More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1726 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1726  modD protein  100 
 
 		 290 aa  588  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27933  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0412  putative molybdenum utilization protein ModD  47.5 
 
 		 282 aa  248  7e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.783583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2963  modD protein  48.03 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0375  modD protein  43.37 
 
 		 281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0455  modD protein  44.85 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1707  putative molybdenum utilization protein ModD  42.39 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0448  modD protein  44.96 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0279  modD protein  44.2 
 
 		 286 aa  216  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4264  modD protein  41.13 
 
 		 281 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1540  putative molybdenum utilization protein ModD  39.78 
 
 		 288 aa  209  3e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0809  modD protein  40.15 
 
 		 272 aa  209  6e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1475  putative molybdenum utilization protein ModD  44.44 
 
 		 281 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0908  modD protein  38.1 
 
 		 270 aa  195  6e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.830488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1260  modD protein  40.35 
 
 		 284 aa  195  7e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.649684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1544  pyrophosphorylase, putative  40 
 
 		 284 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4317  hypothetical protein  43.27 
 
 		 280 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.922994 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3263  modD protein  35.92 
 
 		 281 aa  192  8e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1193  modD protein  39.65 
 
 		 283 aa  191  9e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0476  modD protein  41.64 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2224  modD protein  38.21 
 
 		 280 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.197416 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0251  molybdenum transport protein ModD  39.3 
 
 		 282 aa  189  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2028  modD protein  36.56 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33908  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1188  modD protein  43.17 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13700  putative molybdenum utilization protein ModD  37.46 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2229  modD protein  34.86 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0949  modD protein  35.71 
 
 		 279 aa  186  4e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000429339  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1951  molybdenum transport protein ModD  36.62 
 
 		 284 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448433 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1551  modD protein  41.9 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.593391  normal  0.205266 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0544  modD protein  34.15 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537412  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0148  modD protein  40.58 
 
 		 280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1056  modD protein  43.88 
 
 		 282 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1375  ModD protein  36.84 
 
 		 280 aa  175  9e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5866  molybdenum transport component,pyrophosphorylase ModD  44.04 
 
 		 291 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1194  modD protein  43.48 
 
 		 280 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0376  modD protein  33.21 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1536  modD protein  32.87 
 
 		 283 aa  169  5e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4167  modD protein  43.17 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00277005  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1092  modD protein  32.85 
 
 		 283 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3873  quinolinate phosphoribosyl transferase/putativemolybdenum utilization protein ModD  43.17 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124116  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1543  putative molybdenum utilization protein ModD  41.97 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3533  modD protein  43.16 
 
 		 280 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4318  modD protein  43.53 
 
 		 287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0022213  normal  0.0469871 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0060  modD protein  36.65 
 
 		 272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.747163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2039  modD protein  39.93 
 
 		 279 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0320  molybdenum transport system protein ModD  34.32 
 
 		 279 aa  152  7e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0979  modD protein  36.07 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  normal  0.0845492 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1392  ModD protein  32.23 
 
 		 277 aa  149  6e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1163  quinolinate phosphoribosyl transferase  38.93 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.465501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2501  hypothetical protein  38.93 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0259  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  28.16 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1304  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)  30.04 
 
 		 263 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.424331 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0821  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.56 
 
 		 286 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2352  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.62 
 
 		 283 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3559  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.97 
 
 		 291 aa  105  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1663  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.45 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.103144  unclonable  0.000000000000154791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1867  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  29.89 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1495  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.27 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.451714  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1973  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.77 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.795275  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0241  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.05 
 
 		 272 aa  99  7e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1682  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  29.32 
 
 		 274 aa  98.6  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000108714  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0499  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.81 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.209852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0653  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.33 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0224  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.5 
 
 		 285 aa  96.3  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1214  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.47 
 
 		 278 aa  96.3  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00785596  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2778  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.46 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1237  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.61 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03770  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.15 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.797923  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0360  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.34 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2190  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.23 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.989593  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1936  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.52 
 
 		 276 aa  89.4  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.941895  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2321  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.72 
 
 		 276 aa  89  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000100602  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1902  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.83 
 
 		 276 aa  88.6  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3748  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  28.57 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00301149  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00640  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.6 
 
 		 280 aa  87.4  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2566  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.93 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0532  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.47 
 
 		 512 aa  86.7  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.147571  normal  0.119991 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0528  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.55 
 
 		 270 aa  86.3  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1316  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.33 
 
 		 275 aa  85.5  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000271836  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03431  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (Eurofung)  27.43 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.98812  normal  0.354975 
 
 
-
 
NC_002936  DET1382  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.59 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00040191  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2135  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.7 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0685  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  25.47 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.20191  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0789  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  33.04 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0584588 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1184  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.9 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2293  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  28.79 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.826935  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0194  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.76 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4484  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.34 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0043  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  24.63 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.541216  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1584  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  25.11 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000162532  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0125  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  24.52 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.300128  normal  0.334676 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2354  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  27.03 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3617  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.63 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0234  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.41 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3164  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.37 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00339828  hitchhiker  0.00016604 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1581  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.23 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1192  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  26.47 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.672764  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15690  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)  32.17 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.227772  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2252  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.28 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487275 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1988  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  27.92 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.103319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02631  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  23.64 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.187748  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>