More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0908 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0908  modD protein  100 
 
 
270 aa  557  1e-158  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.830488  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1193  modD protein  74.35 
 
 
283 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3263  modD protein  44.91 
 
 
281 aa  238  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0412  putative molybdenum utilization protein ModD  43.45 
 
 
282 aa  230  2e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.783583  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2229  modD protein  42.01 
 
 
285 aa  229  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4264  modD protein  42.64 
 
 
281 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1707  putative molybdenum utilization protein ModD  41.79 
 
 
285 aa  227  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0448  modD protein  39.26 
 
 
334 aa  217  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1092  modD protein  37.78 
 
 
283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0544  modD protein  37.78 
 
 
283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537412  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0375  modD protein  40.3 
 
 
281 aa  211  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0376  modD protein  36.67 
 
 
283 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2224  modD protein  39.26 
 
 
280 aa  209  5e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.197416 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1536  modD protein  37.41 
 
 
283 aa  209  6e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1540  putative molybdenum utilization protein ModD  37.55 
 
 
288 aa  206  4e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0455  modD protein  39.33 
 
 
281 aa  206  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1260  modD protein  38.32 
 
 
284 aa  202  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.649684  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0476  modD protein  42.7 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1544  pyrophosphorylase, putative  37.96 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4317  hypothetical protein  40 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.922994 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13700  putative molybdenum utilization protein ModD  37.74 
 
 
279 aa  198  7e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0279  modD protein  41.2 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0949  modD protein  36.57 
 
 
279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000429339  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1726  modD protein  38.1 
 
 
290 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27933  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2963  modD protein  38.52 
 
 
283 aa  195  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2028  modD protein  37.02 
 
 
298 aa  192  6e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33908  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1475  putative molybdenum utilization protein ModD  37.5 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0809  modD protein  36.33 
 
 
272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0148  modD protein  39.03 
 
 
280 aa  178  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4167  modD protein  41.13 
 
 
277 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00277005  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2039  modD protein  40.52 
 
 
279 aa  170  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.197629  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3873  quinolinate phosphoribosyl transferase/putativemolybdenum utilization protein ModD  41.13 
 
 
277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124116  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1375  ModD protein  33.59 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1392  ModD protein  35.29 
 
 
277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1543  putative molybdenum utilization protein ModD  39.85 
 
 
286 aa  166  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1867  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  36.4 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1551  modD protein  36.94 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.593391  normal  0.205266 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0251  molybdenum transport protein ModD  34.43 
 
 
282 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0060  modD protein  35.5 
 
 
272 aa  157  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.747163  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1188  modD protein  38.66 
 
 
291 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1056  modD protein  39.41 
 
 
282 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0979  modD protein  35.5 
 
 
272 aa  153  4e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  normal  0.0845492 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1951  molybdenum transport protein ModD  31.72 
 
 
284 aa  149  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0448433 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0320  molybdenum transport system protein ModD  31.4 
 
 
279 aa  146  3e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5866  molybdenum transport component,pyrophosphorylase ModD  37.82 
 
 
291 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1682  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  33.33 
 
 
274 aa  142  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000108714  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1194  modD protein  36.8 
 
 
280 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4318  modD protein  38.2 
 
 
287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0022213  normal  0.0469871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3533  modD protein  40.98 
 
 
280 aa  135  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2530  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.46 
 
 
283 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0241  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.58 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0821  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.73 
 
 
286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0224  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.7 
 
 
285 aa  127  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2354  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  33.33 
 
 
277 aa  124  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0918  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.48 
 
 
276 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1549  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.96 
 
 
287 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2252  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.21 
 
 
278 aa  121  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487275 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1973  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.85 
 
 
275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.795275  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0499  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.76 
 
 
276 aa  119  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.209852  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2501  hypothetical protein  37.55 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1163  quinolinate phosphoribosyl transferase  37.55 
 
 
296 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.465501  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1184  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.25 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1237  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.71 
 
 
272 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1316  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.13 
 
 
275 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000271836  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0360  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.4 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0259  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  27.14 
 
 
263 aa  112  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0107  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  30.26 
 
 
276 aa  112  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1495  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.42 
 
 
271 aa  112  7.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.451714  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0420  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.87 
 
 
277 aa  112  9e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.640134  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1146  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.23 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2352  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.6 
 
 
283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1755  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.44 
 
 
282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.828891  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1214  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.32 
 
 
278 aa  109  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00785596  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4813  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.76 
 
 
298 aa  108  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1872  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.83 
 
 
276 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.228495  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3574  quinolinate phosphoribosyltransferase  32.68 
 
 
296 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.59167  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0165  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.41 
 
 
285 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.844923  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4484  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.08 
 
 
293 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0532  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.24 
 
 
512 aa  107  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.147571  normal  0.119991 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0667  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.63 
 
 
296 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3760  quinolinate phosphoribosyltransferase  32.94 
 
 
296 aa  106  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0653  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.88 
 
 
275 aa  106  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0688  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30 
 
 
277 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139091  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2321  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.04 
 
 
276 aa  105  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000100602  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0378  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.28 
 
 
279 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1728  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.37 
 
 
278 aa  105  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1663  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.37 
 
 
275 aa  104  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.103144  unclonable  0.000000000000154791 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4275  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.4 
 
 
277 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00530788  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1955  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.59 
 
 
292 aa  104  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5142  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.08 
 
 
282 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0976773  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2139  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.57 
 
 
291 aa  104  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1050  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.66 
 
 
277 aa  104  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000815548  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1962  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30 
 
 
298 aa  104  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3559  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.27 
 
 
291 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2769  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.56 
 
 
286 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0943247  normal  0.209722 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1902  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.67 
 
 
276 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02631  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  28.67 
 
 
287 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.187748  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1555  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  28.67 
 
 
287 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4589  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.5 
 
 
287 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875937  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2872  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.15 
 
 
286 aa  102  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.188879  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>