More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0138 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  100 
 
 		 463 aa  900    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4207  Leucyl aminopeptidase  56.32 
 
 		 460 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.72513  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0294  peptidase M17, leucyl aminopeptidase  56.51 
 
 		 462 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7039  leucine aminopeptidase  57.72 
 
 		 442 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1858  Leucyl aminopeptidase  54 
 
 		 461 aa  460  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2181  cytosol aminopeptidase family protein  55.87 
 
 		 460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1777  leucyl aminopeptidase  55.91 
 
 		 460 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356947  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2093  cytosol aminopeptidase family protein  55.87 
 
 		 460 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0979393  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0242  leucyl aminopeptidase  56.25 
 
 		 458 aa  451  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0148  Leucyl aminopeptidase  54.27 
 
 		 476 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0292  leucine aminopeptidase  52.78 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144461  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4196  Leucyl aminopeptidase  52.32 
 
 		 463 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1080  Leucyl aminopeptidase  53.68 
 
 		 463 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2559  hypothetical protein  48.48 
 
 		 454 aa  439  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4484  Leucyl aminopeptidase  52.34 
 
 		 463 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0384  leucyl aminopeptidase  56.19 
 
 		 460 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2687  hypothetical protein  48.05 
 
 		 454 aa  436  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1491  cytosol aminopeptidase  50.55 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0730  leucyl aminopeptidase  54.13 
 
 		 460 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3720  leucyl aminopeptidase  56.11 
 
 		 460 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3188  leucyl aminopeptidase  48.92 
 
 		 453 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0686  cytosol aminopeptidase family protein  50.33 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3359  leucyl aminopeptidase  52 
 
 		 465 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3527  leucyl aminopeptidase  56.86 
 
 		 459 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0722387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1677  leucyl aminopeptidase  50.44 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0281  leucyl aminopeptidase  56.1 
 
 		 455 aa  428  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1488  leucyl aminopeptidase  48.81 
 
 		 453 aa  424  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3582  leucyl aminopeptidase  56.19 
 
 		 466 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369762  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3040  leucyl aminopeptidase  56.31 
 
 		 491 aa  421  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1264  cytosol aminopeptidase family protein  48.49 
 
 		 465 aa  419  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1126  Leucyl aminopeptidase  56.13 
 
 		 491 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150295 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3455  leucyl aminopeptidase  52.43 
 
 		 472 aa  416  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3953  peptidase M17, leucyl aminopeptidase-like  53.65 
 
 		 455 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4585  leucyl aminopeptidase  50 
 
 		 473 aa  415  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2759  leucyl aminopeptidase  47.39 
 
 		 453 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.168747  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2976  leucyl aminopeptidase  54.9 
 
 		 469 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.32018 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0261  Leucyl aminopeptidase  52.22 
 
 		 455 aa  412  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.614863 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02867  leucine aminopeptidase  51.66 
 
 		 456 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2707  leucyl aminopeptidase  54.19 
 
 		 467 aa  411  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4956  cytosol aminopeptidase family protein  47.53 
 
 		 453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3202  Leucyl aminopeptidase  54.47 
 
 		 469 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0047  leucyl aminopeptidase  51.69 
 
 		 461 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0713  leucyl aminopeptidase  50.99 
 
 		 467 aa  402  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0428  leucyl aminopeptidase  50.9 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0215  leucyl aminopeptidase  50.99 
 
 		 455 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0245  leucyl aminopeptidase  50.99 
 
 		 455 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.597485  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1379  cytosol aminopeptidase  51.69 
 
 		 479 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0038  leucyl aminopeptidase  51.83 
 
 		 461 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0106  leucyl aminopeptidase  53.81 
 
 		 456 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1112  leucyl aminopeptidase  51.61 
 
 		 460 aa  391  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149662  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3158  Leucyl aminopeptidase  55.51 
 
 		 469 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0098  leucyl aminopeptidase  54.77 
 
 		 465 aa  385  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3234  leucine aminopeptidase  52.07 
 
 		 463 aa  378  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6389  leucyl aminopeptidase  57.18 
 
 		 452 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6782  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  56.22 
 
 		 455 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4427  leucyl aminopeptidase  51.48 
 
 		 547 aa  363  5.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.213843  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0252  Leucyl aminopeptidase  47.78 
 
 		 481 aa  345  1e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.749602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0419  leucyl aminopeptidase  51.75 
 
 		 411 aa  324  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00151993  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1251  aminopeptidase B  45.02 
 
 		 436 aa  252  8.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3620  aminopeptidase B  42.32 
 
 		 431 aa  249  7e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.412227 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1145  PepB aminopeptidase  44.12 
 
 		 427 aa  246  9e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1111  aminopeptidase B  41.02 
 
 		 431 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2898  aminopeptidase B  44.12 
 
 		 427 aa  245  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3754  aminopeptidase B  43.82 
 
 		 427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0773649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2807  aminopeptidase B  44.12 
 
 		 427 aa  244  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02415  aminopeptidase B  43.82 
 
 		 427 aa  243  5e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02379  hypothetical protein  43.82 
 
 		 427 aa  243  5e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1154  aminopeptidase B  43.82 
 
 		 427 aa  243  5e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.571702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2674  aminopeptidase B  43.82 
 
 		 427 aa  243  5e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2798  aminopeptidase B  43.8 
 
 		 427 aa  243  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2675  aminopeptidase B  44.12 
 
 		 427 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.334715  normal  0.941339 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2910  aminopeptidase B  43.8 
 
 		 427 aa  243  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2735  aminopeptidase B  43.8 
 
 		 427 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2691  aminopeptidase B  43.8 
 
 		 427 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3020  aminopeptidase B  44.41 
 
 		 428 aa  241  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.486069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2776  aminopeptidase B  43.52 
 
 		 427 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.127629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  40.93 
 
 		 497 aa  237  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3024  aminopeptidase B  44.71 
 
 		 436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  42.78 
 
 		 488 aa  230  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2744  aminopeptidase B  41.29 
 
 		 431 aa  229  7e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3016  leucyl aminopeptidase  46.41 
 
 		 479 aa  229  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1175  aminopeptidase B  43.93 
 
 		 432 aa  229  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  42.12 
 
 		 503 aa  228  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  40.11 
 
 		 496 aa  229  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1284  aminopeptidase B  43.93 
 
 		 432 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0428  aminopeptidase B  43.93 
 
 		 432 aa  228  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0152446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  41.39 
 
 		 487 aa  227  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3091  Leucyl aminopeptidase  41.21 
 
 		 545 aa  226  6e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00268238  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  38.08 
 
 		 497 aa  225  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2646  Leucyl aminopeptidase  37.83 
 
 		 507 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  39.5 
 
 		 491 aa  224  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  39.34 
 
 		 498 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  38.9 
 
 		 492 aa  222  9e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3073  Leucyl aminopeptidase  39.3 
 
 		 515 aa  222  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  43.31 
 
 		 503 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004353  peptidase B  38.16 
 
 		 432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8418  Leucyl aminopeptidase  44.44 
 
 		 491 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00871794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  45.54 
 
 		 501 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  41.45 
 
 		 497 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  36.3 
 
 		 500 aa  219  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>