More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0476 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0476  modD protein  100 
 
 
284 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0455  modD protein  73.93 
 
 
281 aa  422  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0375  modD protein  73.48 
 
 
281 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0412  putative molybdenum utilization protein ModD  69.4 
 
 
282 aa  403  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.783583  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1707  putative molybdenum utilization protein ModD  66.9 
 
 
285 aa  389  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0448  modD protein  64.87 
 
 
334 aa  361  8e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2963  modD protein  63.8 
 
 
283 aa  353  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4264  modD protein  52.71 
 
 
281 aa  297  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1260  modD protein  47.27 
 
 
284 aa  260  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.649684  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3263  modD protein  44.8 
 
 
281 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1544  pyrophosphorylase, putative  46.91 
 
 
284 aa  258  8e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2229  modD protein  45.88 
 
 
285 aa  257  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2028  modD protein  43.73 
 
 
298 aa  245  6e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33908  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0279  modD protein  46.93 
 
 
286 aa  243  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1092  modD protein  42.65 
 
 
283 aa  242  5e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0376  modD protein  41.94 
 
 
283 aa  242  6e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0544  modD protein  41.94 
 
 
283 aa  240  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537412  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1193  modD protein  43.62 
 
 
283 aa  238  8e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1536  modD protein  41.94 
 
 
283 aa  238  8e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1475  putative molybdenum utilization protein ModD  45.88 
 
 
281 aa  235  7e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0949  modD protein  44.03 
 
 
279 aa  233  3e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000429339  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0908  modD protein  42.7 
 
 
270 aa  229  4e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.830488  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2224  modD protein  42.39 
 
 
280 aa  228  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.197416 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1726  modD protein  41.64 
 
 
290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27933  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4317  hypothetical protein  42.81 
 
 
280 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.922994 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1540  putative molybdenum utilization protein ModD  41.67 
 
 
288 aa  207  1e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13700  putative molybdenum utilization protein ModD  38.27 
 
 
279 aa  206  5e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1188  modD protein  44.57 
 
 
291 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1551  modD protein  40.86 
 
 
293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.593391  normal  0.205266 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0809  modD protein  39.85 
 
 
272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0251  molybdenum transport protein ModD  38.79 
 
 
282 aa  195  7e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0148  modD protein  41.45 
 
 
280 aa  189  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1056  modD protein  45.96 
 
 
282 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1392  ModD protein  38.46 
 
 
277 aa  186  3e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0320  molybdenum transport system protein ModD  37.17 
 
 
279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2039  modD protein  41.67 
 
 
279 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.197629  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1194  modD protein  45.85 
 
 
280 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1543  putative molybdenum utilization protein ModD  45.52 
 
 
286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3533  modD protein  46.01 
 
 
280 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1951  molybdenum transport protein ModD  33.45 
 
 
284 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0448433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5866  molybdenum transport component,pyrophosphorylase ModD  42.7 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4167  modD protein  42.64 
 
 
277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00277005  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3873  quinolinate phosphoribosyl transferase/putativemolybdenum utilization protein ModD  42.64 
 
 
277 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124116  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4318  modD protein  43.75 
 
 
287 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0022213  normal  0.0469871 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0060  modD protein  37.45 
 
 
272 aa  166  5e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.747163  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1375  ModD protein  35.14 
 
 
280 aa  163  3e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0979  modD protein  37.78 
 
 
272 aa  154  1e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  normal  0.0845492 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0259  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  33.21 
 
 
263 aa  149  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0241  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  37.22 
 
 
272 aa  140  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0821  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.34 
 
 
286 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1682  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  32.44 
 
 
274 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000108714  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1495  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.95 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.451714  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1867  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  33.33 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2352  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.34 
 
 
283 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2135  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.12 
 
 
279 aa  126  5e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0528  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.31 
 
 
270 aa  126  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0107  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  32.16 
 
 
276 aa  122  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0224  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.29 
 
 
285 aa  122  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1581  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.83 
 
 
275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1304  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)  31.37 
 
 
263 aa  119  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.424331 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1214  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.81 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00785596  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2920  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.22 
 
 
300 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2042  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.58 
 
 
283 aa  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.604691  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1555  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  31.6 
 
 
287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2354  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  31.18 
 
 
277 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02631  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  31.6 
 
 
287 aa  115  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.187748  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2452  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  32.84 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0499  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.78 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.209852  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6033  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.04 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2139  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.14 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1663  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.6 
 
 
275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.103144  unclonable  0.000000000000154791 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1549  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.52 
 
 
287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1973  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.11 
 
 
275 aa  112  5e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.795275  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1936  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.64 
 
 
276 aa  112  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.941895  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2252  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.26 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487275 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0532  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.41 
 
 
512 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.147571  normal  0.119991 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0420  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.63 
 
 
277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.640134  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0190  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  29.55 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.402278  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02171  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  30.04 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02061  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  29.17 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.857303  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0789  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  31.09 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0584588 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00640  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.56 
 
 
280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02061  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  31.85 
 
 
293 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2321  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.8 
 
 
276 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000100602  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1728  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.96 
 
 
278 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0360  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.36 
 
 
269 aa  108  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02081  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  28.41 
 
 
288 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0194041  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1432  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  31.71 
 
 
296 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0384  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.06 
 
 
279 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1184  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30 
 
 
273 aa  106  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2308  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.4 
 
 
282 aa  106  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2117  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  32.71 
 
 
289 aa  105  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.498156  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1962  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.58 
 
 
298 aa  105  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1872  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.58 
 
 
276 aa  105  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.228495  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0378  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.34 
 
 
279 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2778  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.55 
 
 
280 aa  105  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5142  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.42 
 
 
282 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0976773  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0853  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  31.27 
 
 
284 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00111019  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0685  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  26.2 
 
 
279 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.20191  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3748  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  28.78 
 
 
277 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00301149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>