More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2501 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2501  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1163  quinolinate phosphoribosyl transferase  98.92 
 
 		 296 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.465501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4317  hypothetical protein  43.88 
 
 		 280 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.922994 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4167  modD protein  45.69 
 
 		 277 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00277005  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1726  modD protein  38.93 
 
 		 290 aa  142  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27933  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0908  modD protein  37.55 
 
 		 270 aa  140  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.830488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1475  putative molybdenum utilization protein ModD  36.86 
 
 		 281 aa  139  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3873  quinolinate phosphoribosyl transferase/putativemolybdenum utilization protein ModD  46.12 
 
 		 277 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124116  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0251  molybdenum transport protein ModD  33.69 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0375  modD protein  38.21 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0279  modD protein  41.74 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0455  modD protein  38.5 
 
 		 281 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2039  modD protein  38.43 
 
 		 279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0412  putative molybdenum utilization protein ModD  34.4 
 
 		 282 aa  126  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.783583  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3263  modD protein  30.07 
 
 		 281 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0148  modD protein  36.8 
 
 		 280 aa  126  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2028  modD protein  36.52 
 
 		 298 aa  125  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33908  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1540  putative molybdenum utilization protein ModD  31.6 
 
 		 288 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1260  modD protein  40.17 
 
 		 284 aa  125  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.649684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1544  pyrophosphorylase, putative  39.75 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2963  modD protein  37.87 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1951  molybdenum transport protein ModD  29.89 
 
 		 284 aa  122  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4264  modD protein  31.67 
 
 		 281 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0448  modD protein  35.93 
 
 		 334 aa  122  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1193  modD protein  36.48 
 
 		 283 aa  122  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1188  modD protein  42.98 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1551  modD protein  41.08 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.593391  normal  0.205266 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1707  putative molybdenum utilization protein ModD  33.45 
 
 		 285 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1543  putative molybdenum utilization protein ModD  40.65 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0809  modD protein  32.48 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0544  modD protein  30.67 
 
 		 283 aa  115  6e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537412  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0376  modD protein  27.34 
 
 		 283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1536  modD protein  28.78 
 
 		 283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0060  modD protein  37.5 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.747163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1092  modD protein  28.42 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0949  modD protein  28.81 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000429339  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1056  modD protein  43.35 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1194  modD protein  41.63 
 
 		 280 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5866  molybdenum transport component,pyrophosphorylase ModD  40 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0979  modD protein  36.52 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  normal  0.0845492 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2229  modD protein  29.66 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1375  ModD protein  27.48 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0476  modD protein  35.39 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4318  modD protein  41.89 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0022213  normal  0.0469871 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1867  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  29.31 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3533  modD protein  42.17 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13700  putative molybdenum utilization protein ModD  32.13 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0259  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  26.23 
 
 		 263 aa  88.2  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1495  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.33 
 
 		 271 aa  85.5  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.451714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1392  ModD protein  27.8 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0821  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.62 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2224  modD protein  34.21 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.197416 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1581  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.03 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0320  molybdenum transport system protein ModD  28.57 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002547  quinolinate phosphoribosyltransferase (decarboxylating)  29.84 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0786  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.67 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03467  quinolinate phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1304  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)  27.14 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.424331 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2135  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1316  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.73 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000271836  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6035  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.3 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227072  normal  0.478221 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0499  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.33 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.209852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0528  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.65 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2628  quinolinate phosphoribosyltransferase  29.02 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1181  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.47 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0532  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.83 
 
 		 512 aa  71.2  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.147571  normal  0.119991 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2217  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.2 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2530  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.04 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0241  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.9 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0653  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.85 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1682  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  25.63 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000108714  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6033  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.9 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2452  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  30.8 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0635  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.02 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4275  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.08 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00530788  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0821  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.78 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3421  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.57 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0360  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  25.68 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0667  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.92 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0431  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.12 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302379  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4755  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.84 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196687  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0918  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.17 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3574  quinolinate phosphoribosyltransferase  28.69 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.59167  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0384  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  23.74 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0378  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  23.74 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3760  quinolinate phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0170  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.71 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0946994  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1902  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.37 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0688  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.6 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139091  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4514  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0634  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  28.74 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.888939 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1367  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  25.42 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.216555  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7190  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.57 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.440978  normal  0.0240565 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4279  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.34 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1475  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  27.56 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137856 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  30.6 
 
 		 847 aa  62.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0732  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.84 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0214  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.07 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0809106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2872  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.17 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.188879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4589  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.01 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875937  normal  0.0529683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>