More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1260 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1260  modD protein  100 
 
 		 284 aa  573  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.649684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1544  pyrophosphorylase, putative  99.65 
 
 		 284 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4264  modD protein  47.5 
 
 		 281 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0375  modD protein  49.1 
 
 		 281 aa  257  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1707  putative molybdenum utilization protein ModD  47.1 
 
 		 285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0455  modD protein  46.57 
 
 		 281 aa  251  8.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0412  putative molybdenum utilization protein ModD  45.96 
 
 		 282 aa  246  4e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.783583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2963  modD protein  44.8 
 
 		 283 aa  237  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0448  modD protein  43.88 
 
 		 334 aa  237  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0476  modD protein  46.18 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3263  modD protein  39.36 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2229  modD protein  39.08 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2224  modD protein  40.93 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.197416 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13700  putative molybdenum utilization protein ModD  38.08 
 
 		 279 aa  211  9e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0908  modD protein  38.32 
 
 		 270 aa  202  5e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.830488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0949  modD protein  35.21 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000429339  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1193  modD protein  39.44 
 
 		 283 aa  198  9e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2028  modD protein  36.97 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33908  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1726  modD protein  40.35 
 
 		 290 aa  195  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27933  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0279  modD protein  40.88 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1475  putative molybdenum utilization protein ModD  40.78 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1540  putative molybdenum utilization protein ModD  36.4 
 
 		 288 aa  186  3e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0251  molybdenum transport protein ModD  39.3 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1951  molybdenum transport protein ModD  38.16 
 
 		 284 aa  186  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448433 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1536  modD protein  34.51 
 
 		 283 aa  185  9e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1092  modD protein  34.15 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0376  modD protein  34.15 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4317  hypothetical protein  40.7 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.922994 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0544  modD protein  32.39 
 
 		 283 aa  181  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537412  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0148  modD protein  40.78 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0060  modD protein  41.58 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.747163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0809  modD protein  35.79 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1392  ModD protein  34.97 
 
 		 277 aa  171  9e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1188  modD protein  40.22 
 
 		 291 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1375  ModD protein  34.04 
 
 		 280 aa  165  6.9999999999999995e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0979  modD protein  41.94 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  normal  0.0845492 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0320  molybdenum transport system protein ModD  33.58 
 
 		 279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1551  modD protein  39.21 
 
 		 293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.593391  normal  0.205266 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1056  modD protein  41.67 
 
 		 282 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4167  modD protein  41.33 
 
 		 277 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00277005  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1194  modD protein  42.03 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5866  molybdenum transport component,pyrophosphorylase ModD  40.28 
 
 		 291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3873  quinolinate phosphoribosyl transferase/putativemolybdenum utilization protein ModD  41.33 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124116  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2039  modD protein  38.99 
 
 		 279 aa  149  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1543  putative molybdenum utilization protein ModD  41.91 
 
 		 286 aa  149  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4318  modD protein  40.65 
 
 		 287 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0022213  normal  0.0469871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3533  modD protein  43.77 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0259  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  32.01 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1682  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  30.47 
 
 		 274 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000108714  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0821  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.9 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1495  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.91 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.451714  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1973  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.18 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.795275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1867  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  29.03 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1549  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.05 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0224  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.93 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1163  quinolinate phosphoribosyl transferase  40.17 
 
 		 296 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.465501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0653  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.48 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2501  hypothetical protein  40.17 
 
 		 279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4484  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.45 
 
 		 293 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0532  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.14 
 
 		 512 aa  108  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.147571  normal  0.119991 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0360  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.94 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0170  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.86 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0946994  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4430  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.22 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.530195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0528  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.23 
 
 		 270 aa  105  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1663  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.67 
 
 		 275 aa  105  8e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.103144  unclonable  0.000000000000154791 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3748  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  28.52 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00301149  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2774  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.03 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.109833 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2248  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  30.28 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.51038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0241  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.5 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5465  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.88 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0160408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2555  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.72 
 
 		 283 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2872  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.33 
 
 		 286 aa  102  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.188879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2778  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.71 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2135  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.38 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2646  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.97 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.306201 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0499  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.87 
 
 		 276 aa  99.8  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.209852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4589  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.56 
 
 		 287 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875937  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1304  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)  30.08 
 
 		 263 aa  99.8  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.424331 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2920  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.97 
 
 		 300 aa  99.4  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1184  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  25.63 
 
 		 273 aa  99.4  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0918  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.77 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2217  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.33 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3559  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.69 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0378  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.89 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0384  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2769  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.62 
 
 		 286 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0943247  normal  0.209722 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2352  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.1 
 
 		 283 aa  95.9  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0732  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.14 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0789  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  29.6 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0584588 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0647  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.24 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.173443  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0226  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  31.56 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2530  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.92 
 
 		 283 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1146  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  24.91 
 
 		 273 aa  93.2  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1774  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.26 
 
 		 287 aa  93.2  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.318178  normal  0.636638 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1936  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.48 
 
 		 276 aa  92.8  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.941895  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1902  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.58 
 
 		 276 aa  92.8  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0439  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.77 
 
 		 296 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0936671 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2389  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  30.96 
 
 		 278 aa  92.4  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0130628  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1227  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.13 
 
 		 291 aa  92  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0701  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.48 
 
 		 299 aa  92  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>