More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1092 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1092  modD protein  100 
 
 
283 aa  579  1e-164  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0376  modD protein  93.64 
 
 
283 aa  548  1e-155  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1536  modD protein  92.58 
 
 
283 aa  544  1e-154  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0544  modD protein  66.78 
 
 
283 aa  409  1e-113  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537412  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0375  modD protein  44.37 
 
 
281 aa  241  7.999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1707  putative molybdenum utilization protein ModD  42.24 
 
 
285 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0448  modD protein  44 
 
 
334 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0412  putative molybdenum utilization protein ModD  41.58 
 
 
282 aa  229  3e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.783583  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4264  modD protein  43.59 
 
 
281 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0949  modD protein  42.86 
 
 
279 aa  225  5.0000000000000005e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000429339  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0476  modD protein  42.65 
 
 
284 aa  224  9e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0455  modD protein  41.94 
 
 
281 aa  223  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3263  modD protein  39.21 
 
 
281 aa  219  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0908  modD protein  37.78 
 
 
270 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.830488  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2028  modD protein  39.86 
 
 
298 aa  212  7e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33908  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2963  modD protein  39.57 
 
 
283 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2229  modD protein  39.29 
 
 
285 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0809  modD protein  38.89 
 
 
272 aa  204  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0279  modD protein  38.38 
 
 
286 aa  199  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1193  modD protein  36.3 
 
 
283 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1260  modD protein  34.15 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.649684  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2224  modD protein  35.66 
 
 
280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.197416 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1544  pyrophosphorylase, putative  33.8 
 
 
284 aa  182  6e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1540  putative molybdenum utilization protein ModD  36.8 
 
 
288 aa  181  9.000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1475  putative molybdenum utilization protein ModD  32.75 
 
 
281 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13700  putative molybdenum utilization protein ModD  32.85 
 
 
279 aa  168  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0251  molybdenum transport protein ModD  31.07 
 
 
282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4317  hypothetical protein  34.29 
 
 
280 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.922994 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1726  modD protein  32.85 
 
 
290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27933  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1392  ModD protein  33.7 
 
 
277 aa  162  7e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0320  molybdenum transport system protein ModD  33.96 
 
 
279 aa  154  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0060  modD protein  34.08 
 
 
272 aa  154  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.747163  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0979  modD protein  34.83 
 
 
272 aa  152  8e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  normal  0.0845492 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1951  molybdenum transport protein ModD  27.7 
 
 
284 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0448433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0148  modD protein  34.43 
 
 
280 aa  148  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1543  putative molybdenum utilization protein ModD  36.06 
 
 
286 aa  148  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1188  modD protein  34.07 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1056  modD protein  35.53 
 
 
282 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1551  modD protein  30.91 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.593391  normal  0.205266 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2039  modD protein  32.73 
 
 
279 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.197629  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3533  modD protein  36.92 
 
 
280 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1194  modD protein  33.7 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1682  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  34.73 
 
 
274 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000108714  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1375  ModD protein  31.64 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4167  modD protein  34.46 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00277005  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3873  quinolinate phosphoribosyl transferase/putativemolybdenum utilization protein ModD  34.83 
 
 
277 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5866  molybdenum transport component,pyrophosphorylase ModD  34.3 
 
 
291 aa  128  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1867  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  31.8 
 
 
275 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4318  modD protein  32.85 
 
 
287 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0022213  normal  0.0469871 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0360  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.07 
 
 
269 aa  115  7.999999999999999e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0224  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.52 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1973  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.48 
 
 
275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.795275  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0499  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.62 
 
 
276 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.209852  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0821  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.19 
 
 
286 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1304  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)  30.34 
 
 
263 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.424331 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2352  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.28 
 
 
283 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0378  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.22 
 
 
279 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1184  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.58 
 
 
273 aa  104  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0259  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  26.64 
 
 
263 aa  103  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0241  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.55 
 
 
272 aa  102  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1549  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.21 
 
 
287 aa  102  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0384  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.48 
 
 
279 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1146  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.42 
 
 
273 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1163  quinolinate phosphoribosyl transferase  29.43 
 
 
296 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.465501  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1663  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.99 
 
 
275 aa  100  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.103144  unclonable  0.000000000000154791 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2501  hypothetical protein  28.42 
 
 
279 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1902  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.39 
 
 
276 aa  99.4  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2530  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.57 
 
 
283 aa  98.6  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2778  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.63 
 
 
280 aa  97.1  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1495  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.14 
 
 
271 aa  95.5  9e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.451714  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2321  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.58 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000100602  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0528  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.41 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0653  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.7 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0420  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.52 
 
 
277 aa  94  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.640134  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1584  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.35 
 
 
270 aa  93.2  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000162532  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2139  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.71 
 
 
291 aa  92.8  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1581  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.27 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0043  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.79 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.541216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4514  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.62 
 
 
277 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0688  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.9 
 
 
277 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139091  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0217  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.78 
 
 
304 aa  88.2  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3382  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.02 
 
 
297 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0294681  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2818  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.42 
 
 
276 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000688675  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1237  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.44 
 
 
272 aa  86.7  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0752  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.01 
 
 
279 aa  86.3  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1872  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.94 
 
 
276 aa  85.9  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.228495  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0786  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.74 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0107  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  25.77 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1962  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.02 
 
 
298 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0234  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.57 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4275  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.34 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00530788  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2190  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.79 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.989593  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0239  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.14 
 
 
276 aa  84  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0918  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.46 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0853  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  25.93 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00111019  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2920  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.28 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0914  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.33 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1936  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.08 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.941895  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3435  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  25.79 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128506  normal  0.402549 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4547  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.54 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>