More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1551 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1551  modD protein  100 
 
 
293 aa  579  1e-164  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.593391  normal  0.205266 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0448  modD protein  44.61 
 
 
334 aa  234  9e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4317  hypothetical protein  52.01 
 
 
280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.922994 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0279  modD protein  48.4 
 
 
286 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1188  modD protein  52.48 
 
 
291 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0412  putative molybdenum utilization protein ModD  43.73 
 
 
282 aa  228  7e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.783583  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4167  modD protein  55.39 
 
 
277 aa  228  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00277005  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1475  putative molybdenum utilization protein ModD  50 
 
 
281 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5866  molybdenum transport component,pyrophosphorylase ModD  53.74 
 
 
291 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2039  modD protein  51.97 
 
 
279 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.197629  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3873  quinolinate phosphoribosyl transferase/putativemolybdenum utilization protein ModD  55.39 
 
 
277 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124116  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1707  putative molybdenum utilization protein ModD  40.49 
 
 
285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2963  modD protein  43.97 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1951  molybdenum transport protein ModD  43.43 
 
 
284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0448433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4264  modD protein  39.26 
 
 
281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1056  modD protein  51.77 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0375  modD protein  40.78 
 
 
281 aa  211  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2028  modD protein  40.29 
 
 
298 aa  210  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33908  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0251  molybdenum transport protein ModD  42.2 
 
 
282 aa  209  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0455  modD protein  41.16 
 
 
281 aa  204  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3263  modD protein  38.35 
 
 
281 aa  203  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1540  putative molybdenum utilization protein ModD  37.23 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1194  modD protein  51.28 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1726  modD protein  42.96 
 
 
290 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27933  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1193  modD protein  40.51 
 
 
283 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0476  modD protein  40.86 
 
 
284 aa  189  4e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4318  modD protein  51.65 
 
 
287 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0022213  normal  0.0469871 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0908  modD protein  37.31 
 
 
270 aa  186  5e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.830488  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0148  modD protein  44.49 
 
 
280 aa  186  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1543  putative molybdenum utilization protein ModD  47.6 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0809  modD protein  35.66 
 
 
272 aa  182  7e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0060  modD protein  42.34 
 
 
272 aa  182  7e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.747163  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3533  modD protein  53.07 
 
 
280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2229  modD protein  35.77 
 
 
285 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1260  modD protein  40.65 
 
 
284 aa  177  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.649684  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1544  pyrophosphorylase, putative  40.29 
 
 
284 aa  175  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2224  modD protein  36.96 
 
 
280 aa  175  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.197416 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0949  modD protein  31.39 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000429339  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0544  modD protein  31.85 
 
 
283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537412  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0979  modD protein  42.34 
 
 
272 aa  171  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  normal  0.0845492 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13700  putative molybdenum utilization protein ModD  34.52 
 
 
279 aa  169  7e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1092  modD protein  30.91 
 
 
283 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0376  modD protein  29.82 
 
 
283 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1536  modD protein  30.55 
 
 
283 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1392  ModD protein  31.79 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1375  ModD protein  29.48 
 
 
280 aa  142  7e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0320  molybdenum transport system protein ModD  31.68 
 
 
279 aa  137  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0259  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  30.55 
 
 
263 aa  123  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2501  hypothetical protein  40.76 
 
 
279 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1163  quinolinate phosphoribosyl transferase  40.76 
 
 
296 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.465501  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1555  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  28.57 
 
 
287 aa  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02631  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  28.93 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.187748  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2135  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.21 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2452  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  36.26 
 
 
279 aa  113  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0685  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  25.71 
 
 
279 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.20191  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0224  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.47 
 
 
285 aa  109  7.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00640  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.58 
 
 
280 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1867  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  28.29 
 
 
275 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0125  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  25.45 
 
 
279 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.300128  normal  0.334676 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0378  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.31 
 
 
279 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1214  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.26 
 
 
278 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00785596  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0384  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.31 
 
 
279 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1495  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.52 
 
 
271 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.451714  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1304  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)  29.6 
 
 
263 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.424331 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0420  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.69 
 
 
277 aa  104  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.640134  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1778  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  24.73 
 
 
279 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.824148  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02171  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  28.21 
 
 
288 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0499  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.21 
 
 
276 aa  103  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.209852  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03770  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.9 
 
 
307 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.797923  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02081  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  27.21 
 
 
288 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0194041  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1872  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.39 
 
 
276 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.228495  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02061  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  31.14 
 
 
293 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02061  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  27.47 
 
 
288 aa  99  7e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.857303  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0786  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.39 
 
 
281 aa  99  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27531  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  34 
 
 
297 aa  99  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1902  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.18 
 
 
276 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1549  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32 
 
 
287 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0821  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.45 
 
 
286 aa  98.2  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0107  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  28.42 
 
 
276 aa  97.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0789  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  33.1 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0584588 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0241  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.32 
 
 
272 aa  97.8  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0528  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.56 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3748  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  28.16 
 
 
277 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00301149  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5465  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.32 
 
 
290 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0160408  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1988  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  30.6 
 
 
276 aa  95.9  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.103319  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  32.86 
 
 
847 aa  95.5  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1475  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  27.56 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.137856 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1755  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.71 
 
 
282 aa  95.5  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.828891  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1237  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.81 
 
 
272 aa  95.1  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3164  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.98 
 
 
282 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00339828  hitchhiker  0.00016604 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0190  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  27.11 
 
 
288 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.402278  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1316  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.48 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000271836  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2321  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.15 
 
 
276 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000100602  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1936  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.34 
 
 
276 aa  93.6  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.941895  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2778  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.55 
 
 
280 aa  92.8  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3478  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.73 
 
 
278 aa  93.2  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.939754  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6033  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.91 
 
 
308 aa  92.8  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2646  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.82 
 
 
286 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.306201 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0914  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  24.24 
 
 
288 aa  92.8  6e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2872  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.59 
 
 
286 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.188879  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>