More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1163 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1163  quinolinate phosphoribosyl transferase  100 
 
 		 296 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.465501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2501  hypothetical protein  98.92 
 
 		 279 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4317  hypothetical protein  43.97 
 
 		 280 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.922994 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1726  modD protein  38.93 
 
 		 290 aa  142  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27933  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4167  modD protein  45.69 
 
 		 277 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00277005  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0908  modD protein  37.55 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.830488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3873  quinolinate phosphoribosyl transferase/putativemolybdenum utilization protein ModD  46.12 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124116  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0375  modD protein  38.21 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1475  putative molybdenum utilization protein ModD  36.5 
 
 		 281 aa  136  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0251  molybdenum transport protein ModD  33.33 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0279  modD protein  41.74 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0455  modD protein  38.5 
 
 		 281 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2039  modD protein  38.43 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3263  modD protein  30.42 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0148  modD protein  39.2 
 
 		 280 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1540  putative molybdenum utilization protein ModD  31.6 
 
 		 288 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0412  putative molybdenum utilization protein ModD  34.4 
 
 		 282 aa  125  9e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.783583  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2028  modD protein  36.52 
 
 		 298 aa  125  9e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33908  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1260  modD protein  40.17 
 
 		 284 aa  125  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.649684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1544  pyrophosphorylase, putative  39.75 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0448  modD protein  35.93 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1951  molybdenum transport protein ModD  29.89 
 
 		 284 aa  122  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448433 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2963  modD protein  37.45 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4264  modD protein  31.67 
 
 		 281 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1193  modD protein  36.48 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1188  modD protein  42.98 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1707  putative molybdenum utilization protein ModD  33.45 
 
 		 285 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1551  modD protein  40.76 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.593391  normal  0.205266 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1543  putative molybdenum utilization protein ModD  39.31 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0060  modD protein  37.77 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.747163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0809  modD protein  32.48 
 
 		 272 aa  117  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0544  modD protein  30.67 
 
 		 283 aa  116  5e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537412  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0376  modD protein  27.34 
 
 		 283 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1536  modD protein  28.78 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1092  modD protein  29.43 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0949  modD protein  28.81 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000429339  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1056  modD protein  43.35 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0979  modD protein  36.52 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  normal  0.0845492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1194  modD protein  41.13 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5866  molybdenum transport component,pyrophosphorylase ModD  40 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2229  modD protein  29.66 
 
 		 285 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1375  ModD protein  27.48 
 
 		 280 aa  102  8e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0476  modD protein  35.39 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1867  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  29.31 
 
 		 275 aa  93.6  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4318  modD protein  41.89 
 
 		 287 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0022213  normal  0.0469871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3533  modD protein  41.77 
 
 		 280 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13700  putative molybdenum utilization protein ModD  32.13 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0259  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  26.23 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1495  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.78 
 
 		 271 aa  85.5  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.451714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002547  quinolinate phosphoribosyltransferase (decarboxylating)  30.24 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1392  ModD protein  27.8 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0320  molybdenum transport system protein ModD  28.57 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1581  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.03 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03467  quinolinate phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2224  modD protein  33.04 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.197416 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0821  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.05 
 
 		 286 aa  79  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2628  quinolinate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1304  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)  26.79 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.424331 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2135  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0786  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.8 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0528  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.65 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1316  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.73 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000271836  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0499  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.33 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.209852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1181  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.05 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6035  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.92 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227072  normal  0.478221 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0532  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.83 
 
 		 512 aa  70.5  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.147571  normal  0.119991 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2217  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.8 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2530  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.04 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3421  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0241  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.9 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0653  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.85 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3574  quinolinate phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.59167  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1682  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  25.63 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000108714  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6033  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.76 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3760  quinolinate phosphoribosyltransferase  29.29 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0667  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.46 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4275  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.93 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00530788  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2452  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  30.36 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0821  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.78 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0634  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  29.39 
 
 		 286 aa  67  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.888939 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  31.03 
 
 		 847 aa  67  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1902  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.74 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0635  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.02 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7190  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.94 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.440978  normal  0.0240565 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0360  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.32 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0214  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.43 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0809106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4755  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.64 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196687  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0853  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  32.88 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00111019  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10850  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)  31.16 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.199467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0431  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.12 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302379  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4217  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.75 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0779  quinolinate phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.188315 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4256  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.75 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000510657 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0371  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  29.46 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.398309  hitchhiker  0.000104956 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0918  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.17 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8380  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.22 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0688  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  25.68 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0602  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.69 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.649104  normal  0.735332 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0378  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  24.03 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0415  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.48 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>