More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0384 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7039  leucine aminopeptidase  73.76 
 
 		 442 aa  649    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4207  Leucyl aminopeptidase  75.43 
 
 		 460 aa  682    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.72513  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0294  peptidase M17, leucyl aminopeptidase  84.63 
 
 		 462 aa  765    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1777  leucyl aminopeptidase  75.22 
 
 		 460 aa  680    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356947  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3720  leucyl aminopeptidase  75.87 
 
 		 460 aa  660    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3527  leucyl aminopeptidase  76.37 
 
 		 459 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0722387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0384  leucyl aminopeptidase  100 
 
 		 460 aa  919    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3040  leucyl aminopeptidase  61.69 
 
 		 491 aa  507  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0730  leucyl aminopeptidase  59.26 
 
 		 460 aa  503  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2093  cytosol aminopeptidase family protein  60.22 
 
 		 460 aa  498  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0979393  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2181  cytosol aminopeptidase family protein  60 
 
 		 460 aa  497  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1126  Leucyl aminopeptidase  58.94 
 
 		 491 aa  496  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150295 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3359  leucyl aminopeptidase  55.88 
 
 		 465 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0292  leucine aminopeptidase  53.48 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144461  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4484  Leucyl aminopeptidase  54.73 
 
 		 463 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0281  leucyl aminopeptidase  58.48 
 
 		 455 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3582  leucyl aminopeptidase  57.68 
 
 		 466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369762  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4196  Leucyl aminopeptidase  54.05 
 
 		 463 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0242  leucyl aminopeptidase  57.55 
 
 		 458 aa  466  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2976  leucyl aminopeptidase  58.67 
 
 		 469 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.32018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3202  Leucyl aminopeptidase  58.22 
 
 		 469 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3953  peptidase M17, leucyl aminopeptidase-like  57.48 
 
 		 455 aa  443  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  56.19 
 
 		 463 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3455  leucyl aminopeptidase  51.63 
 
 		 472 aa  432  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1264  cytosol aminopeptidase family protein  46.71 
 
 		 465 aa  426  1e-118  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3158  Leucyl aminopeptidase  58.35 
 
 		 469 aa  428  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6782  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  58.67 
 
 		 455 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0428  leucyl aminopeptidase  50.66 
 
 		 454 aa  424  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4585  leucyl aminopeptidase  52.34 
 
 		 473 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2707  leucyl aminopeptidase  53 
 
 		 467 aa  421  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6389  leucyl aminopeptidase  57.78 
 
 		 452 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0047  leucyl aminopeptidase  54.21 
 
 		 461 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3234  leucine aminopeptidase  55.92 
 
 		 463 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0038  leucyl aminopeptidase  52.7 
 
 		 461 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0106  leucyl aminopeptidase  53.77 
 
 		 456 aa  400  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0148  Leucyl aminopeptidase  49.24 
 
 		 476 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1379  cytosol aminopeptidase  52.78 
 
 		 479 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1488  leucyl aminopeptidase  45.07 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3188  leucyl aminopeptidase  43.81 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1677  leucyl aminopeptidase  46.24 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1858  Leucyl aminopeptidase  47.23 
 
 		 461 aa  385  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4956  cytosol aminopeptidase family protein  45.23 
 
 		 453 aa  383  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2559  hypothetical protein  44.74 
 
 		 454 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2759  leucyl aminopeptidase  47.04 
 
 		 453 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.168747  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2687  hypothetical protein  44.2 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1491  cytosol aminopeptidase  48.51 
 
 		 458 aa  376  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0686  cytosol aminopeptidase family protein  48.28 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0098  leucyl aminopeptidase  53.9 
 
 		 465 aa  363  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1112  leucyl aminopeptidase  46.04 
 
 		 460 aa  361  2e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149662  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0713  leucyl aminopeptidase  47.11 
 
 		 467 aa  361  2e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02867  leucine aminopeptidase  48.71 
 
 		 456 aa  360  4e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0261  Leucyl aminopeptidase  47.39 
 
 		 455 aa  358  9.999999999999999e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.614863 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0252  Leucyl aminopeptidase  47.46 
 
 		 481 aa  357  2.9999999999999997e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.749602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1080  Leucyl aminopeptidase  46.5 
 
 		 463 aa  351  1e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0215  leucyl aminopeptidase  48.3 
 
 		 455 aa  343  5e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0245  leucyl aminopeptidase  48.06 
 
 		 455 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.597485  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0419  leucyl aminopeptidase  49.62 
 
 		 411 aa  323  3e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00151993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4427  leucyl aminopeptidase  42.8 
 
 		 547 aa  300  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.213843  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  35.5 
 
 		 497 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  37.67 
 
 		 498 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  38.92 
 
 		 498 aa  226  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  35.29 
 
 		 495 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  32.63 
 
 		 493 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  33.1 
 
 		 493 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  38.36 
 
 		 497 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  38.36 
 
 		 497 aa  223  7e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  36.24 
 
 		 496 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  41.89 
 
 		 495 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3944  Leucyl aminopeptidase  36.54 
 
 		 497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  36.96 
 
 		 503 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3937  Leucyl aminopeptidase  36.15 
 
 		 497 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0971426 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  39.4 
 
 		 497 aa  219  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0557  leucyl aminopeptidase  37.53 
 
 		 503 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0287473 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  39.76 
 
 		 496 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3651  leucyl aminopeptidase  35.71 
 
 		 497 aa  219  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  34.74 
 
 		 500 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10530  leucyl aminopeptidase  42.73 
 
 		 498 aa  218  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46137  normal  0.123845 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2339  leucyl aminopeptidase  37.97 
 
 		 500 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  40.35 
 
 		 497 aa  217  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  39.73 
 
 		 488 aa  217  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  34.64 
 
 		 492 aa  216  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  36.54 
 
 		 500 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  39.19 
 
 		 496 aa  216  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  38.86 
 
 		 499 aa  216  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  37.69 
 
 		 500 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2531  leucyl aminopeptidase  39.04 
 
 		 493 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.353426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3073  Leucyl aminopeptidase  38.17 
 
 		 515 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1251  aminopeptidase B  42.31 
 
 		 436 aa  213  7.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  34.58 
 
 		 491 aa  212  9e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  36.68 
 
 		 503 aa  212  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3020  aminopeptidase B  43.71 
 
 		 428 aa  212  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.486069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15181  leucyl aminopeptidase  32.21 
 
 		 490 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  36.55 
 
 		 514 aa  210  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0098  leucyl aminopeptidase  38.26 
 
 		 491 aa  211  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  37.19 
 
 		 501 aa  210  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2221  Leucyl aminopeptidase  40.32 
 
 		 539 aa  210  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.258541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  38.84 
 
 		 487 aa  210  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  35.47 
 
 		 500 aa  210  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2965  leucyl aminopeptidase  35.36 
 
 		 500 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15321  leucyl aminopeptidase  31.76 
 
 		 490 aa  209  8e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>