29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03282 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03282  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  380  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.26871  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0612  hypothetical protein  72.99 
 
 
212 aa  278  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2204  hypothetical protein  73.14 
 
 
212 aa  276  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.663487  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2490  hypothetical protein  73.14 
 
 
212 aa  276  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00174175  hitchhiker  0.0000400283 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2095  hypothetical protein  73.14 
 
 
212 aa  276  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338918  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2483  hypothetical protein  72.16 
 
 
212 aa  276  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1312  hypothetical protein  71.51 
 
 
212 aa  268  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000032652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2094  hypothetical protein  71.51 
 
 
212 aa  268  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  hitchhiker  5.6242699999999994e-21 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2148  hypothetical protein  71.51 
 
 
212 aa  268  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.484462  hitchhiker  2.8697e-19 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1188  hypothetical protein  71.35 
 
 
212 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000157328  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2088  hypothetical protein  70.93 
 
 
212 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000131835 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0781  hypothetical protein  70.29 
 
 
211 aa  263  8.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000920  ribose 5-phosphate isomerase  67.24 
 
 
211 aa  256  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0491  hypothetical protein  49.14 
 
 
211 aa  192  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1905  hypothetical protein  49.14 
 
 
212 aa  191  4e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3034  hypothetical protein  49.43 
 
 
217 aa  191  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2387  hypothetical protein  48.84 
 
 
213 aa  189  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000400557  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1562  hypothetical protein  50.29 
 
 
212 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3514  hypothetical protein  47.13 
 
 
212 aa  187  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.994561  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1596  hypothetical protein  51.81 
 
 
212 aa  187  7e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000160674  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2864  hypothetical protein  50 
 
 
212 aa  184  9e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2558  hypothetical protein  50 
 
 
212 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0231  hypothetical protein  49.71 
 
 
213 aa  171  5.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1068  ribose 5-phosphate isomerase RpiB  28.79 
 
 
139 aa  83.6  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2065  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  34.78 
 
 
149 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2314  ribose-5-phosphate isomerase  37.33 
 
 
149 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1019  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  31.31 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.485944  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  33.33 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0792  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  30.56 
 
 
140 aa  41.6  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>