More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1543 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1543  putative molybdenum utilization protein ModD  100 
 
 
286 aa  552  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1475  putative molybdenum utilization protein ModD  54.29 
 
 
281 aa  262  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4317  hypothetical protein  54.12 
 
 
280 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.922994 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0279  modD protein  48.57 
 
 
286 aa  238  8e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2039  modD protein  54.15 
 
 
279 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.197629  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0412  putative molybdenum utilization protein ModD  44.17 
 
 
282 aa  229  5e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.783583  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1707  putative molybdenum utilization protein ModD  45.16 
 
 
285 aa  228  6e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0375  modD protein  45.74 
 
 
281 aa  227  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2963  modD protein  46.81 
 
 
283 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0455  modD protein  44.68 
 
 
281 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0148  modD protein  52.04 
 
 
280 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1188  modD protein  51.25 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4167  modD protein  53.38 
 
 
277 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00277005  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1194  modD protein  54.1 
 
 
280 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1551  modD protein  49.12 
 
 
293 aa  209  6e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.593391  normal  0.205266 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0448  modD protein  43.46 
 
 
334 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1056  modD protein  52.33 
 
 
282 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3873  quinolinate phosphoribosyl transferase/putativemolybdenum utilization protein ModD  53.76 
 
 
277 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124116  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4264  modD protein  39.64 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0908  modD protein  39.78 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.830488  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0476  modD protein  44.56 
 
 
284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4318  modD protein  53.31 
 
 
287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0022213  normal  0.0469871 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0809  modD protein  36.73 
 
 
272 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0544  modD protein  35.56 
 
 
283 aa  196  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537412  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1726  modD protein  42.55 
 
 
290 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27933  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3263  modD protein  34.88 
 
 
281 aa  195  8.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3533  modD protein  54.84 
 
 
280 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5866  molybdenum transport component,pyrophosphorylase ModD  50.71 
 
 
291 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1540  putative molybdenum utilization protein ModD  36 
 
 
288 aa  185  6e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1260  modD protein  43.84 
 
 
284 aa  185  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.649684  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1544  pyrophosphorylase, putative  43.48 
 
 
284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2224  modD protein  40.21 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.197416 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2028  modD protein  38.1 
 
 
298 aa  181  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33908  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1092  modD protein  35.56 
 
 
283 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0376  modD protein  35.21 
 
 
283 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13700  putative molybdenum utilization protein ModD  38.46 
 
 
279 aa  179  4.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1193  modD protein  38.25 
 
 
283 aa  176  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1536  modD protein  34.86 
 
 
283 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2229  modD protein  35.06 
 
 
285 aa  175  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1951  molybdenum transport protein ModD  37.05 
 
 
284 aa  172  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0448433 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0251  molybdenum transport protein ModD  38.13 
 
 
282 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0320  molybdenum transport system protein ModD  32.84 
 
 
279 aa  160  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0949  modD protein  30.66 
 
 
279 aa  151  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000429339  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1392  ModD protein  33.45 
 
 
277 aa  143  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0060  modD protein  41.48 
 
 
272 aa  142  8e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.747163  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0979  modD protein  40.66 
 
 
272 aa  137  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  normal  0.0845492 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1375  ModD protein  30.22 
 
 
280 aa  136  4e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0259  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  31.48 
 
 
263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1163  quinolinate phosphoribosyl transferase  39.93 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.465501  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2501  hypothetical protein  39.58 
 
 
279 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0821  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.94 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2352  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.71 
 
 
283 aa  112  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0499  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.25 
 
 
276 aa  112  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.209852  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1973  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.85 
 
 
275 aa  103  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.795275  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0224  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.76 
 
 
285 aa  99.4  7e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0532  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  36.05 
 
 
512 aa  98.6  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.147571  normal  0.119991 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03770  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.46 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.797923  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1663  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.6 
 
 
275 aa  92  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.103144  unclonable  0.000000000000154791 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2778  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.15 
 
 
280 aa  91.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1867  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  25.79 
 
 
275 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1304  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)  26.2 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.424331 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1682  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  26.2 
 
 
274 aa  90.9  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000108714  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0420  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.3 
 
 
277 aa  89.4  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.640134  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0360  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.34 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0217  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  36.81 
 
 
304 aa  87  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02081  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  25.28 
 
 
288 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0194041  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1962  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.99 
 
 
298 aa  87  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1214  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  25.46 
 
 
278 aa  86.7  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00785596  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02061  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  25.93 
 
 
288 aa  86.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.857303  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4484  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.83 
 
 
293 aa  85.9  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1988  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  29.12 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.103319  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0789  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  33.2 
 
 
282 aa  84  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0584588 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2452  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  32.7 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0653  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.29 
 
 
275 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1902  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.02 
 
 
276 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3748  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  28.95 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00301149  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1549  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.55 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36541  Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating] (Quinolinate phosphoribosyltransferase [decarboxylating]) (QAPRTase)  28.52 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0419374 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3164  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  36.79 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00339828  hitchhiker  0.00016604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4098  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  39.24 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0786  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.56 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0528  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.63 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1237  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.24 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6033  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.58 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0190  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  24.81 
 
 
288 aa  79  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.402278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0688  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  25.28 
 
 
277 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139091  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0752  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.25 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02171  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  26.58 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0914  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  19.47 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2134  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.96 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00345657  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0241  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.33 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0193  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.34 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2321  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.46 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000100602  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1936  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.58 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.941895  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1495  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.74 
 
 
271 aa  77  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.451714  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0107  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  26.62 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2558  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.03 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0983562  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2293  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  32.1 
 
 
291 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.826935  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2566  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.89 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0647  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  25 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.173443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>