More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1304 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1304  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)  100 
 
 		 263 aa  541  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.424331 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0259  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  58.94 
 
 		 263 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0060  modD protein  36.53 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.747163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0979  modD protein  36.3 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  normal  0.0845492 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0412  putative molybdenum utilization protein ModD  32.22 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.783583  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0375  modD protein  31.73 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0279  modD protein  30.37 
 
 		 286 aa  132  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4264  modD protein  32.84 
 
 		 281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1707  putative molybdenum utilization protein ModD  33.33 
 
 		 285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0448  modD protein  31.58 
 
 		 334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2963  modD protein  31.25 
 
 		 283 aa  125  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3263  modD protein  30.74 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0455  modD protein  30.08 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0949  modD protein  30.27 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000429339  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4317  hypothetical protein  29.17 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.922994 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1495  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.57 
 
 		 271 aa  115  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.451714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1726  modD protein  30.04 
 
 		 290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27933  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1973  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.97 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.795275  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0544  modD protein  31.46 
 
 		 283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537412  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2028  modD protein  29.17 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33908  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0532  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.31 
 
 		 512 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.147571  normal  0.119991 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0224  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.63 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0376  modD protein  30.71 
 
 		 283 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13700  putative molybdenum utilization protein ModD  31.58 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0914  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.52 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2224  modD protein  31.09 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.197416 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1540  putative molybdenum utilization protein ModD  29.89 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1193  modD protein  30.77 
 
 		 283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0821  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.08 
 
 		 286 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0148  modD protein  30.12 
 
 		 280 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2229  modD protein  28.99 
 
 		 285 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1375  ModD protein  30.04 
 
 		 280 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1092  modD protein  30.34 
 
 		 283 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1392  ModD protein  28.2 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0476  modD protein  29.7 
 
 		 284 aa  105  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0809  modD protein  30.32 
 
 		 272 aa  105  7e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1475  putative molybdenum utilization protein ModD  28.89 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1536  modD protein  28.84 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1867  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  31.91 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0528  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.18 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0908  modD protein  27.72 
 
 		 270 aa  102  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.830488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0499  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.13 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.209852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1260  modD protein  30.08 
 
 		 284 aa  99.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.649684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4167  modD protein  29.39 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00277005  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1544  pyrophosphorylase, putative  29.7 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1951  molybdenum transport protein ModD  27.13 
 
 		 284 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448433 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0360  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.1 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2352  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.99 
 
 		 283 aa  95.9  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1682  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  34.33 
 
 		 274 aa  95.9  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000108714  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1188  modD protein  26.3 
 
 		 291 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0170  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  36.73 
 
 		 287 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0946994  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0348  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.87 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3873  quinolinate phosphoribosyl transferase/putativemolybdenum utilization protein ModD  29.39 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124116  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6035  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.82 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227072  normal  0.478221 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0043  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.11 
 
 		 297 aa  93.2  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.541216  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1056  modD protein  31.11 
 
 		 282 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0241  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.05 
 
 		 272 aa  92.8  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4589  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  38.46 
 
 		 287 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875937  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2774  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.94 
 
 		 285 aa  92.4  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.109833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2872  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  36.84 
 
 		 286 aa  92  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.188879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2646  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  36.32 
 
 		 286 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.306201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2818  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.8 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000688675  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1581  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.81 
 
 		 275 aa  90.5  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2769  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.26 
 
 		 286 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0943247  normal  0.209722 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0320  molybdenum transport system protein ModD  25.98 
 
 		 279 aa  90.1  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5866  molybdenum transport component,pyrophosphorylase ModD  29.6 
 
 		 291 aa  89.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1184  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.73 
 
 		 273 aa  89  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0251  molybdenum transport protein ModD  25.93 
 
 		 282 aa  88.6  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2321  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.78 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000100602  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4430  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  37.06 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.530195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2566  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.5 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15690  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)  31.09 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.227772  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0125  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.02 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.300128  normal  0.334676 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0378  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.17 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0107  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  33.33 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3559  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.01 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1549  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.11 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1778  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.79 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.824148  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2135  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.17 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2217  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.03 
 
 		 285 aa  86.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1551  modD protein  28.16 
 
 		 293 aa  86.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.593391  normal  0.205266 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0647  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.51 
 
 		 275 aa  85.9  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.173443  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0685  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  28.24 
 
 		 279 aa  85.9  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.20191  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0653  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.71 
 
 		 275 aa  85.9  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1146  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.45 
 
 		 273 aa  85.5  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1237  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30 
 
 		 272 aa  85.5  8e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0384  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.52 
 
 		 279 aa  85.5  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2558  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.68 
 
 		 309 aa  85.5  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0983562  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1902  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.78 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2555  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  37.91 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4484  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.89 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7190  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.89 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.440978  normal  0.0240565 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2452  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  28.68 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1214  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.48 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00785596  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2920  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.05 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2295  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.25 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000103695 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00640  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.97 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2248  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  35.44 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.51038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5465  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.55 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0160408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1194  modD protein  28.52 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>