More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0251 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0251  molybdenum transport protein ModD  100 
 
 
282 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1951  molybdenum transport protein ModD  55.36 
 
 
284 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0448433 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0412  putative molybdenum utilization protein ModD  40.71 
 
 
282 aa  210  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.783583  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0375  modD protein  40.57 
 
 
281 aa  210  3e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0448  modD protein  41.94 
 
 
334 aa  207  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2963  modD protein  40.86 
 
 
283 aa  205  8e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0455  modD protein  38.08 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1707  putative molybdenum utilization protein ModD  40.58 
 
 
285 aa  199  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4317  hypothetical protein  41.28 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.922994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1551  modD protein  41.94 
 
 
293 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.593391  normal  0.205266 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1726  modD protein  39.3 
 
 
290 aa  189  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27933  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3263  modD protein  33.81 
 
 
281 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1260  modD protein  39.3 
 
 
284 aa  186  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.649684  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4264  modD protein  37.99 
 
 
281 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1544  pyrophosphorylase, putative  38.95 
 
 
284 aa  185  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0949  modD protein  34.98 
 
 
279 aa  185  7e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000429339  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2039  modD protein  42.91 
 
 
279 aa  185  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.197629  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0809  modD protein  36.33 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1475  putative molybdenum utilization protein ModD  39.07 
 
 
281 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0279  modD protein  37.18 
 
 
286 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0476  modD protein  38.79 
 
 
284 aa  177  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0148  modD protein  38.69 
 
 
280 aa  175  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1540  putative molybdenum utilization protein ModD  31.67 
 
 
288 aa  169  4e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4167  modD protein  40.23 
 
 
277 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00277005  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3873  quinolinate phosphoribosyl transferase/putativemolybdenum utilization protein ModD  39.85 
 
 
277 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124116  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1092  modD protein  31.07 
 
 
283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2229  modD protein  31.67 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0376  modD protein  31.43 
 
 
283 aa  163  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2224  modD protein  34.52 
 
 
280 aa  162  6e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.197416 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0908  modD protein  34.43 
 
 
270 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.830488  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1536  modD protein  30.71 
 
 
283 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3533  modD protein  41.16 
 
 
280 aa  159  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1375  ModD protein  33.45 
 
 
280 aa  157  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1188  modD protein  38.15 
 
 
291 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0544  modD protein  29.29 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537412  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2028  modD protein  33.33 
 
 
298 aa  152  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33908  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1193  modD protein  34.8 
 
 
283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13700  putative molybdenum utilization protein ModD  33.09 
 
 
279 aa  151  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4318  modD protein  38.55 
 
 
287 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0022213  normal  0.0469871 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1056  modD protein  39.18 
 
 
282 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1392  ModD protein  31.27 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0320  molybdenum transport system protein ModD  30.86 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5866  molybdenum transport component,pyrophosphorylase ModD  38.08 
 
 
291 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1194  modD protein  37.73 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0060  modD protein  34.91 
 
 
272 aa  137  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.747163  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1543  putative molybdenum utilization protein ModD  36.84 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0979  modD protein  34.66 
 
 
272 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  normal  0.0845492 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2501  hypothetical protein  33.69 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1163  quinolinate phosphoribosyl transferase  33.33 
 
 
296 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.465501  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4256  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.14 
 
 
282 aa  118  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000510657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4217  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.14 
 
 
282 aa  118  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1902  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.72 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1213  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.02 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2321  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.01 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000100602  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0653  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.21 
 
 
275 aa  112  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2134  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.71 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00345657  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2135  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.96 
 
 
279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2452  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  34.09 
 
 
279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0259  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  30.48 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1872  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.25 
 
 
276 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.228495  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1495  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.93 
 
 
271 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.451714  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1936  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.18 
 
 
276 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.941895  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1988  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  31.43 
 
 
276 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.103319  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11612  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.68 
 
 
285 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.588375  normal  0.382236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1774  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.32 
 
 
287 aa  106  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.318178  normal  0.636638 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0951  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.96 
 
 
282 aa  104  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1214  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.71 
 
 
278 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00785596  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3748  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  28.93 
 
 
277 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00301149  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1682  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  25 
 
 
274 aa  103  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000108714  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0194  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.14 
 
 
296 aa  102  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2818  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.07 
 
 
276 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000688675  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2252  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.63 
 
 
278 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487275 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0918  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.09 
 
 
276 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0224  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.96 
 
 
285 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0107  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  30.45 
 
 
276 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2248  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  31.34 
 
 
282 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.51038  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4484  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.44 
 
 
293 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2354  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  27.76 
 
 
277 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1867  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  25.86 
 
 
275 aa  99.4  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1316  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.41 
 
 
275 aa  98.6  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000271836  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2530  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.43 
 
 
283 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0384  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  25 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0378  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  24.62 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1962  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.95 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4275  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.41 
 
 
277 aa  96.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00530788  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1382  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.27 
 
 
285 aa  96.3  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00040191  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3136  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.92 
 
 
287 aa  95.9  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263923  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0082  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.35 
 
 
291 aa  95.9  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0786  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.88 
 
 
281 aa  95.9  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2190  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.94 
 
 
292 aa  95.9  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.989593  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0420  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  25.98 
 
 
277 aa  95.5  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.640134  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10850  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)  31.65 
 
 
290 aa  94.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.199467  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00640  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.43 
 
 
280 aa  95.1  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1549  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.45 
 
 
287 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0528  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.68 
 
 
270 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4352  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.32 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.889346  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2012  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.89 
 
 
287 aa  94.7  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2217  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.07 
 
 
285 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0688  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  26.49 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139091  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1972  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.93 
 
 
274 aa  93.6  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>