More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4207 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4207  Leucyl aminopeptidase  100 
 
 
460 aa  920    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.72513  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0294  peptidase M17, leucyl aminopeptidase  72.94 
 
 
462 aa  657    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1777  leucyl aminopeptidase  85.87 
 
 
460 aa  773    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356947  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3720  leucyl aminopeptidase  76.52 
 
 
460 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3527  leucyl aminopeptidase  85.53 
 
 
459 aa  717    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0722387  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0384  leucyl aminopeptidase  75.43 
 
 
460 aa  667    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7039  leucine aminopeptidase  77.15 
 
 
442 aa  677    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1126  Leucyl aminopeptidase  60.79 
 
 
491 aa  513  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150295 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3040  leucyl aminopeptidase  60.88 
 
 
491 aa  510  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156342  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0281  leucyl aminopeptidase  60.54 
 
 
455 aa  501  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2093  cytosol aminopeptidase family protein  59.16 
 
 
460 aa  496  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0979393  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2181  cytosol aminopeptidase family protein  58.94 
 
 
460 aa  494  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0730  leucyl aminopeptidase  58.28 
 
 
460 aa  489  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3582  leucyl aminopeptidase  58.76 
 
 
466 aa  480  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369762  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0242  leucyl aminopeptidase  57.48 
 
 
458 aa  476  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2976  leucyl aminopeptidase  60.8 
 
 
469 aa  471  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.32018 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0292  leucine aminopeptidase  52.18 
 
 
462 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144461  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4484  Leucyl aminopeptidase  52.94 
 
 
463 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4196  Leucyl aminopeptidase  53.59 
 
 
463 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3202  Leucyl aminopeptidase  60.58 
 
 
469 aa  464  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489554  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3359  leucyl aminopeptidase  53.52 
 
 
465 aa  464  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452222  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  56.98 
 
 
463 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3158  Leucyl aminopeptidase  60.58 
 
 
469 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6782  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  59.38 
 
 
455 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3953  peptidase M17, leucyl aminopeptidase-like  57.62 
 
 
455 aa  441  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6389  leucyl aminopeptidase  60.49 
 
 
452 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1264  cytosol aminopeptidase family protein  47.15 
 
 
465 aa  427  1e-118  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4585  leucyl aminopeptidase  50.99 
 
 
473 aa  426  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0428  leucyl aminopeptidase  51.22 
 
 
454 aa  423  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3455  leucyl aminopeptidase  50.44 
 
 
472 aa  420  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0047  leucyl aminopeptidase  50.33 
 
 
461 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168796  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3188  leucyl aminopeptidase  47.54 
 
 
453 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2707  leucyl aminopeptidase  52.9 
 
 
467 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2759  leucyl aminopeptidase  47.1 
 
 
453 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.168747  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1379  cytosol aminopeptidase  51.32 
 
 
479 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1488  leucyl aminopeptidase  45.74 
 
 
453 aa  396  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4956  cytosol aminopeptidase family protein  45.8 
 
 
453 aa  393  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1677  leucyl aminopeptidase  48.11 
 
 
453 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0038  leucyl aminopeptidase  51.1 
 
 
461 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3234  leucine aminopeptidase  53.96 
 
 
463 aa  390  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179734  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0106  leucyl aminopeptidase  51.79 
 
 
456 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1858  Leucyl aminopeptidase  46.02 
 
 
461 aa  385  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1491  cytosol aminopeptidase  47.79 
 
 
458 aa  375  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0148  Leucyl aminopeptidase  47.08 
 
 
476 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736784  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2687  hypothetical protein  44.32 
 
 
454 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2559  hypothetical protein  44.32 
 
 
454 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0686  cytosol aminopeptidase family protein  47.55 
 
 
458 aa  374  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0098  leucyl aminopeptidase  52.38 
 
 
465 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02867  leucine aminopeptidase  47.8 
 
 
456 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0261  Leucyl aminopeptidase  45.3 
 
 
455 aa  355  6.999999999999999e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.614863 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1080  Leucyl aminopeptidase  44.92 
 
 
463 aa  355  7.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0713  leucyl aminopeptidase  49.87 
 
 
467 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0252  Leucyl aminopeptidase  48.02 
 
 
481 aa  348  1e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.749602  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0215  leucyl aminopeptidase  48.55 
 
 
455 aa  339  8e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1112  leucyl aminopeptidase  50 
 
 
460 aa  338  9.999999999999999e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149662  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0245  leucyl aminopeptidase  48.31 
 
 
455 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.597485  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0419  leucyl aminopeptidase  55.81 
 
 
411 aa  322  6e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00151993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4427  leucyl aminopeptidase  45.51 
 
 
547 aa  319  7e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.213843  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  38.61 
 
 
501 aa  227  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  41.64 
 
 
488 aa  227  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  37.94 
 
 
496 aa  227  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8418  Leucyl aminopeptidase  40.63 
 
 
491 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00871794  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  40.21 
 
 
497 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  39.41 
 
 
503 aa  224  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  41.85 
 
 
503 aa  223  6e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  35.04 
 
 
493 aa  221  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  35.04 
 
 
493 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2646  Leucyl aminopeptidase  38.24 
 
 
507 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3016  leucyl aminopeptidase  44.44 
 
 
479 aa  219  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10530  leucyl aminopeptidase  40.18 
 
 
498 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46137  normal  0.123845 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3073  Leucyl aminopeptidase  35.76 
 
 
515 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  40.22 
 
 
487 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  37.94 
 
 
495 aa  217  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3894  Leucyl aminopeptidase  43.34 
 
 
505 aa  216  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3091  Leucyl aminopeptidase  38.03 
 
 
545 aa  216  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00268238  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17591  leucyl aminopeptidase  33.92 
 
 
495 aa  216  7e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.697239  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  34.84 
 
 
497 aa  216  8e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  36.18 
 
 
497 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  37.04 
 
 
498 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  36.18 
 
 
497 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0903  leucyl aminopeptidase  33.7 
 
 
495 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0315  leucyl aminopeptidase  43.71 
 
 
499 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06390  leucyl aminopeptidase  37.8 
 
 
488 aa  213  9e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1251  aminopeptidase B  44.25 
 
 
436 aa  212  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2556  hypothetical protein  43.81 
 
 
483 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1180  Leucyl aminopeptidase  44.28 
 
 
485 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746121  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  43.51 
 
 
495 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  39.6 
 
 
498 aa  210  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  38.64 
 
 
482 aa  210  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0999  leucyl aminopeptidase  40.79 
 
 
511 aa  210  5e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2684  hypothetical protein  43.81 
 
 
483 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14931  leucyl aminopeptidase  36.24 
 
 
495 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0332  leucyl aminopeptidase  38.95 
 
 
496 aa  209  9e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00199325  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  34.27 
 
 
493 aa  209  9e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  39.8 
 
 
503 aa  209  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  39.13 
 
 
506 aa  209  1e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3020  aminopeptidase B  44.25 
 
 
428 aa  209  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.486069  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  38.6 
 
 
497 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2787  leucyl aminopeptidase  40.13 
 
 
499 aa  207  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151843  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1545  leucyl aminopeptidase  40.51 
 
 
497 aa  207  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.87214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>