More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2039 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2039  modD protein  100 
 
 
279 aa  555  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.197629  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1475  putative molybdenum utilization protein ModD  55.4 
 
 
281 aa  271  7e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0279  modD protein  51.99 
 
 
286 aa  238  6.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4317  hypothetical protein  50.9 
 
 
280 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.922994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1551  modD protein  52.33 
 
 
293 aa  225  7e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.593391  normal  0.205266 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1188  modD protein  51.97 
 
 
291 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1194  modD protein  53.07 
 
 
280 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4318  modD protein  53.87 
 
 
287 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0022213  normal  0.0469871 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1543  putative molybdenum utilization protein ModD  54.89 
 
 
286 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1056  modD protein  52.35 
 
 
282 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4167  modD protein  49.25 
 
 
277 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00277005  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0412  putative molybdenum utilization protein ModD  42.45 
 
 
282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.783583  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3873  quinolinate phosphoribosyl transferase/putativemolybdenum utilization protein ModD  49.25 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124116  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4264  modD protein  39.43 
 
 
281 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0148  modD protein  51.3 
 
 
280 aa  195  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1707  putative molybdenum utilization protein ModD  40.07 
 
 
285 aa  192  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0251  molybdenum transport protein ModD  42.91 
 
 
282 aa  192  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0455  modD protein  41.45 
 
 
281 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0448  modD protein  42.45 
 
 
334 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2963  modD protein  42.03 
 
 
283 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0375  modD protein  40.43 
 
 
281 aa  188  9e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5866  molybdenum transport component,pyrophosphorylase ModD  51.29 
 
 
291 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1951  molybdenum transport protein ModD  39.72 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0448433 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0908  modD protein  40.52 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.830488  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0809  modD protein  37.73 
 
 
272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1193  modD protein  43.12 
 
 
283 aa  183  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3263  modD protein  37.86 
 
 
281 aa  181  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1540  putative molybdenum utilization protein ModD  36.06 
 
 
288 aa  181  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2028  modD protein  37.91 
 
 
298 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33908  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3533  modD protein  51.27 
 
 
280 aa  175  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0476  modD protein  42.29 
 
 
284 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1726  modD protein  40.28 
 
 
290 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27933  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0544  modD protein  34.43 
 
 
283 aa  168  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537412  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1260  modD protein  38.99 
 
 
284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.649684  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1544  pyrophosphorylase, putative  38.63 
 
 
284 aa  161  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0376  modD protein  32.6 
 
 
283 aa  155  9e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1092  modD protein  33.09 
 
 
283 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1536  modD protein  32.73 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0949  modD protein  32.73 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000429339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2229  modD protein  33.57 
 
 
285 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0060  modD protein  40.37 
 
 
272 aa  151  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.747163  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0979  modD protein  40.22 
 
 
272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  normal  0.0845492 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2224  modD protein  35.71 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.197416 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1392  ModD protein  34.4 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2501  hypothetical protein  38.79 
 
 
279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1163  quinolinate phosphoribosyl transferase  38.79 
 
 
296 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.465501  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13700  putative molybdenum utilization protein ModD  35.27 
 
 
279 aa  136  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1375  ModD protein  33.7 
 
 
280 aa  126  5e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0320  molybdenum transport system protein ModD  31.41 
 
 
279 aa  117  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2452  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  35.25 
 
 
279 aa  105  8e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1663  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.72 
 
 
275 aa  104  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.103144  unclonable  0.000000000000154791 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0259  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  27.59 
 
 
263 aa  103  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0499  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.07 
 
 
276 aa  102  9e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.209852  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0821  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.69 
 
 
286 aa  101  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02631  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  30 
 
 
287 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.187748  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1555  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  29.63 
 
 
287 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0241  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.84 
 
 
272 aa  99.8  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1304  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)  31.58 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.424331 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02061  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  31.52 
 
 
293 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1237  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.97 
 
 
272 aa  96.3  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2135  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.5 
 
 
279 aa  96.3  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1867  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  29.37 
 
 
275 aa  95.9  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1181  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.72 
 
 
283 aa  95.9  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6035  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.21 
 
 
298 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227072  normal  0.478221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2217  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.23 
 
 
285 aa  91.3  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0420  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.04 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.640134  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1988  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  30.29 
 
 
276 aa  89.4  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.103319  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2778  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.73 
 
 
280 aa  89.7  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0431  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.05 
 
 
285 aa  89.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302379  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1682  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  30.26 
 
 
274 aa  89  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000108714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1936  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.66 
 
 
276 aa  87  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.941895  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2555  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.43 
 
 
283 aa  86.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7190  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.7 
 
 
299 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.440978  normal  0.0240565 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1316  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.58 
 
 
275 aa  86.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000271836  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27531  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  33.21 
 
 
297 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4755  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  38.22 
 
 
282 aa  85.9  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196687  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1214  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.72 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00785596  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0786  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.11 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4484  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.98 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02171  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  26.17 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2646  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.55 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.306201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2769  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.55 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0943247  normal  0.209722 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2872  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.94 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.188879  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0224  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.37 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2352  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.07 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02061  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  26.46 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.857303  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2566  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.24 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3492  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.7 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.770473  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0602  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.52 
 
 
286 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.649104  normal  0.735332 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0634  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  29.57 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.888939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1427  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.65 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0190  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  26.07 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.402278  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10850  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)  35.07 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.199467  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0043  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  24.51 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.541216  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1541  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.33 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1549  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.13 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1902  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.04 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02081  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  25.29 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0194041  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3748  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  30.12 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00301149  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3559  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.58 
 
 
291 aa  79  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  normal  0.118693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>