262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2225 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2264  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  100 
 
 
171 aa  353  5e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2225  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  100 
 
 
171 aa  353  5e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1794  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  82.46 
 
 
171 aa  303  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.623849  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D05  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  84.8 
 
 
171 aa  297  4e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.305214  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1930  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  74.85 
 
 
171 aa  263  5.999999999999999e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00064088  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0070  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  67.05 
 
 
176 aa  235  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000149222  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3456  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  60.23 
 
 
171 aa  214  4e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2093  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  57.31 
 
 
171 aa  204  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0493  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  54.71 
 
 
193 aa  192  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.14 
 
 
147 aa  127  8.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000280792  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1638  ribose-5-phosphate isomerase B  41.89 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2692  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.35 
 
 
157 aa  119  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0651624  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2385  ribose 5-phosphate isomerase B  41.5 
 
 
149 aa  118  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941182  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  41.38 
 
 
149 aa  117  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0757  ribose-5-phosphate isomerase B  40 
 
 
148 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  42.07 
 
 
149 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  42.07 
 
 
149 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4828  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.53 
 
 
149 aa  112  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305549  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0790  ribose 5-phosphate isomerase B  39.31 
 
 
145 aa  111  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1747  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40.14 
 
 
148 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0569698  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.15 
 
 
143 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2239  ribose-5-phosphate isomerase  42.97 
 
 
145 aa  108  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0792  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  36.24 
 
 
150 aa  107  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0447104  normal  0.0700549 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  38.69 
 
 
148 aa  107  8.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2392  ribose-5-phosphate isomerase  36.6 
 
 
181 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.73759  normal  0.0712618 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0632  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.88 
 
 
148 aa  106  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0488  ribose-5-phosphate isomerase B  41.38 
 
 
149 aa  105  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.136003  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 
370 aa  105  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1933  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.88 
 
 
149 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1307  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.75 
 
 
154 aa  105  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.833866  normal  0.257706 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4556  ribose-5-phosphate isomerase B  39.13 
 
 
149 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1922  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  38.36 
 
 
153 aa  104  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03962  ribose-5-phosphate isomerase B  38.41 
 
 
149 aa  103  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3901  ribose 5-phosphate isomerase B  38.41 
 
 
149 aa  103  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03922  hypothetical protein  38.41 
 
 
149 aa  103  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3936  ribose-5-phosphate isomerase B  38.41 
 
 
149 aa  103  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0070  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.31 
 
 
149 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3746  ribose-5-phosphate isomerase B  35.17 
 
 
148 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3131  ribose-5-phosphate isomerase B  34.93 
 
 
148 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00448812 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1116  ribose-5-phosphate isomerase B  38.36 
 
 
145 aa  103  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.177801  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1182  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  38.62 
 
 
145 aa  102  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3163  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  41.38 
 
 
152 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000204659  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0410  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  38.52 
 
 
149 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.52921 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0559  ribose 5-phosphate isomerase B  38.69 
 
 
150 aa  102  4e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2042  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  38.89 
 
 
159 aa  102  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1334  ribose-5-phosphate isomerase  37.41 
 
 
148 aa  101  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126498  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3745  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  38.3 
 
 
142 aa  100  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0446576  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4584  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40.62 
 
 
157 aa  100  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.782125  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  38.62 
 
 
322 aa  100  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0259  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.74 
 
 
149 aa  100  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000129497  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0098  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  38.46 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1441  ribose 5-phosphate isomerase B  36.17 
 
 
151 aa  99  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1117  ribose-5-phosphate isomerase B  36.49 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0621  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.68 
 
 
152 aa  99  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4178  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  35.62 
 
 
149 aa  98.2  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811694  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2148  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  34.44 
 
 
152 aa  97.8  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2515  ribose-5-phosphate isomerase B  33.79 
 
 
148 aa  97.4  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499695  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0934  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  32.68 
 
 
161 aa  97.4  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.759422  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0972  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  35.81 
 
 
149 aa  97.4  8e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1737  ribose 5-phosphate isomerase B  36.5 
 
 
143 aa  97.1  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1664  ribose 5-phosphate isomerase B  36.5 
 
 
143 aa  97.1  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  32.12 
 
 
146 aa  96.7  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2859  ribose-5-phosphate isomerase  33.57 
 
 
162 aa  96.7  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000346833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5073  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  32.85 
 
 
148 aa  96.3  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2314  ribose-5-phosphate isomerase  33.09 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1332  ribose-5-phosphate isomerase  34.31 
 
 
148 aa  96.3  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1034  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  36.99 
 
 
146 aa  96.7  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.257274 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1258  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  33.58 
 
 
144 aa  95.5  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000876493  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1159  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  35.56 
 
 
151 aa  95.5  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.832991 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1460  ribose-5-phosphate isomerase  35.77 
 
 
149 aa  95.5  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0652  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  35.77 
 
 
149 aa  94.7  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.867126  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0357  ribose-5-phosphate isomerase  33.79 
 
 
166 aa  94.7  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1263  ribose-5-phosphate isomerase  33.1 
 
 
152 aa  94.4  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1322  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  35.51 
 
 
142 aa  93.6  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2065  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  33.33 
 
 
149 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0809  ribose 5-phosphate isomerase B  37.24 
 
 
148 aa  93.6  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1130  ribose-5-phosphate isomerase  34.75 
 
 
152 aa  92.8  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.590654  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2026  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  34.19 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359244  normal  0.295669 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0615  ribose-5-phosphate isomerase B  35.62 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1017  ribose/galactose isomerase  31.39 
 
 
144 aa  92.4  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0396187 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1171  ribose 5-phosphate isomerase B  35.77 
 
 
148 aa  91.3  5e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0563702  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3103  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  34.81 
 
 
151 aa  91.3  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00677478  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1042  ribose 5-phosphate isomerase B  37.5 
 
 
148 aa  90.9  8e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12490  ribose-5-phosphate isomerase B  36.17 
 
 
162 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0217  ribose 5-phosphate isomerase B  32.62 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00182493  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2809  ribose-5-phosphate isomerase B  35.14 
 
 
149 aa  90.1  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119147  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_583  ribose-5-phosphate isomerase-like protein  35.62 
 
 
154 aa  90.5  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2581  ribose-5-phosphate isomerase B  31.61 
 
 
157 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1042  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  32.12 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000715199  hitchhiker  0.000018847 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11660  ribose 5-phosphate isomerase  38.13 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22120  Ribose 5-phosphate isomerase B protein  30.67 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1026  ribose 5-phosphate isomerase B  43.8 
 
 
148 aa  89.4  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1606  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  36.36 
 
 
148 aa  89  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.350324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0859  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  37.59 
 
 
147 aa  89  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.43121  normal  0.347651 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2593  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  30.82 
 
 
153 aa  89  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0643  ribose-5-phosphate isomerase B  36.73 
 
 
152 aa  88.6  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0677  ribose-5-phosphate isomerase B  36.73 
 
 
152 aa  88.6  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4053  ribose-5-phosphate isomerase B  30.97 
 
 
157 aa  88.6  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl105  ribose 5-phosphate isomerase  33.09 
 
 
146 aa  88.2  5e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1880  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  35.66 
 
 
149 aa  88.2  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>