More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0038 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0038  leucyl aminopeptidase  100 
 
 
461 aa  904    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1379  cytosol aminopeptidase  88.29 
 
 
479 aa  768    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0047  leucyl aminopeptidase  88.5 
 
 
461 aa  794    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168796  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3455  leucyl aminopeptidase  60.04 
 
 
472 aa  530  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3234  leucine aminopeptidase  65.28 
 
 
463 aa  527  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179734  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2707  leucyl aminopeptidase  64.12 
 
 
467 aa  484  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0106  leucyl aminopeptidase  61.65 
 
 
456 aa  479  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2181  cytosol aminopeptidase family protein  54.51 
 
 
460 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2093  cytosol aminopeptidase family protein  54.51 
 
 
460 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0979393  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0730  leucyl aminopeptidase  54.1 
 
 
460 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4484  Leucyl aminopeptidase  55.87 
 
 
463 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4196  Leucyl aminopeptidase  56.1 
 
 
463 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3359  leucyl aminopeptidase  56.22 
 
 
465 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452222  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0292  leucine aminopeptidase  54.07 
 
 
462 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144461  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7039  leucine aminopeptidase  54.07 
 
 
442 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4207  Leucyl aminopeptidase  51.1 
 
 
460 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.72513  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0242  leucyl aminopeptidase  51.88 
 
 
458 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3040  leucyl aminopeptidase  53.11 
 
 
491 aa  409  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156342  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1777  leucyl aminopeptidase  50.97 
 
 
460 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356947  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0428  leucyl aminopeptidase  55.88 
 
 
454 aa  411  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0294  peptidase M17, leucyl aminopeptidase  51.84 
 
 
462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1126  Leucyl aminopeptidase  52.58 
 
 
491 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150295 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0384  leucyl aminopeptidase  52.7 
 
 
460 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2976  leucyl aminopeptidase  55.7 
 
 
469 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.32018 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1264  cytosol aminopeptidase family protein  49.16 
 
 
465 aa  397  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4956  cytosol aminopeptidase family protein  46.17 
 
 
453 aa  392  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0281  leucyl aminopeptidase  52.21 
 
 
455 aa  395  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3202  Leucyl aminopeptidase  55.48 
 
 
469 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489554  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3953  peptidase M17, leucyl aminopeptidase-like  55.58 
 
 
455 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  51.83 
 
 
463 aa  383  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3720  leucyl aminopeptidase  51.89 
 
 
460 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3582  leucyl aminopeptidase  53.65 
 
 
466 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369762  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3158  Leucyl aminopeptidase  54.24 
 
 
469 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3188  leucyl aminopeptidase  46.1 
 
 
453 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1488  leucyl aminopeptidase  46.85 
 
 
453 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1858  Leucyl aminopeptidase  47.49 
 
 
461 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2559  hypothetical protein  47.22 
 
 
454 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1677  leucyl aminopeptidase  47.07 
 
 
453 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4585  leucyl aminopeptidase  49.56 
 
 
473 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3527  leucyl aminopeptidase  50.22 
 
 
459 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0722387  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2687  hypothetical protein  46.77 
 
 
454 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0261  Leucyl aminopeptidase  49.77 
 
 
455 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.614863 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0148  Leucyl aminopeptidase  45.93 
 
 
476 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736784  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2759  leucyl aminopeptidase  45.21 
 
 
453 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.168747  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02867  leucine aminopeptidase  47.49 
 
 
456 aa  356  5e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0713  leucyl aminopeptidase  46.55 
 
 
467 aa  348  1e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1080  Leucyl aminopeptidase  45.45 
 
 
463 aa  345  1e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6782  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  52.11 
 
 
455 aa  341  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0098  leucyl aminopeptidase  50.79 
 
 
465 aa  341  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6389  leucyl aminopeptidase  52.67 
 
 
452 aa  335  7e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0686  cytosol aminopeptidase family protein  44.22 
 
 
458 aa  333  5e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1491  cytosol aminopeptidase  44 
 
 
458 aa  331  1e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1112  leucyl aminopeptidase  47.4 
 
 
460 aa  331  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149662  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0215  leucyl aminopeptidase  44.37 
 
 
455 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0245  leucyl aminopeptidase  44.15 
 
 
455 aa  325  1e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.597485  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0252  Leucyl aminopeptidase  44.09 
 
 
481 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.749602  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0419  leucyl aminopeptidase  47.92 
 
 
411 aa  289  9e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00151993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4427  leucyl aminopeptidase  48.25 
 
 
547 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.213843  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  36.44 
 
 
493 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  36.16 
 
 
493 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  39.23 
 
 
482 aa  220  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  40 
 
 
503 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  42.09 
 
 
495 aa  220  5e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02660  leucyl aminopeptidase  41.33 
 
 
490 aa  219  7e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8418  Leucyl aminopeptidase  41.81 
 
 
491 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00871794  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  39.5 
 
 
503 aa  217  4e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  40.49 
 
 
501 aa  217  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0536  leucyl aminopeptidase  42.95 
 
 
492 aa  216  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0500  Leucyl aminopeptidase  42.11 
 
 
474 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000407784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1251  aminopeptidase B  38.42 
 
 
436 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0315  leucyl aminopeptidase  40.18 
 
 
499 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  40 
 
 
500 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3886  Leucyl aminopeptidase  40.58 
 
 
524 aa  213  3.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.384144  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0823  leucyl aminopeptidase  38.78 
 
 
528 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1187  Leucyl aminopeptidase  38.03 
 
 
496 aa  213  5.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0133955  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  39.18 
 
 
503 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  39.43 
 
 
496 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  39.94 
 
 
496 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  37.43 
 
 
492 aa  212  9e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  40.58 
 
 
497 aa  212  9e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3016  leucyl aminopeptidase  42.86 
 
 
479 aa  212  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  37.97 
 
 
491 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  34.58 
 
 
508 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2684  hypothetical protein  39.06 
 
 
483 aa  211  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  39.07 
 
 
488 aa  211  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  39.78 
 
 
498 aa  211  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1207  leucyl aminopeptidase  42.4 
 
 
527 aa  211  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0999  leucyl aminopeptidase  40.37 
 
 
511 aa  210  4e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  39.72 
 
 
497 aa  210  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2556  hypothetical protein  39.06 
 
 
483 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0954  leucyl aminopeptidase  40.75 
 
 
508 aa  209  6e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  39.72 
 
 
497 aa  209  7e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  39.89 
 
 
498 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  36.9 
 
 
487 aa  209  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  39.64 
 
 
496 aa  209  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  36.6 
 
 
518 aa  209  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  33.74 
 
 
500 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0557  leucyl aminopeptidase  38.82 
 
 
503 aa  207  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0287473 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  35.6 
 
 
495 aa  206  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3020  aminopeptidase B  40.06 
 
 
428 aa  206  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.486069  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>