More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1951 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1951  molybdenum transport protein ModD  100 
 
 		 284 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448433 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0251  molybdenum transport protein ModD  55.36 
 
 		 282 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1551  modD protein  42.34 
 
 		 293 aa  199  6e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.593391  normal  0.205266 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0148  modD protein  38.35 
 
 		 280 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0412  putative molybdenum utilization protein ModD  37 
 
 		 282 aa  189  5e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.783583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2963  modD protein  37.28 
 
 		 283 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1260  modD protein  38.16 
 
 		 284 aa  186  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.649684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1544  pyrophosphorylase, putative  37.81 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0375  modD protein  36.1 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1726  modD protein  36.62 
 
 		 290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27933  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1475  putative molybdenum utilization protein ModD  39.19 
 
 		 281 aa  178  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1707  putative molybdenum utilization protein ModD  35.14 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2039  modD protein  39.72 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0279  modD protein  36.13 
 
 		 286 aa  176  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4264  modD protein  36.65 
 
 		 281 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0455  modD protein  33.81 
 
 		 281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0448  modD protein  35.38 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4317  hypothetical protein  35 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.922994 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3263  modD protein  31.9 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0476  modD protein  33.45 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0544  modD protein  27.96 
 
 		 283 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537412  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0809  modD protein  32.84 
 
 		 272 aa  162  7e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1188  modD protein  36.33 
 
 		 291 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4167  modD protein  35.58 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00277005  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2224  modD protein  31.07 
 
 		 280 aa  159  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.197416 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1540  putative molybdenum utilization protein ModD  29.89 
 
 		 288 aa  159  5e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3873  quinolinate phosphoribosyl transferase/putativemolybdenum utilization protein ModD  35.21 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2229  modD protein  29.64 
 
 		 285 aa  156  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2028  modD protein  30 
 
 		 298 aa  155  8e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33908  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1193  modD protein  32.36 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0376  modD protein  27.34 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1092  modD protein  27.7 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1536  modD protein  27.4 
 
 		 283 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0908  modD protein  31.72 
 
 		 270 aa  149  7e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.830488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5866  molybdenum transport component,pyrophosphorylase ModD  34.78 
 
 		 291 aa  149  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0060  modD protein  31.88 
 
 		 272 aa  146  3e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.747163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13700  putative molybdenum utilization protein ModD  30.58 
 
 		 279 aa  146  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1056  modD protein  36.69 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0949  modD protein  28.57 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000429339  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4318  modD protein  34.78 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0022213  normal  0.0469871 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1543  putative molybdenum utilization protein ModD  35.21 
 
 		 286 aa  143  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0979  modD protein  31.16 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  normal  0.0845492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1194  modD protein  34.3 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3533  modD protein  37.5 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1375  ModD protein  28.52 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1392  ModD protein  28.99 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0320  molybdenum transport system protein ModD  28.89 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2501  hypothetical protein  29.89 
 
 		 279 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1163  quinolinate phosphoribosyl transferase  29.89 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.465501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0259  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  27.94 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2135  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.6 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1988  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  28.42 
 
 		 276 aa  99.8  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.103319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1304  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)  27.13 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.424331 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1682  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  25.49 
 
 		 274 aa  96.7  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000108714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1902  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.08 
 
 		 276 aa  95.5  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2818  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000688675  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2252  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.39 
 
 		 278 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487275 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0653  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.35 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1495  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.57 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.451714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0378  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  22.06 
 
 		 279 aa  93.2  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0384  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  22.42 
 
 		 279 aa  92.8  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2321  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.35 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000100602  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2452  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  31.48 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0107  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  26.24 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1936  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.05 
 
 		 276 aa  90.1  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.941895  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1549  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.79 
 
 		 287 aa  90.1  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1663  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.29 
 
 		 275 aa  89.7  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.103144  unclonable  0.000000000000154791 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3748  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  27.44 
 
 		 277 aa  89.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00301149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0165  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.85 
 
 		 285 aa  89  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.844923  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0360  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.21 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1555  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  27.57 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0194  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.2 
 
 		 296 aa  86.3  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1972  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.31 
 
 		 274 aa  85.9  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2134  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  25.67 
 
 		 290 aa  85.9  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00345657  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0528  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  25.37 
 
 		 270 aa  85.9  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0951  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.74 
 
 		 282 aa  85.9  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0224  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.57 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00640  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.62 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1872  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.31 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.228495  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1316  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.39 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000271836  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02171  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  26.62 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02631  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  27.21 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.187748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0082  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.84 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0532  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.19 
 
 		 512 aa  83.2  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.147571  normal  0.119991 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11612  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.71 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.588375  normal  0.382236 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2530  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  25.88 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1867  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  24.22 
 
 		 275 aa  82  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1973  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.53 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.795275  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4484  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.25 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2352  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  25.73 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2190  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.34 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.989593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0810  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.07 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.182646  normal  0.0443803 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1778  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  24.25 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.824148  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0701  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.32 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0190  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  26.24 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.402278  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2555  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.43 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2354  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  25 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0499  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.71 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.209852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0918  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.45 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0270  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.17 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>