More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2976 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2976  leucyl aminopeptidase  100 
 
 
469 aa  907    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.32018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3202  Leucyl aminopeptidase  97.23 
 
 
469 aa  818    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489554  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3158  Leucyl aminopeptidase  88.44 
 
 
469 aa  708    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3582  leucyl aminopeptidase  74.51 
 
 
466 aa  616  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369762  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4207  Leucyl aminopeptidase  60.8 
 
 
460 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.72513  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3040  leucyl aminopeptidase  61.25 
 
 
491 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156342  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7039  leucine aminopeptidase  60.5 
 
 
442 aa  498  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0294  peptidase M17, leucyl aminopeptidase  58.89 
 
 
462 aa  491  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6782  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  67.93 
 
 
455 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1126  Leucyl aminopeptidase  61.11 
 
 
491 aa  481  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1777  leucyl aminopeptidase  58.35 
 
 
460 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356947  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6389  leucyl aminopeptidase  69.13 
 
 
452 aa  474  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0384  leucyl aminopeptidase  58.67 
 
 
460 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3720  leucyl aminopeptidase  58.72 
 
 
460 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0730  leucyl aminopeptidase  57.21 
 
 
460 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2181  cytosol aminopeptidase family protein  57.87 
 
 
460 aa  451  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2093  cytosol aminopeptidase family protein  58.1 
 
 
460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0979393  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3527  leucyl aminopeptidase  59.24 
 
 
459 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0722387  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0292  leucine aminopeptidase  53.2 
 
 
462 aa  450  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144461  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3359  leucyl aminopeptidase  55.79 
 
 
465 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452222  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4484  Leucyl aminopeptidase  52.89 
 
 
463 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4196  Leucyl aminopeptidase  52.44 
 
 
463 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0242  leucyl aminopeptidase  53.57 
 
 
458 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0281  leucyl aminopeptidase  54.97 
 
 
455 aa  430  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4585  leucyl aminopeptidase  52.23 
 
 
473 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0047  leucyl aminopeptidase  53.67 
 
 
461 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168796  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  54.8 
 
 
463 aa  419  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3455  leucyl aminopeptidase  51.19 
 
 
472 aa  421  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0428  leucyl aminopeptidase  50.98 
 
 
454 aa  412  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1264  cytosol aminopeptidase family protein  48.46 
 
 
465 aa  414  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2707  leucyl aminopeptidase  52.09 
 
 
467 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3953  peptidase M17, leucyl aminopeptidase-like  56.29 
 
 
455 aa  411  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1379  cytosol aminopeptidase  54.12 
 
 
479 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3188  leucyl aminopeptidase  45.85 
 
 
453 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0106  leucyl aminopeptidase  51.43 
 
 
456 aa  401  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0713  leucyl aminopeptidase  49.78 
 
 
467 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0038  leucyl aminopeptidase  55.7 
 
 
461 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1677  leucyl aminopeptidase  46.85 
 
 
453 aa  398  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2759  leucyl aminopeptidase  45.39 
 
 
453 aa  398  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.168747  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02867  leucine aminopeptidase  50.43 
 
 
456 aa  389  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1491  cytosol aminopeptidase  49.07 
 
 
458 aa  389  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0148  Leucyl aminopeptidase  48.91 
 
 
476 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736784  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0686  cytosol aminopeptidase family protein  49.3 
 
 
458 aa  389  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3234  leucine aminopeptidase  52.33 
 
 
463 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179734  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1488  leucyl aminopeptidase  44.86 
 
 
453 aa  388  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2687  hypothetical protein  45.92 
 
 
454 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2559  hypothetical protein  45.8 
 
 
454 aa  385  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1858  Leucyl aminopeptidase  47.16 
 
 
461 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1080  Leucyl aminopeptidase  45.99 
 
 
463 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0261  Leucyl aminopeptidase  50.55 
 
 
455 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.614863 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4956  cytosol aminopeptidase family protein  43.91 
 
 
453 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1112  leucyl aminopeptidase  48.69 
 
 
460 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149662  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0098  leucyl aminopeptidase  50.98 
 
 
465 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0215  leucyl aminopeptidase  49.34 
 
 
455 aa  363  3e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0252  Leucyl aminopeptidase  49.88 
 
 
481 aa  363  4e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.749602  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0245  leucyl aminopeptidase  49.12 
 
 
455 aa  360  3e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.597485  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0419  leucyl aminopeptidase  50.37 
 
 
411 aa  329  6e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00151993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4427  leucyl aminopeptidase  45.2 
 
 
547 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.213843  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  40.56 
 
 
501 aa  223  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  42.94 
 
 
482 aa  219  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06390  leucyl aminopeptidase  41.69 
 
 
488 aa  218  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  40.68 
 
 
503 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  42.17 
 
 
488 aa  217  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0823  leucyl aminopeptidase  37.56 
 
 
528 aa  217  4e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1251  aminopeptidase B  46.69 
 
 
436 aa  217  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3073  Leucyl aminopeptidase  41.31 
 
 
515 aa  214  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  40.31 
 
 
498 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  37.13 
 
 
493 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  41.53 
 
 
497 aa  213  7.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  38.1 
 
 
497 aa  213  9e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  37.4 
 
 
493 aa  212  9e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  38.69 
 
 
497 aa  213  9e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0849  Leucyl aminopeptidase  39.75 
 
 
491 aa  211  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.531813  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1111  aminopeptidase B  44.6 
 
 
431 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  40.55 
 
 
503 aa  210  5e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0789  Leucyl aminopeptidase  47.06 
 
 
455 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2684  hypothetical protein  41.64 
 
 
483 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2556  hypothetical protein  41.64 
 
 
483 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  43.82 
 
 
503 aa  207  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  40.29 
 
 
487 aa  207  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  39 
 
 
508 aa  207  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3894  Leucyl aminopeptidase  43.44 
 
 
505 aa  206  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0500  Leucyl aminopeptidase  41.42 
 
 
474 aa  206  7e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000407784  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2847  Leucyl aminopeptidase  41.07 
 
 
462 aa  206  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2744  aminopeptidase B  44.25 
 
 
431 aa  206  7e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3363  Leucyl aminopeptidase  37.2 
 
 
471 aa  205  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3020  aminopeptidase B  41.27 
 
 
428 aa  205  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.486069  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  36.58 
 
 
497 aa  205  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3024  aminopeptidase B  46.69 
 
 
436 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  39.77 
 
 
497 aa  205  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1187  Leucyl aminopeptidase  38.74 
 
 
496 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0133955  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  41.01 
 
 
496 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_002620  TC0315  leucyl aminopeptidase  42.48 
 
 
499 aa  204  3e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17591  leucyl aminopeptidase  34.4 
 
 
495 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.697239  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2898  aminopeptidase B  43.9 
 
 
427 aa  203  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3620  aminopeptidase B  39 
 
 
431 aa  202  7e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.412227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8418  Leucyl aminopeptidase  40.82 
 
 
491 aa  202  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00871794  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2674  aminopeptidase B  43.55 
 
 
427 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2910  aminopeptidase B  43.9 
 
 
427 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1154  aminopeptidase B  43.55 
 
 
427 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.571702  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>