More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4167 on replicon NC_009040
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009040  Rsph17029_4167  modD protein  100 
 
 		 277 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00277005  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3873  quinolinate phosphoribosyl transferase/putativemolybdenum utilization protein ModD  98.92 
 
 		 277 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124116  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4317  hypothetical protein  69.45 
 
 		 280 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.922994 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0279  modD protein  52.69 
 
 		 286 aa  238  5.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1475  putative molybdenum utilization protein ModD  51.26 
 
 		 281 aa  236  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1188  modD protein  56.6 
 
 		 291 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1194  modD protein  58.21 
 
 		 280 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1551  modD protein  53.48 
 
 		 293 aa  229  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.593391  normal  0.205266 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1056  modD protein  56.72 
 
 		 282 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4318  modD protein  57.84 
 
 		 287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0022213  normal  0.0469871 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2039  modD protein  48.93 
 
 		 279 aa  215  7e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5866  molybdenum transport component,pyrophosphorylase ModD  55.96 
 
 		 291 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0375  modD protein  42.55 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1543  putative molybdenum utilization protein ModD  52.26 
 
 		 286 aa  203  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0455  modD protein  40.36 
 
 		 281 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1707  putative molybdenum utilization protein ModD  41.09 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0908  modD protein  41.2 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.830488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1193  modD protein  43.42 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0412  putative molybdenum utilization protein ModD  40.65 
 
 		 282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.783583  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0448  modD protein  41.88 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4264  modD protein  38.49 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2963  modD protein  42.24 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0251  molybdenum transport protein ModD  40 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1726  modD protein  43.27 
 
 		 290 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27933  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0148  modD protein  47.21 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3263  modD protein  36.56 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1540  putative molybdenum utilization protein ModD  35.42 
 
 		 288 aa  178  9e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1260  modD protein  41.61 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.649684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1951  molybdenum transport protein ModD  35.59 
 
 		 284 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448433 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0476  modD protein  41.67 
 
 		 284 aa  176  5e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1544  pyrophosphorylase, putative  41.24 
 
 		 284 aa  175  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2229  modD protein  35.71 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13700  putative molybdenum utilization protein ModD  38.13 
 
 		 279 aa  168  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0949  modD protein  32.5 
 
 		 279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000429339  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2028  modD protein  37.78 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33908  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2224  modD protein  38.93 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.197416 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0060  modD protein  43.75 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.747163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3533  modD protein  49.81 
 
 		 280 aa  158  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2501  hypothetical protein  42.6 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1163  quinolinate phosphoribosyl transferase  42.6 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.465501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0809  modD protein  32.22 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0979  modD protein  42.8 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  normal  0.0845492 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1392  ModD protein  34.42 
 
 		 277 aa  152  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0544  modD protein  31.54 
 
 		 283 aa  152  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537412  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1375  ModD protein  33.45 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1536  modD protein  34.41 
 
 		 283 aa  149  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1092  modD protein  34.05 
 
 		 283 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0376  modD protein  33.33 
 
 		 283 aa  148  7e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0320  molybdenum transport system protein ModD  30.22 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1867  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  31.08 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0259  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  31.06 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1316  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.26 
 
 		 275 aa  122  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000271836  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1988  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  35.4 
 
 		 276 aa  122  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.103319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0241  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.99 
 
 		 272 aa  122  9e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1755  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  38.36 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.828891  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00640  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0653  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.64 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1936  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.46 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.941895  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2321  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.48 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000100602  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2134  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.92 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00345657  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1902  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.48 
 
 		 276 aa  116  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0378  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.81 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2646  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  37.98 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250858  normal  0.306201 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0821  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.97 
 
 		 286 aa  112  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0384  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.81 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1495  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.16 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.451714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1663  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.2 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.103144  unclonable  0.000000000000154791 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0107  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  32.09 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1214  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.6 
 
 		 278 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00785596  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2872  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  37.98 
 
 		 286 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.188879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0431  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.06 
 
 		 285 aa  112  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302379  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1181  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  37.83 
 
 		 283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4589  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  40.39 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875937  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1541  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  38.11 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1973  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.14 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.795275  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2352  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.39 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0420  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  27.11 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.640134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1872  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.21 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.228495  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0732  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  37.13 
 
 		 289 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2769  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  38.04 
 
 		 286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0943247  normal  0.209722 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3748  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  33.33 
 
 		 277 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00301149  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1427  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  39.3 
 
 		 284 aa  108  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0499  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.21 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.209852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3136  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.74 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1549  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.33 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1304  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)  29.92 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.424331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5465  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  38.28 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0160408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0634  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  33.47 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.888939 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1728  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.73 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0224  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.41 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2774  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  37.5 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.109833 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2354  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  29.41 
 
 		 277 aa  105  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4340  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  36.9 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  0.0824992 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2555  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.85 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0439  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.71 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0936671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0170  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  37.74 
 
 		 287 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0946994  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1972  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.33 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0297  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  39.19 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0602  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.07 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.649104  normal  0.735332 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2252  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.1 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>