More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0098 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0098  leucyl aminopeptidase  100 
 
 		 465 aa  897    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0713  leucyl aminopeptidase  59.66 
 
 		 467 aa  529  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1112  leucyl aminopeptidase  59.35 
 
 		 460 aa  473  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149662  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1858  Leucyl aminopeptidase  52.68 
 
 		 461 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7039  leucine aminopeptidase  54.97 
 
 		 442 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0428  leucyl aminopeptidase  53.63 
 
 		 454 aa  416  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  54.1 
 
 		 463 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3188  leucyl aminopeptidase  47.2 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1677  leucyl aminopeptidase  48.09 
 
 		 453 aa  403  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4207  Leucyl aminopeptidase  52.16 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.72513  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2093  cytosol aminopeptidase family protein  53.81 
 
 		 460 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0979393  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0242  leucyl aminopeptidase  52.29 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0281  leucyl aminopeptidase  59.63 
 
 		 455 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_004310  BR2181  cytosol aminopeptidase family protein  53.58 
 
 		 460 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0148  Leucyl aminopeptidase  51.75 
 
 		 476 aa  398  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1488  leucyl aminopeptidase  46.34 
 
 		 453 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02867  leucine aminopeptidase  53.79 
 
 		 456 aa  392  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2687  hypothetical protein  47.35 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0686  cytosol aminopeptidase family protein  45.86 
 
 		 458 aa  391  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1491  cytosol aminopeptidase  45.64 
 
 		 458 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4956  cytosol aminopeptidase family protein  45.86 
 
 		 453 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2759  leucyl aminopeptidase  46.76 
 
 		 453 aa  388  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.168747  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2559  hypothetical protein  47.57 
 
 		 454 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0730  leucyl aminopeptidase  51.95 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0292  leucine aminopeptidase  50.71 
 
 		 462 aa  388  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144461  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0294  peptidase M17, leucyl aminopeptidase  50.55 
 
 		 462 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4585  leucyl aminopeptidase  50 
 
 		 473 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1264  cytosol aminopeptidase family protein  45.35 
 
 		 465 aa  384  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1126  Leucyl aminopeptidase  50.46 
 
 		 491 aa  381  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150295 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1080  Leucyl aminopeptidase  49.67 
 
 		 463 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1777  leucyl aminopeptidase  50.79 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356947  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3040  leucyl aminopeptidase  51.72 
 
 		 491 aa  381  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4484  Leucyl aminopeptidase  49.4 
 
 		 463 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3582  leucyl aminopeptidase  54.15 
 
 		 466 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369762  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0261  Leucyl aminopeptidase  52.17 
 
 		 455 aa  375  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.614863 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0384  leucyl aminopeptidase  53.81 
 
 		 460 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4196  Leucyl aminopeptidase  47.87 
 
 		 463 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0245  leucyl aminopeptidase  52.4 
 
 		 455 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.597485  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0215  leucyl aminopeptidase  52.4 
 
 		 455 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2976  leucyl aminopeptidase  50.22 
 
 		 469 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.32018 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3359  leucyl aminopeptidase  48.69 
 
 		 465 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0047  leucyl aminopeptidase  49.89 
 
 		 461 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3720  leucyl aminopeptidase  51.27 
 
 		 460 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3202  Leucyl aminopeptidase  52.08 
 
 		 469 aa  364  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3953  peptidase M17, leucyl aminopeptidase-like  52.03 
 
 		 455 aa  363  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6782  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  53.96 
 
 		 455 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2707  leucyl aminopeptidase  51.05 
 
 		 467 aa  362  8e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3527  leucyl aminopeptidase  51.79 
 
 		 459 aa  359  6e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0722387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6389  leucyl aminopeptidase  55.05 
 
 		 452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3455  leucyl aminopeptidase  48.34 
 
 		 472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3158  Leucyl aminopeptidase  51.91 
 
 		 469 aa  352  7e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1379  cytosol aminopeptidase  48.6 
 
 		 479 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0038  leucyl aminopeptidase  50.79 
 
 		 461 aa  342  7e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0419  leucyl aminopeptidase  57.1 
 
 		 411 aa  342  1e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00151993  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3234  leucine aminopeptidase  51.32 
 
 		 463 aa  336  5e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0106  leucyl aminopeptidase  49.77 
 
 		 456 aa  333  4e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0252  Leucyl aminopeptidase  45.48 
 
 		 481 aa  319  7e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.749602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4427  leucyl aminopeptidase  44.76 
 
 		 547 aa  313  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.213843  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  42.12 
 
 		 497 aa  243  6e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  38.85 
 
 		 496 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  42.55 
 
 		 487 aa  229  8e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  42.28 
 
 		 488 aa  229  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  39.9 
 
 		 492 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  40.53 
 
 		 491 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  36.02 
 
 		 493 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0999  leucyl aminopeptidase  41.61 
 
 		 511 aa  221  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  35.75 
 
 		 493 aa  220  5e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  41.35 
 
 		 503 aa  219  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  42.31 
 
 		 495 aa  219  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1251  aminopeptidase B  42.68 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  37.43 
 
 		 503 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  39.73 
 
 		 497 aa  217  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_002620  TC0315  leucyl aminopeptidase  42.55 
 
 		 499 aa  216  7e-55  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  38.81 
 
 		 503 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0823  leucyl aminopeptidase  39.53 
 
 		 528 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17591  leucyl aminopeptidase  35.65 
 
 		 495 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.697239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0038  leucyl aminopeptidase  31.8 
 
 		 504 aa  216  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3620  aminopeptidase B  42.9 
 
 		 431 aa  216  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.412227 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0332  leucyl aminopeptidase  42.16 
 
 		 496 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00199325  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  41.16 
 
 		 503 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  41.83 
 
 		 487 aa  214  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  40.87 
 
 		 503 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  40.35 
 
 		 497 aa  213  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0296  leucyl aminopeptidase  33.88 
 
 		 488 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00770459 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  41.89 
 
 		 496 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  36.88 
 
 		 482 aa  213  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3886  Leucyl aminopeptidase  39.34 
 
 		 524 aa  213  7e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.384144  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  41 
 
 		 496 aa  213  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  40.06 
 
 		 511 aa  213  9e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4642  Leucyl aminopeptidase  42.16 
 
 		 480 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0766535 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0903  leucyl aminopeptidase  35.38 
 
 		 495 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2675  aminopeptidase B  41.56 
 
 		 427 aa  212  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.334715  normal  0.941339 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0008  Leucyl aminopeptidase  39.24 
 
 		 502 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1178  leucyl aminopeptidase  40.5 
 
 		 502 aa  211  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3262  leucyl aminopeptidase  40.5 
 
 		 502 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0507418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1430  leucyl aminopeptidase  38.77 
 
 		 490 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2827  leucyl aminopeptidase  40.5 
 
 		 502 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.246514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2898  aminopeptidase B  41.25 
 
 		 427 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3006  leucyl aminopeptidase  40.19 
 
 		 502 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.132109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  38.66 
 
 		 508 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>