More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_13700 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_13700  putative molybdenum utilization protein ModD  100 
 
 		 279 aa  574  1.0000000000000001e-163  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2224  modD protein  68.98 
 
 		 280 aa  402  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.197416 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2229  modD protein  46.57 
 
 		 285 aa  275  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3263  modD protein  44.77 
 
 		 281 aa  264  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4264  modD protein  42.24 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1707  putative molybdenum utilization protein ModD  43.17 
 
 		 285 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0412  putative molybdenum utilization protein ModD  41.52 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.783583  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0448  modD protein  41.7 
 
 		 334 aa  223  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0455  modD protein  41.18 
 
 		 281 aa  222  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0375  modD protein  41.03 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1260  modD protein  38.08 
 
 		 284 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.649684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1544  pyrophosphorylase, putative  37.72 
 
 		 284 aa  210  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2963  modD protein  39.27 
 
 		 283 aa  205  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0908  modD protein  37.74 
 
 		 270 aa  198  7e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.830488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1540  putative molybdenum utilization protein ModD  36.8 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1193  modD protein  38.08 
 
 		 283 aa  188  9e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1726  modD protein  37.46 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27933  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0279  modD protein  38.49 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0476  modD protein  38.41 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0949  modD protein  34.07 
 
 		 279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000429339  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1392  ModD protein  38.01 
 
 		 277 aa  179  4e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0376  modD protein  34.31 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2028  modD protein  34.8 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33908  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1475  putative molybdenum utilization protein ModD  37.99 
 
 		 281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0544  modD protein  34.07 
 
 		 283 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537412  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1536  modD protein  33.94 
 
 		 283 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1375  ModD protein  34.07 
 
 		 280 aa  168  7e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1092  modD protein  32.85 
 
 		 283 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0320  molybdenum transport system protein ModD  36.36 
 
 		 279 aa  166  4e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1188  modD protein  41.97 
 
 		 291 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0809  modD protein  32.45 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5866  molybdenum transport component,pyrophosphorylase ModD  39.29 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4317  hypothetical protein  37.18 
 
 		 280 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.922994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1551  modD protein  33.81 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.593391  normal  0.205266 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0148  modD protein  34.29 
 
 		 280 aa  152  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0251  molybdenum transport protein ModD  33.09 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0060  modD protein  35.04 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.747163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1194  modD protein  39.56 
 
 		 280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1951  molybdenum transport protein ModD  30.58 
 
 		 284 aa  146  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448433 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1056  modD protein  39.05 
 
 		 282 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4167  modD protein  38.64 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00277005  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1543  putative molybdenum utilization protein ModD  34.09 
 
 		 286 aa  142  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3873  quinolinate phosphoribosyl transferase/putativemolybdenum utilization protein ModD  38.64 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124116  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0979  modD protein  34.3 
 
 		 272 aa  135  5e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  normal  0.0845492 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0259  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  32.1 
 
 		 263 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4318  modD protein  37.64 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0022213  normal  0.0469871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3533  modD protein  36.36 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2039  modD protein  35.27 
 
 		 279 aa  122  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0360  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31 
 
 		 269 aa  122  8e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1867  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  29.68 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1555  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  29.89 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03770  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.6 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.797923  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2135  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.82 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1682  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  28.06 
 
 		 274 aa  116  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000108714  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02631  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  29.54 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.187748  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1973  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.76 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.795275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1304  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)  31.58 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.424331 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0821  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.43 
 
 		 286 aa  112  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2352  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.8 
 
 		 283 aa  112  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1902  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.16 
 
 		 276 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1495  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.451714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2452  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  30.29 
 
 		 279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2321  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.54 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000100602  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0224  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.36 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0653  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.94 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1872  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.68 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.228495  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1549  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.37 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4484  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.6 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0463  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  32.97 
 
 		 300 aa  105  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0431  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.69 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302379  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1198  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.15 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.963404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0133  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.82 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.539491  normal  0.0277976 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00640  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.48 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0241  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.5 
 
 		 272 aa  102  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2354  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  29.5 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0107  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  28.99 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1316  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.78 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000271836  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02061  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  25.36 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.857303  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1163  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.27 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2415  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.18 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02171  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  25.95 
 
 		 288 aa  99.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1541  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.11 
 
 		 293 aa  99.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  32.33 
 
 		 847 aa  99.8  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4755  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.14 
 
 		 282 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196687  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0528  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.64 
 
 		 270 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27531  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  30.88 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0190  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  25.89 
 
 		 288 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.402278  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3559  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.46 
 
 		 291 aa  99.4  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4352  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.42 
 
 		 290 aa  99.4  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.889346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2217  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.17 
 
 		 285 aa  98.6  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1005  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.88 
 
 		 289 aa  99  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.257167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0668  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.66 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2774  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.07 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.109833 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2558  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.21 
 
 		 309 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0983562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2252  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.43 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487275 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2800  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.73 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5167  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.82 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0814  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  30.94 
 
 		 281 aa  97.8  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0234  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.6 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0165  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.2 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.844923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>