More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3455 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3455  leucyl aminopeptidase  100 
 
 		 472 aa  944    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0106  leucyl aminopeptidase  62.2 
 
 		 456 aa  529  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3234  leucine aminopeptidase  63.32 
 
 		 463 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0047  leucyl aminopeptidase  58.82 
 
 		 461 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1379  cytosol aminopeptidase  58.85 
 
 		 479 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0038  leucyl aminopeptidase  60.04 
 
 		 461 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2707  leucyl aminopeptidase  59.44 
 
 		 467 aa  499  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4484  Leucyl aminopeptidase  51.42 
 
 		 463 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4196  Leucyl aminopeptidase  51.2 
 
 		 463 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0292  leucine aminopeptidase  51.42 
 
 		 462 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144461  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3359  leucyl aminopeptidase  50.55 
 
 		 465 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4207  Leucyl aminopeptidase  50.44 
 
 		 460 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.72513  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0730  leucyl aminopeptidase  53.66 
 
 		 460 aa  413  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2181  cytosol aminopeptidase family protein  52.89 
 
 		 460 aa  414  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2093  cytosol aminopeptidase family protein  52.89 
 
 		 460 aa  415  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0979393  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0294  peptidase M17, leucyl aminopeptidase  49.89 
 
 		 462 aa  409  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1777  leucyl aminopeptidase  50.54 
 
 		 460 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356947  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0428  leucyl aminopeptidase  51.1 
 
 		 454 aa  408  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7039  leucine aminopeptidase  51.13 
 
 		 442 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0384  leucyl aminopeptidase  51.63 
 
 		 460 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0242  leucyl aminopeptidase  50 
 
 		 458 aa  398  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  51.66 
 
 		 463 aa  395  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3188  leucyl aminopeptidase  46.85 
 
 		 453 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3582  leucyl aminopeptidase  50.67 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369762  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2976  leucyl aminopeptidase  51.19 
 
 		 469 aa  386  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.32018 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3040  leucyl aminopeptidase  50.11 
 
 		 491 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1488  leucyl aminopeptidase  45.72 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3202  Leucyl aminopeptidase  51.41 
 
 		 469 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1677  leucyl aminopeptidase  46.97 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1858  Leucyl aminopeptidase  47.44 
 
 		 461 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0281  leucyl aminopeptidase  51.45 
 
 		 455 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1126  Leucyl aminopeptidase  50 
 
 		 491 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150295 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2759  leucyl aminopeptidase  44.3 
 
 		 453 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.168747  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0148  Leucyl aminopeptidase  45.26 
 
 		 476 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3953  peptidase M17, leucyl aminopeptidase-like  51.42 
 
 		 455 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1264  cytosol aminopeptidase family protein  44.39 
 
 		 465 aa  373  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4956  cytosol aminopeptidase family protein  45.01 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0261  Leucyl aminopeptidase  48.13 
 
 		 455 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.614863 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2559  hypothetical protein  44.32 
 
 		 454 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3720  leucyl aminopeptidase  47.94 
 
 		 460 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4585  leucyl aminopeptidase  45.69 
 
 		 473 aa  368  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2687  hypothetical protein  44.54 
 
 		 454 aa  364  2e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3527  leucyl aminopeptidase  49.78 
 
 		 459 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0722387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1080  Leucyl aminopeptidase  47.06 
 
 		 463 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0713  leucyl aminopeptidase  45.43 
 
 		 467 aa  352  8.999999999999999e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3158  Leucyl aminopeptidase  48.59 
 
 		 469 aa  343  4e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6782  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  50.24 
 
 		 455 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02867  leucine aminopeptidase  44.88 
 
 		 456 aa  340  4e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1491  cytosol aminopeptidase  42.63 
 
 		 458 aa  337  2.9999999999999997e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6389  leucyl aminopeptidase  52.16 
 
 		 452 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0686  cytosol aminopeptidase family protein  42.41 
 
 		 458 aa  335  7e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1112  leucyl aminopeptidase  45.95 
 
 		 460 aa  334  2e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149662  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0098  leucyl aminopeptidase  48.76 
 
 		 465 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0245  leucyl aminopeptidase  44.88 
 
 		 455 aa  324  2e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.597485  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0215  leucyl aminopeptidase  44.88 
 
 		 455 aa  323  3e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0252  Leucyl aminopeptidase  41.69 
 
 		 481 aa  291  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.749602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0419  leucyl aminopeptidase  43.75 
 
 		 411 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00151993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4427  leucyl aminopeptidase  42.95 
 
 		 547 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.213843  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  37.07 
 
 		 501 aa  223  8e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  37.33 
 
 		 508 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  34.08 
 
 		 497 aa  220  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1430  leucyl aminopeptidase  39.69 
 
 		 490 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  37.76 
 
 		 491 aa  219  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  32.35 
 
 		 493 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  32.13 
 
 		 493 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15321  leucyl aminopeptidase  39.31 
 
 		 490 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113645  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  34.87 
 
 		 518 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  37.71 
 
 		 487 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  36.32 
 
 		 495 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  34.27 
 
 		 510 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  40 
 
 		 488 aa  215  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15181  leucyl aminopeptidase  38.99 
 
 		 490 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  36.64 
 
 		 497 aa  213  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  35.57 
 
 		 498 aa  213  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  38.02 
 
 		 497 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1251  aminopeptidase B  41.01 
 
 		 436 aa  213  7e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  36.64 
 
 		 497 aa  213  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17591  leucyl aminopeptidase  37.8 
 
 		 495 aa  213  9e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.697239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  34.37 
 
 		 511 aa  213  9e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  34.37 
 
 		 511 aa  213  9e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  34.18 
 
 		 487 aa  212  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  36.43 
 
 		 492 aa  212  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0903  leucyl aminopeptidase  37.12 
 
 		 495 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  34.37 
 
 		 511 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0038  leucyl aminopeptidase  31.66 
 
 		 504 aa  210  4e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0536  leucyl aminopeptidase  40.79 
 
 		 492 aa  210  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  37.67 
 
 		 482 aa  209  6e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  39.23 
 
 		 498 aa  209  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06390  leucyl aminopeptidase  35.16 
 
 		 488 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  33.57 
 
 		 510 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  33.57 
 
 		 510 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3020  aminopeptidase B  40.38 
 
 		 428 aa  208  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.486069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  33.57 
 
 		 510 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2684  hypothetical protein  35.28 
 
 		 483 aa  207  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3016  leucyl aminopeptidase  38.66 
 
 		 479 aa  206  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2556  hypothetical protein  32.68 
 
 		 483 aa  206  8e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  36.07 
 
 		 496 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1111  aminopeptidase B  41.21 
 
 		 431 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  37.9 
 
 		 503 aa  205  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3894  Leucyl aminopeptidase  41.16 
 
 		 505 aa  205  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>