More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0809 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0809  modD protein  100 
 
 
272 aa  558  1e-158  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1540  putative molybdenum utilization protein ModD  58.74 
 
 
288 aa  328  4e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3263  modD protein  39.78 
 
 
281 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1726  modD protein  40.15 
 
 
290 aa  209  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27933  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4264  modD protein  39.93 
 
 
281 aa  208  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0544  modD protein  37.04 
 
 
283 aa  207  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537412  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1092  modD protein  38.89 
 
 
283 aa  204  9e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0376  modD protein  38.15 
 
 
283 aa  202  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2229  modD protein  39.33 
 
 
285 aa  198  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0412  putative molybdenum utilization protein ModD  39.02 
 
 
282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.783583  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0279  modD protein  38.58 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1536  modD protein  36.67 
 
 
283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0375  modD protein  39.33 
 
 
281 aa  193  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1475  putative molybdenum utilization protein ModD  37.41 
 
 
281 aa  193  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0448  modD protein  39.85 
 
 
334 aa  193  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2963  modD protein  37.97 
 
 
283 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0949  modD protein  38.66 
 
 
279 aa  189  4e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000429339  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0251  molybdenum transport protein ModD  36.33 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0455  modD protein  38.52 
 
 
281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0908  modD protein  36.33 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.830488  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1707  putative molybdenum utilization protein ModD  38.17 
 
 
285 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4317  hypothetical protein  35.19 
 
 
280 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.922994 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1260  modD protein  35.79 
 
 
284 aa  176  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.649684  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1544  pyrophosphorylase, putative  35.42 
 
 
284 aa  175  7e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0476  modD protein  39.85 
 
 
284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0148  modD protein  36.3 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1392  ModD protein  34.8 
 
 
277 aa  171  2e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2224  modD protein  34.2 
 
 
280 aa  170  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.197416 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2039  modD protein  37.73 
 
 
279 aa  169  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.197629  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1551  modD protein  35.66 
 
 
293 aa  168  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.593391  normal  0.205266 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2028  modD protein  34.08 
 
 
298 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33908  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1193  modD protein  36.7 
 
 
283 aa  166  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1543  putative molybdenum utilization protein ModD  36.8 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1375  ModD protein  33.7 
 
 
280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1951  molybdenum transport protein ModD  32.84 
 
 
284 aa  162  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0448433 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13700  putative molybdenum utilization protein ModD  32.45 
 
 
279 aa  160  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0060  modD protein  34.6 
 
 
272 aa  156  3e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.747163  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0320  molybdenum transport system protein ModD  34.88 
 
 
279 aa  154  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1188  modD protein  36.06 
 
 
291 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3533  modD protein  36 
 
 
280 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0979  modD protein  34.6 
 
 
272 aa  150  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  normal  0.0845492 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4167  modD protein  32.45 
 
 
277 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00277005  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3873  quinolinate phosphoribosyl transferase/putativemolybdenum utilization protein ModD  32.08 
 
 
277 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5866  molybdenum transport component,pyrophosphorylase ModD  33.09 
 
 
291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4318  modD protein  34.07 
 
 
287 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0022213  normal  0.0469871 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1194  modD protein  33.09 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1056  modD protein  33.83 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0259  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  34.57 
 
 
263 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0752  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.62 
 
 
279 aa  115  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0107  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  30.92 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1867  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  30.26 
 
 
275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00640  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.01 
 
 
280 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0647  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.97 
 
 
275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.173443  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1872  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.21 
 
 
276 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.228495  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1682  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  30.8 
 
 
274 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000108714  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1778  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.2 
 
 
279 aa  106  5e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.824148  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0125  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.52 
 
 
279 aa  105  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.300128  normal  0.334676 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1304  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)  30.32 
 
 
263 aa  105  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.424331 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0360  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.27 
 
 
269 aa  105  8e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1973  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.33 
 
 
275 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.795275  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0685  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  28.84 
 
 
279 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.20191  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1367  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.96 
 
 
283 aa  104  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.216555  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0914  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.41 
 
 
288 aa  104  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0378  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.13 
 
 
279 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3435  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.47 
 
 
293 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128506  normal  0.402549 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1663  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.54 
 
 
275 aa  103  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.103144  unclonable  0.000000000000154791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4484  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.41 
 
 
293 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0184  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.34 
 
 
274 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0241  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.62 
 
 
272 aa  103  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1962  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.89 
 
 
298 aa  103  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1902  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.57 
 
 
276 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0224  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.84 
 
 
285 aa  102  8e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2010  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  30.97 
 
 
274 aa  102  9e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1050  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.84 
 
 
277 aa  101  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000815548  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0384  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.35 
 
 
279 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0043  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.41 
 
 
297 aa  100  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.541216  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2139  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.2 
 
 
291 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0902  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  29.6 
 
 
287 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.558304  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1728  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.48 
 
 
278 aa  99.8  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0853  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  31.08 
 
 
284 aa  99.4  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00111019  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0420  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.17 
 
 
277 aa  99  7e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.640134  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2321  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.1 
 
 
276 aa  99  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000100602  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1263  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  25.19 
 
 
287 aa  99  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2415  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.51 
 
 
305 aa  98.6  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741322  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2530  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.96 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1584  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.06 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000162532  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0315  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.92 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1163  quinolinate phosphoribosyl transferase  32.48 
 
 
296 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.465501  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2501  hypothetical protein  32.48 
 
 
279 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1972  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.41 
 
 
274 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4217  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.95 
 
 
282 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4256  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.95 
 
 
282 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000510657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0165  quinolinate phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 
311 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.383546  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1936  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.83 
 
 
276 aa  97.1  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.941895  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3478  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.55 
 
 
278 aa  97.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.939754  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0239  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.86 
 
 
276 aa  97.8  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0158  quinolinate phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0157  quinolinate phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3421  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.62 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0159  quinolinate phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>