More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3533 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3533  modD protein  100 
 
 		 280 aa  529  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0148  modD protein  62.14 
 
 		 280 aa  302  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.42259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0448  modD protein  49.45 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1475  putative molybdenum utilization protein ModD  51.93 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2963  modD protein  49.27 
 
 		 283 aa  235  7e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0412  putative molybdenum utilization protein ModD  47.99 
 
 		 282 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.783583  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1707  putative molybdenum utilization protein ModD  46.57 
 
 		 285 aa  229  3e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0455  modD protein  47.78 
 
 		 281 aa  230  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0375  modD protein  47.27 
 
 		 281 aa  228  6e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0279  modD protein  50.91 
 
 		 286 aa  228  7e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1551  modD protein  52.35 
 
 		 293 aa  219  5e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.593391  normal  0.205266 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1726  modD protein  44.21 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.27933  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1188  modD protein  54.07 
 
 		 291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1540  putative molybdenum utilization protein ModD  38.29 
 
 		 288 aa  209  3e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1543  putative molybdenum utilization protein ModD  53.73 
 
 		 286 aa  208  9e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4264  modD protein  40.88 
 
 		 281 aa  208  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2039  modD protein  51.27 
 
 		 279 aa  206  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4317  hypothetical protein  47.91 
 
 		 280 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.922994 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0476  modD protein  47.65 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1194  modD protein  55.56 
 
 		 280 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3263  modD protein  37.77 
 
 		 281 aa  202  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5866  molybdenum transport component,pyrophosphorylase ModD  54.55 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0251  molybdenum transport protein ModD  41.16 
 
 		 282 aa  198  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1056  modD protein  54.58 
 
 		 282 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0809  modD protein  37.83 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4318  modD protein  54.95 
 
 		 287 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0022213  normal  0.0469871 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1260  modD protein  43.77 
 
 		 284 aa  193  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.649684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1544  pyrophosphorylase, putative  43.42 
 
 		 284 aa  192  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2229  modD protein  39.57 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4167  modD protein  51.13 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00277005  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0908  modD protein  41.35 
 
 		 270 aa  189  4e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.830488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1092  modD protein  36.92 
 
 		 283 aa  188  7e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3873  quinolinate phosphoribosyl transferase/putativemolybdenum utilization protein ModD  51.5 
 
 		 277 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124116  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0544  modD protein  34.77 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537412  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2224  modD protein  41.09 
 
 		 280 aa  182  8.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.197416 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1193  modD protein  41.01 
 
 		 283 aa  179  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17865 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13700  putative molybdenum utilization protein ModD  37.09 
 
 		 279 aa  179  4e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0376  modD protein  36.79 
 
 		 283 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0949  modD protein  35.25 
 
 		 279 aa  178  8e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000429339  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1536  modD protein  35.84 
 
 		 283 aa  178  9e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.515796  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1951  molybdenum transport protein ModD  37.5 
 
 		 284 aa  176  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448433 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2028  modD protein  36.79 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33908  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1375  ModD protein  34.78 
 
 		 280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1392  ModD protein  34.91 
 
 		 277 aa  158  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0060  modD protein  39.77 
 
 		 272 aa  142  6e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.747163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0320  molybdenum transport system protein ModD  29.7 
 
 		 279 aa  139  6e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0979  modD protein  39.7 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  normal  0.0845492 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0259  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  30.63 
 
 		 263 aa  123  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2501  hypothetical protein  43.2 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1163  quinolinate phosphoribosyl transferase  42.8 
 
 		 296 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.465501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0821  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.07 
 
 		 286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0786  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.07 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1304  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)  30.74 
 
 		 263 aa  106  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.424331 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2800  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  36.12 
 
 		 285 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2135  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.23 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00640  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.23 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1495  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.58 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.451714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0853  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  35.16 
 
 		 284 aa  102  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00111019  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0217  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.85 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2778  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.14 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11612  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.32 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.588375  normal  0.382236 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0653  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.52 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3748  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  29.71 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00301149  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3617  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  34.98 
 
 		 287 aa  99  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142575  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1973  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.53 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.795275  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4407  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.78 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.269973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2452  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  33.71 
 
 		 279 aa  98.6  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0499  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.2 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.209852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0043  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  24.45 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.541216  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1663  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.37 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.103144  unclonable  0.000000000000154791 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1962  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.42 
 
 		 298 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1902  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.65 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5142  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.45 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0976773  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2558  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.29 
 
 		 309 aa  96.7  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0983562  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0602  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.64 
 
 		 286 aa  96.3  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.649104  normal  0.735332 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12110  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.75 
 
 		 282 aa  95.9  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3559  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  36.29 
 
 		 291 aa  95.9  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03770  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.33 
 
 		 307 aa  95.5  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.797923  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0634  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  32.03 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.888939 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1988  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  31.52 
 
 		 276 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.103319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02081  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  24.81 
 
 		 288 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0194041  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4589  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  37.31 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875937  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3435  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.88 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128506  normal  0.402549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1867  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  27.73 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0785  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.8 
 
 		 282 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8380  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  36.65 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02171  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  25.29 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02061  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase:quinolinate phosphoriobsyl transferase  24.43 
 
 		 288 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.857303  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0107  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  27.6 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0821  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.98 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0371  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  29.13 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.398309  hitchhiker  0.000104956 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0810  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.98 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.182646  normal  0.0443803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58700  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  31.05 
 
 		 282 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229559  normal  0.604344 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0463  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  33.98 
 
 		 300 aa  93.2  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0787  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.59 
 
 		 282 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1872  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  30.18 
 
 		 276 aa  92.8  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.228495  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0789  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  33.33 
 
 		 282 aa  93.2  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0584588 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1936  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  32.03 
 
 		 276 aa  92.8  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.941895  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0224  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  28.52 
 
 		 285 aa  92.4  7e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2252  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  33.45 
 
 		 278 aa  92.4  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>