More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0148 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0148  modD protein  100 
 
 		 280 aa  551  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3533  modD protein  62.14 
 
 		 280 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2963  modD protein  45.82 
 
 		 283 aa  229  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1475  putative molybdenum utilization protein ModD  47.62 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0279  modD protein  48.9 
 
 		 286 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0412  putative molybdenum utilization protein ModD  40.93 
 
 		 282 aa  216  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.783583  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4264  modD protein  41.89 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0448  modD protein  43.8 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0375  modD protein  42.55 
 
 		 281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1188  modD protein  48.9 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4317  hypothetical protein  47.19 
 
 		 280 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.922994 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1540  putative molybdenum utilization protein ModD  37.78 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0455  modD protein  41.54 
 
 		 281 aa  202  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1707  putative molybdenum utilization protein ModD  41.35 
 
 		 285 aa  202  5e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1056  modD protein  51.3 
 
 		 282 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5866  molybdenum transport component,pyrophosphorylase ModD  50.55 
 
 		 291 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1951  molybdenum transport protein ModD  38.35 
 
 		 284 aa  199  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448433 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1726  modD protein  40.94 
 
 		 290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27933  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0908  modD protein  39.03 
 
 		 270 aa  196  5.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.830488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4318  modD protein  50.55 
 
 		 287 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0022213  normal  0.0469871 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1543  putative molybdenum utilization protein ModD  49.25 
 
 		 286 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1260  modD protein  40.78 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.649684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1194  modD protein  49.09 
 
 		 280 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2039  modD protein  50.93 
 
 		 279 aa  192  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1544  pyrophosphorylase, putative  40.43 
 
 		 284 aa  192  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1551  modD protein  44.12 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.593391  normal  0.205266 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1193  modD protein  40.07 
 
 		 283 aa  189  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2229  modD protein  34.75 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0949  modD protein  35.25 
 
 		 279 aa  185  6e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000429339  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0251  molybdenum transport protein ModD  38.69 
 
 		 282 aa  185  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0809  modD protein  36.3 
 
 		 272 aa  185  8e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4167  modD protein  46.79 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00277005  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3873  quinolinate phosphoribosyl transferase/putativemolybdenum utilization protein ModD  47.17 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124116  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3263  modD protein  32.85 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0476  modD protein  41.45 
 
 		 284 aa  182  6e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1375  ModD protein  38.49 
 
 		 280 aa  176  5e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2028  modD protein  35.97 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33908  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13700  putative molybdenum utilization protein ModD  34.29 
 
 		 279 aa  169  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0376  modD protein  35.16 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2224  modD protein  36.92 
 
 		 280 aa  165  6.9999999999999995e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.197416 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1536  modD protein  34.43 
 
 		 283 aa  162  7e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1392  ModD protein  35.56 
 
 		 277 aa  161  9e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0544  modD protein  30.94 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537412  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1092  modD protein  34.43 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0060  modD protein  38.1 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.747163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0320  molybdenum transport system protein ModD  32.09 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0979  modD protein  38.1 
 
 		 272 aa  142  7e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  normal  0.0845492 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0259  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  31.48 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2501  hypothetical protein  36.8 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1163  quinolinate phosphoribosyl transferase  39.2 
 
 		 296 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.465501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0420  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30 
 
 		 277 aa  118  9e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.640134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3559  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  36.68 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1304  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)  30.5 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.424331 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03770  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.45 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.797923  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11612  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.55 
 
 		 285 aa  109  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.588375  normal  0.382236 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1549  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.79 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1382  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.36 
 
 		 285 aa  106  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00040191  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1475  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  29.35 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137856 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0647  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  25.75 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.173443  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0384  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.82 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0653  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.88 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2964  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.16 
 
 		 301 aa  105  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1192  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  28.36 
 
 		 286 aa  105  7e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.672764  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0224  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.14 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3748  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  30.4 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00301149  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00640  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.25 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0378  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.97 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0348  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.07 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1682  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  29.06 
 
 		 274 aa  102  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000108714  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1867  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  28.74 
 
 		 275 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0732  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.63 
 
 		 289 aa  99.4  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1577  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.03 
 
 		 275 aa  99.4  6e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1902  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.6 
 
 		 276 aa  99  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5142  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.28 
 
 		 282 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0976773  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0165  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.35 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.844923  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6033  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.46 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1163  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.24 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0699737  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2135  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.12 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0853  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  32.81 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00111019  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1663  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.6 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.103144  unclonable  0.000000000000154791 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02631  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  27.34 
 
 		 287 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.187748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4484  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.36 
 
 		 293 aa  96.3  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3617  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.36 
 
 		 287 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1555  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  26.97 
 
 		 287 aa  96.3  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1237  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.42 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0685  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  25.59 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.20191  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2558  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.33 
 
 		 309 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0983562  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2800  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.68 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0914  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  22.39 
 
 		 288 aa  94  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27531  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  31.11 
 
 		 297 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1181  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.87 
 
 		 283 aa  93.6  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0786  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.79 
 
 		 281 aa  93.2  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58700  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.5 
 
 		 282 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229559  normal  0.604344 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0241  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.14 
 
 		 272 aa  93.2  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2293  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  26.48 
 
 		 291 aa  93.2  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.826935  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2139  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.17 
 
 		 291 aa  92.4  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0821  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.46 
 
 		 286 aa  92  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4407  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.99 
 
 		 282 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.269973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0952  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.64 
 
 		 279 aa  92  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12110  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.6 
 
 		 282 aa  91.3  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>