More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1540 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1540  putative molybdenum utilization protein ModD  100 
 
 		 288 aa  590  1e-167  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0809  modD protein  58.74 
 
 		 272 aa  328  4e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3263  modD protein  41.73 
 
 		 281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2229  modD protein  43.07 
 
 		 285 aa  232  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4264  modD protein  41.89 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0412  putative molybdenum utilization protein ModD  41.29 
 
 		 282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.783583  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1726  modD protein  39.78 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27933  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0448  modD protein  41.35 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1475  putative molybdenum utilization protein ModD  37.17 
 
 		 281 aa  208  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0908  modD protein  37.55 
 
 		 270 aa  206  5e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.830488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0949  modD protein  41.73 
 
 		 279 aa  205  9e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000429339  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2963  modD protein  37.91 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0279  modD protein  38.01 
 
 		 286 aa  199  6e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2224  modD protein  36.33 
 
 		 280 aa  198  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.197416 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0375  modD protein  40 
 
 		 281 aa  198  7.999999999999999e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1707  putative molybdenum utilization protein ModD  38.32 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0455  modD protein  39.62 
 
 		 281 aa  196  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13700  putative molybdenum utilization protein ModD  36.8 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0148  modD protein  37.78 
 
 		 280 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0376  modD protein  37.17 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1260  modD protein  36.4 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.649684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1544  pyrophosphorylase, putative  36.03 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1193  modD protein  37.41 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1536  modD protein  36.06 
 
 		 283 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1551  modD protein  36.86 
 
 		 293 aa  182  8.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.593391  normal  0.205266 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1092  modD protein  36.8 
 
 		 283 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4317  hypothetical protein  34.57 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.922994 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0476  modD protein  41.2 
 
 		 284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2028  modD protein  36.4 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33908  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1375  ModD protein  36.36 
 
 		 280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0060  modD protein  36.6 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.747163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0251  molybdenum transport protein ModD  31.67 
 
 		 282 aa  169  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0979  modD protein  37.36 
 
 		 272 aa  168  8e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  normal  0.0845492 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1392  ModD protein  36.3 
 
 		 277 aa  168  9e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0544  modD protein  34.41 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537412  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1188  modD protein  37.64 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2039  modD protein  36.43 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3533  modD protein  36.82 
 
 		 280 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1951  molybdenum transport protein ModD  29.89 
 
 		 284 aa  159  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448433 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4167  modD protein  35.34 
 
 		 277 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00277005  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1056  modD protein  36.3 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1543  putative molybdenum utilization protein ModD  35.93 
 
 		 286 aa  152  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3873  quinolinate phosphoribosyl transferase/putativemolybdenum utilization protein ModD  35.34 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5866  molybdenum transport component,pyrophosphorylase ModD  35.16 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1194  modD protein  35.66 
 
 		 280 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0320  molybdenum transport system protein ModD  33.85 
 
 		 279 aa  145  8.000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4318  modD protein  35.21 
 
 		 287 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0022213  normal  0.0469871 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0259  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  34.08 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0360  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.91 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1867  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  31.09 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1962  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.96 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1973  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.87 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.795275  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0821  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.39 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00640  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.25 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1872  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.23 
 
 		 276 aa  116  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.228495  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1682  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  32.03 
 
 		 274 aa  116  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000108714  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0107  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  31.23 
 
 		 276 aa  116  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0194  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.52 
 
 		 296 aa  113  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0499  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.58 
 
 		 276 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.209852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2530  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.94 
 
 		 283 aa  112  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02171  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  31.91 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1214  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.07 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00785596  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0752  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.67 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1304  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)  29.89 
 
 		 263 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.424331 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0241  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.63 
 
 		 272 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1495  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.27 
 
 		 271 aa  108  8.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.451714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0918  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.11 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0532  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.08 
 
 		 512 aa  107  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.147571  normal  0.119991 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1316  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.36 
 
 		 275 aa  105  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000271836  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1955  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.04 
 
 		 292 aa  105  7e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1778  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.2 
 
 		 279 aa  105  9e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.824148  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4484  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  25.27 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0239  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.69 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1163  quinolinate phosphoribosyl transferase  31.6 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.465501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2501  hypothetical protein  31.6 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1663  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.52 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.103144  unclonable  0.000000000000154791 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0853  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  28.46 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00111019  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0224  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.52 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0914  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.07 
 
 		 288 aa  102  9e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02081  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  29.18 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0194041  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0685  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  26.15 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.20191  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1549  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.57 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0821  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.14 
 
 		 276 aa  102  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02061  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  29.57 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.857303  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0165  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.82 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.844923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1988  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  26.67 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.103319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3435  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.84 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128506  normal  0.402549 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2415  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.47 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0378  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.09 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0125  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.92 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.300128  normal  0.334676 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0384  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.09 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1902  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.04 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2818  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.61 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000688675  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02631  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  28.9 
 
 		 287 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.187748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2293  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  28.52 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.826935  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1555  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  28.9 
 
 		 287 aa  99  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0647  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.37 
 
 		 275 aa  99  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.173443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2252  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.92 
 
 		 278 aa  99  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487275 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3387  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.45 
 
 		 291 aa  99  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3421  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.51 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>