More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6782 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6782  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  100 
 
 
455 aa  881    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6389  leucyl aminopeptidase  86.55 
 
 
452 aa  626  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3582  leucyl aminopeptidase  67.79 
 
 
466 aa  533  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369762  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3040  leucyl aminopeptidase  62.28 
 
 
491 aa  517  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156342  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3202  Leucyl aminopeptidase  68.15 
 
 
469 aa  512  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489554  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2976  leucyl aminopeptidase  67.71 
 
 
469 aa  514  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.32018 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1126  Leucyl aminopeptidase  63.25 
 
 
491 aa  501  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7039  leucine aminopeptidase  61.47 
 
 
442 aa  498  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4207  Leucyl aminopeptidase  59.38 
 
 
460 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.72513  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3158  Leucyl aminopeptidase  68 
 
 
469 aa  491  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1777  leucyl aminopeptidase  57.08 
 
 
460 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356947  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0242  leucyl aminopeptidase  56.8 
 
 
458 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0384  leucyl aminopeptidase  58.67 
 
 
460 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0294  peptidase M17, leucyl aminopeptidase  57.3 
 
 
462 aa  463  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3720  leucyl aminopeptidase  56.86 
 
 
460 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0281  leucyl aminopeptidase  58.26 
 
 
455 aa  463  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_004310  BR2181  cytosol aminopeptidase family protein  56.52 
 
 
460 aa  458  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0730  leucyl aminopeptidase  55.99 
 
 
460 aa  459  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2093  cytosol aminopeptidase family protein  56.74 
 
 
460 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0979393  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3527  leucyl aminopeptidase  59.15 
 
 
459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0722387  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3953  peptidase M17, leucyl aminopeptidase-like  58.75 
 
 
455 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1264  cytosol aminopeptidase family protein  47.2 
 
 
465 aa  427  1e-118  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4196  Leucyl aminopeptidase  50.22 
 
 
463 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2707  leucyl aminopeptidase  54.63 
 
 
467 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4484  Leucyl aminopeptidase  50.22 
 
 
463 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0428  leucyl aminopeptidase  50.98 
 
 
454 aa  417  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3359  leucyl aminopeptidase  52.87 
 
 
465 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452222  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0292  leucine aminopeptidase  49 
 
 
462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144461  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3188  leucyl aminopeptidase  45.93 
 
 
453 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  53.48 
 
 
463 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0047  leucyl aminopeptidase  53.08 
 
 
461 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168796  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4585  leucyl aminopeptidase  50.11 
 
 
473 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0713  leucyl aminopeptidase  55.21 
 
 
467 aa  391  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1858  Leucyl aminopeptidase  49.88 
 
 
461 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1677  leucyl aminopeptidase  46.37 
 
 
453 aa  386  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3455  leucyl aminopeptidase  48.67 
 
 
472 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0098  leucyl aminopeptidase  52.94 
 
 
465 aa  386  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0686  cytosol aminopeptidase family protein  46.65 
 
 
458 aa  383  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1491  cytosol aminopeptidase  46.88 
 
 
458 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0261  Leucyl aminopeptidase  50 
 
 
455 aa  382  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.614863 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2759  leucyl aminopeptidase  44.94 
 
 
453 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.168747  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1488  leucyl aminopeptidase  46.65 
 
 
453 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4956  cytosol aminopeptidase family protein  44.42 
 
 
453 aa  378  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1379  cytosol aminopeptidase  53.08 
 
 
479 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0106  leucyl aminopeptidase  50.11 
 
 
456 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1112  leucyl aminopeptidase  53.55 
 
 
460 aa  371  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0148  Leucyl aminopeptidase  48.57 
 
 
476 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736784  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02867  leucine aminopeptidase  49.67 
 
 
456 aa  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0038  leucyl aminopeptidase  52.44 
 
 
461 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0252  Leucyl aminopeptidase  50.79 
 
 
481 aa  364  2e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.749602  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3234  leucine aminopeptidase  52.13 
 
 
463 aa  359  5e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179734  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0215  leucyl aminopeptidase  52.21 
 
 
455 aa  356  5.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2687  hypothetical protein  45.7 
 
 
454 aa  354  2e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2559  hypothetical protein  45.48 
 
 
454 aa  353  2e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0245  leucyl aminopeptidase  51.96 
 
 
455 aa  353  4e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.597485  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1080  Leucyl aminopeptidase  46.3 
 
 
463 aa  351  2e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0419  leucyl aminopeptidase  51.54 
 
 
411 aa  335  9e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00151993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4427  leucyl aminopeptidase  47.19 
 
 
547 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.213843  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  42.69 
 
 
503 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  39.22 
 
 
503 aa  229  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  43.75 
 
 
497 aa  226  7e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  42.99 
 
 
496 aa  226  8e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1251  aminopeptidase B  45.14 
 
 
436 aa  223  8e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3073  Leucyl aminopeptidase  42.25 
 
 
515 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  35.69 
 
 
493 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2121  Leucyl aminopeptidase  47.08 
 
 
465 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0098  leucyl aminopeptidase  37.92 
 
 
491 aa  217  4e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  35.77 
 
 
493 aa  217  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  40.11 
 
 
488 aa  216  8e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0999  leucyl aminopeptidase  41.69 
 
 
511 aa  216  8e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0114  leucyl aminopeptidase  37.68 
 
 
491 aa  216  8e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  39.18 
 
 
487 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  42.55 
 
 
501 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3894  Leucyl aminopeptidase  42.62 
 
 
505 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  38.46 
 
 
495 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  42.25 
 
 
503 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0789  Leucyl aminopeptidase  46.08 
 
 
455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8418  Leucyl aminopeptidase  44.94 
 
 
491 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00871794  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  39 
 
 
482 aa  213  7.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  40.12 
 
 
498 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  40 
 
 
503 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06390  leucyl aminopeptidase  44.41 
 
 
488 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  39.71 
 
 
503 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  38.06 
 
 
498 aa  210  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  39.3 
 
 
506 aa  209  6e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  39.71 
 
 
503 aa  209  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10530  leucyl aminopeptidase  41.91 
 
 
498 aa  209  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46137  normal  0.123845 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0536  leucyl aminopeptidase  42.42 
 
 
492 aa  209  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1855  leucyl aminopeptidase  40 
 
 
503 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2471  leucyl aminopeptidase  40 
 
 
503 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2466  leucyl aminopeptidase  40 
 
 
503 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0332  leucyl aminopeptidase  40 
 
 
496 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00199325  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0500  Leucyl aminopeptidase  41.54 
 
 
474 aa  208  2e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000407784  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  38.06 
 
 
508 aa  208  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  38.42 
 
 
497 aa  207  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  38.48 
 
 
497 aa  207  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0823  leucyl aminopeptidase  41.74 
 
 
528 aa  207  4e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  39.02 
 
 
487 aa  206  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  38.57 
 
 
503 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  35.81 
 
 
496 aa  205  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>