More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0412 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0412  putative molybdenum utilization protein ModD  100 
 
 		 282 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.783583  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0455  modD protein  67.14 
 
 		 281 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0375  modD protein  65.59 
 
 		 281 aa  381  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0476  modD protein  69.4 
 
 		 284 aa  368  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1707  putative molybdenum utilization protein ModD  63.08 
 
 		 285 aa  355  3.9999999999999996e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0448  modD protein  62.01 
 
 		 334 aa  346  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2963  modD protein  62.82 
 
 		 283 aa  346  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4264  modD protein  52.35 
 
 		 281 aa  291  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3263  modD protein  44.77 
 
 		 281 aa  251  7e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0279  modD protein  46.95 
 
 		 286 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1726  modD protein  47.5 
 
 		 290 aa  248  7e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27933  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2229  modD protein  45.13 
 
 		 285 aa  246  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1260  modD protein  45.96 
 
 		 284 aa  246  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.649684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1544  pyrophosphorylase, putative  45.59 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2224  modD protein  43.53 
 
 		 280 aa  243  3e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.197416 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2028  modD protein  45.45 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33908  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0544  modD protein  43.01 
 
 		 283 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537412  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4317  hypothetical protein  45.32 
 
 		 280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.922994 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1475  putative molybdenum utilization protein ModD  46.1 
 
 		 281 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0908  modD protein  43.45 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.830488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13700  putative molybdenum utilization protein ModD  41.52 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0376  modD protein  41.22 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1092  modD protein  41.58 
 
 		 283 aa  229  3e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1193  modD protein  44.77 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1536  modD protein  40.86 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1540  putative molybdenum utilization protein ModD  41.29 
 
 		 288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1551  modD protein  43.37 
 
 		 293 aa  212  5.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.593391  normal  0.205266 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0949  modD protein  39.86 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000429339  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0251  molybdenum transport protein ModD  40.71 
 
 		 282 aa  210  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1188  modD protein  45.52 
 
 		 291 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0148  modD protein  40.93 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1056  modD protein  46.64 
 
 		 282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0809  modD protein  39.02 
 
 		 272 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1951  molybdenum transport protein ModD  37 
 
 		 284 aa  189  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448433 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1392  ModD protein  37.87 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2039  modD protein  42.45 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1194  modD protein  44.65 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5866  molybdenum transport component,pyrophosphorylase ModD  43.01 
 
 		 291 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1543  putative molybdenum utilization protein ModD  42.91 
 
 		 286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3533  modD protein  48.34 
 
 		 280 aa  178  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1375  ModD protein  36.4 
 
 		 280 aa  176  5e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0060  modD protein  38.32 
 
 		 272 aa  175  6e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.747163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4318  modD protein  43.66 
 
 		 287 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0022213  normal  0.0469871 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4167  modD protein  40.75 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00277005  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0320  molybdenum transport system protein ModD  34.94 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3873  quinolinate phosphoribosyl transferase/putativemolybdenum utilization protein ModD  40.75 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124116  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0979  modD protein  37.23 
 
 		 272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  normal  0.0845492 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0259  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  34.59 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2135  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.19 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1304  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)  32.22 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.424331 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0528  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.19 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2352  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.45 
 
 		 283 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1973  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.63 
 
 		 275 aa  126  5e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.795275  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0224  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.39 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0821  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.81 
 
 		 286 aa  122  9e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1495  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.85 
 
 		 271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.451714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1867  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  28.96 
 
 		 275 aa  119  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0499  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.85 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.209852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1555  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  30.26 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0918  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.85 
 
 		 276 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02631  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  29.63 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.187748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2252  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.82 
 
 		 278 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487275 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2920  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.24 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02061  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  31.44 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1549  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.52 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2501  hypothetical protein  34.4 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2452  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  31.25 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0241  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.57 
 
 		 272 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1682  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  29.12 
 
 		 274 aa  112  9e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000108714  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1163  quinolinate phosphoribosyl transferase  34.4 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.465501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2530  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.42 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0123  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.69 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000568381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0653  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.86 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1237  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.48 
 
 		 272 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1728  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.05 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0532  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.23 
 
 		 512 aa  109  5e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.147571  normal  0.119991 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0420  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.63 
 
 		 277 aa  109  6e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.640134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2354  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  30.95 
 
 		 277 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0685  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  27.61 
 
 		 279 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.20191  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1663  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.103144  unclonable  0.000000000000154791 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1872  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.58 
 
 		 276 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.228495  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1902  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.32 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1158  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.27 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000773336  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0378  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.03 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0360  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.05 
 
 		 269 aa  105  8e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1214  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.59 
 
 		 278 aa  105  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00785596  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0107  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  28.85 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00640  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.37 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2117  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  33.2 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.498156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1316  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.27 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000271836  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0786  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.16 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0688  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.2 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2321  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.88 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000100602  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0043  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.03 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.541216  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0384  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.65 
 
 		 279 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58700  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.03 
 
 		 282 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229559  normal  0.604344 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3748  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  28.15 
 
 		 277 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00301149  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1581  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.81 
 
 		 275 aa  102  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27531  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  30.63 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4275  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.92 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00530788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>