0901  ribose/galactose isomerase  30.97 
 
 
150 aa  46.2  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0259  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  33.33 
 
 
149 aa  45.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000129497  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  29.06 
 
 
147 aa  46.2  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000280792  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1933  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  32.93 
 
 
149 aa  45.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1019  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  31.58 
 
 
143 aa  45.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.485944  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1930  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  35 
 
 
171 aa  45.4  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00064088  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  26.8 
 
 
370 aa  45.4  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1313  ribose 5-phosphate isomerase B  28.37 
 
 
149 aa  45.4  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000182185  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1322  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  27.34 
 
 
142 aa  45.1  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4828  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  29.63 
 
 
149 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305549  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1017  ribose/galactose isomerase  31.3 
 
 
144 aa  44.3  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0396187 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4178  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  28.8 
 
 
149 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811694  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1182  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  28.95 
 
 
145 aa  43.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2392  ribose-5-phosphate isomerase  27.21 
 
 
181 aa  43.5  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.73759  normal  0.0712618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1130  ribose-5-phosphate isomerase  31.18 
 
 
152 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.590654  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5073  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  30.34 
 
 
148 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  27.62 
 
 
149 aa  42.4  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  27.62 
 
 
149 aa  42.4  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3745  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  29.79 
 
 
142 aa  42.4  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0446576  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0790  ribose 5-phosphate isomerase B  30.59 
 
 
145 aa  42  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  28.57 
 
 
146 aa  41.6  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1664  ribose 5-phosphate isomerase B  31.76 
 
 
143 aa  41.2  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1737  ribose 5-phosphate isomerase B  31.76 
 
 
143 aa  41.2  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>