More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2707 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2707  leucyl aminopeptidase  100 
 
 		 467 aa  921    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3455  leucyl aminopeptidase  59.44 
 
 		 472 aa  512  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0047  leucyl aminopeptidase  63.02 
 
 		 461 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1379  cytosol aminopeptidase  63.72 
 
 		 479 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4484  Leucyl aminopeptidase  53.88 
 
 		 463 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4196  Leucyl aminopeptidase  53.83 
 
 		 463 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0038  leucyl aminopeptidase  64.12 
 
 		 461 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3234  leucine aminopeptidase  60.48 
 
 		 463 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0106  leucyl aminopeptidase  56.03 
 
 		 456 aa  466  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3359  leucyl aminopeptidase  53.16 
 
 		 465 aa  461  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0292  leucine aminopeptidase  51.87 
 
 		 462 aa  458  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144461  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0730  leucyl aminopeptidase  54.29 
 
 		 460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2093  cytosol aminopeptidase family protein  52.71 
 
 		 460 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0979393  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2181  cytosol aminopeptidase family protein  52.49 
 
 		 460 aa  438  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4207  Leucyl aminopeptidase  52.9 
 
 		 460 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.72513  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0242  leucyl aminopeptidase  51.75 
 
 		 458 aa  426  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7039  leucine aminopeptidase  54.97 
 
 		 442 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0281  leucyl aminopeptidase  53 
 
 		 455 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3040  leucyl aminopeptidase  53.08 
 
 		 491 aa  421  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0294  peptidase M17, leucyl aminopeptidase  53.6 
 
 		 462 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1777  leucyl aminopeptidase  52.9 
 
 		 460 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356947  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0428  leucyl aminopeptidase  51.76 
 
 		 454 aa  414  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1264  cytosol aminopeptidase family protein  46.8 
 
 		 465 aa  409  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0384  leucyl aminopeptidase  53 
 
 		 460 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1126  Leucyl aminopeptidase  54.82 
 
 		 491 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2976  leucyl aminopeptidase  52.09 
 
 		 469 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.32018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3202  Leucyl aminopeptidase  55.29 
 
 		 469 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3953  peptidase M17, leucyl aminopeptidase-like  53.52 
 
 		 455 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3582  leucyl aminopeptidase  52.12 
 
 		 466 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369762  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3720  leucyl aminopeptidase  54.29 
 
 		 460 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  53.6 
 
 		 463 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2559  hypothetical protein  48.51 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4585  leucyl aminopeptidase  50.23 
 
 		 473 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2687  hypothetical protein  48.05 
 
 		 454 aa  375  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3158  Leucyl aminopeptidase  50.77 
 
 		 469 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3527  leucyl aminopeptidase  53.13 
 
 		 459 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0722387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1858  Leucyl aminopeptidase  47.59 
 
 		 461 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6782  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  54.41 
 
 		 455 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0713  leucyl aminopeptidase  53.73 
 
 		 467 aa  369  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4956  cytosol aminopeptidase family protein  45.71 
 
 		 453 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3188  leucyl aminopeptidase  46.14 
 
 		 453 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1677  leucyl aminopeptidase  44.52 
 
 		 453 aa  365  1e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6389  leucyl aminopeptidase  55.69 
 
 		 452 aa  363  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2759  leucyl aminopeptidase  44.08 
 
 		 453 aa  361  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.168747  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0261  Leucyl aminopeptidase  50.59 
 
 		 455 aa  360  4e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.614863 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0148  Leucyl aminopeptidase  46.99 
 
 		 476 aa  360  4e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1491  cytosol aminopeptidase  43.3 
 
 		 458 aa  353  4e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0686  cytosol aminopeptidase family protein  43.08 
 
 		 458 aa  352  8e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02867  leucine aminopeptidase  47.31 
 
 		 456 aa  351  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1488  leucyl aminopeptidase  44.26 
 
 		 453 aa  351  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1112  leucyl aminopeptidase  51.84 
 
 		 460 aa  341  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149662  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0098  leucyl aminopeptidase  51.05 
 
 		 465 aa  340  4e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1080  Leucyl aminopeptidase  47.22 
 
 		 463 aa  334  3e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0252  Leucyl aminopeptidase  44.79 
 
 		 481 aa  322  7e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.749602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0215  leucyl aminopeptidase  45.79 
 
 		 455 aa  317  3e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0245  leucyl aminopeptidase  45.56 
 
 		 455 aa  315  9.999999999999999e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.597485  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0419  leucyl aminopeptidase  45.93 
 
 		 411 aa  288  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00151993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4427  leucyl aminopeptidase  42.39 
 
 		 547 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.213843  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  41.03 
 
 		 491 aa  239  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  39.84 
 
 		 492 aa  237  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8418  Leucyl aminopeptidase  41.06 
 
 		 491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00871794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  41.3 
 
 		 503 aa  231  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  40.66 
 
 		 497 aa  230  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3016  leucyl aminopeptidase  43.59 
 
 		 479 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  42.12 
 
 		 488 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  40.65 
 
 		 487 aa  227  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  38.5 
 
 		 503 aa  226  6e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3894  Leucyl aminopeptidase  39.48 
 
 		 505 aa  224  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  39.95 
 
 		 482 aa  224  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0999  leucyl aminopeptidase  39.79 
 
 		 511 aa  221  9.999999999999999e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2787  leucyl aminopeptidase  38.54 
 
 		 499 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151843  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0568  leucyl aminopeptidase  40.24 
 
 		 514 aa  221  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  40.7 
 
 		 498 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  39.75 
 
 		 503 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  40.52 
 
 		 497 aa  219  6e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  37.67 
 
 		 501 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  40.23 
 
 		 497 aa  219  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  36.46 
 
 		 495 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0500  Leucyl aminopeptidase  38.13 
 
 		 474 aa  217  4e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000407784  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  39.95 
 
 		 500 aa  217  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  40.94 
 
 		 495 aa  216  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  42.76 
 
 		 503 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  40.29 
 
 		 497 aa  213  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  41.78 
 
 		 503 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  41.78 
 
 		 503 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  35.65 
 
 		 518 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  39.89 
 
 		 518 aa  213  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0315  leucyl aminopeptidase  33.13 
 
 		 499 aa  213  7.999999999999999e-54  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  30.66 
 
 		 493 aa  213  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  32.47 
 
 		 493 aa  213  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  40 
 
 		 511 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  40 
 
 		 511 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  39.54 
 
 		 510 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  41.78 
 
 		 503 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0823  leucyl aminopeptidase  40.67 
 
 		 528 aa  211  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  35.04 
 
 		 496 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  41.45 
 
 		 503 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  37.94 
 
 		 498 aa  211  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  39.26 
 
 		 510 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  39.54 
 
 		 510 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>