More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3720 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4207  Leucyl aminopeptidase  76.52 
 
 		 460 aa  699    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.72513  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0294  peptidase M17, leucyl aminopeptidase  74.68 
 
 		 462 aa  682    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1777  leucyl aminopeptidase  77.61 
 
 		 460 aa  712    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356947  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3720  leucyl aminopeptidase  100 
 
 		 460 aa  925    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3527  leucyl aminopeptidase  77.41 
 
 		 459 aa  670    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0722387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0384  leucyl aminopeptidase  75.87 
 
 		 460 aa  681    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7039  leucine aminopeptidase  75.11 
 
 		 442 aa  664    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3040  leucyl aminopeptidase  63.15 
 
 		 491 aa  525  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1126  Leucyl aminopeptidase  60.4 
 
 		 491 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150295 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2093  cytosol aminopeptidase family protein  60.22 
 
 		 460 aa  499  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0979393  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0281  leucyl aminopeptidase  60.04 
 
 		 455 aa  498  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_004310  BR2181  cytosol aminopeptidase family protein  60 
 
 		 460 aa  497  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0730  leucyl aminopeptidase  58.65 
 
 		 460 aa  495  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0242  leucyl aminopeptidase  57.92 
 
 		 458 aa  481  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4484  Leucyl aminopeptidase  54.93 
 
 		 463 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3359  leucyl aminopeptidase  55.08 
 
 		 465 aa  471  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2976  leucyl aminopeptidase  58.72 
 
 		 469 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.32018 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4196  Leucyl aminopeptidase  53.81 
 
 		 463 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0292  leucine aminopeptidase  53.62 
 
 		 462 aa  470  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144461  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3582  leucyl aminopeptidase  57.46 
 
 		 466 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369762  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3202  Leucyl aminopeptidase  58.72 
 
 		 469 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3953  peptidase M17, leucyl aminopeptidase-like  58.43 
 
 		 455 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1264  cytosol aminopeptidase family protein  51.54 
 
 		 465 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  56.11 
 
 		 463 aa  444  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4585  leucyl aminopeptidase  51.54 
 
 		 473 aa  441  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6782  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  56.86 
 
 		 455 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3158  Leucyl aminopeptidase  58.5 
 
 		 469 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0428  leucyl aminopeptidase  51.35 
 
 		 454 aa  431  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2707  leucyl aminopeptidase  54.29 
 
 		 467 aa  425  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6389  leucyl aminopeptidase  57.4 
 
 		 452 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0047  leucyl aminopeptidase  53.04 
 
 		 461 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1858  Leucyl aminopeptidase  48.14 
 
 		 461 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3455  leucyl aminopeptidase  47.94 
 
 		 472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4956  cytosol aminopeptidase family protein  46.77 
 
 		 453 aa  403  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2759  leucyl aminopeptidase  50.37 
 
 		 453 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.168747  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3188  leucyl aminopeptidase  46.21 
 
 		 453 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2687  hypothetical protein  45.95 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2559  hypothetical protein  45.95 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1488  leucyl aminopeptidase  45.07 
 
 		 453 aa  396  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0038  leucyl aminopeptidase  51.89 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3234  leucine aminopeptidase  53.79 
 
 		 463 aa  398  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1379  cytosol aminopeptidase  54.05 
 
 		 479 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0148  Leucyl aminopeptidase  47.73 
 
 		 476 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0106  leucyl aminopeptidase  50 
 
 		 456 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1677  leucyl aminopeptidase  49.63 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1491  cytosol aminopeptidase  48.49 
 
 		 458 aa  385  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0686  cytosol aminopeptidase family protein  48.26 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0098  leucyl aminopeptidase  51.27 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02867  leucine aminopeptidase  46.67 
 
 		 456 aa  365  1e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0713  leucyl aminopeptidase  50.39 
 
 		 467 aa  362  6e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1080  Leucyl aminopeptidase  45.57 
 
 		 463 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0261  Leucyl aminopeptidase  44.64 
 
 		 455 aa  355  7.999999999999999e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.614863 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0252  Leucyl aminopeptidase  48.72 
 
 		 481 aa  354  2e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.749602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0215  leucyl aminopeptidase  45.57 
 
 		 455 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0245  leucyl aminopeptidase  49.36 
 
 		 455 aa  350  2e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.597485  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1112  leucyl aminopeptidase  52.08 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149662  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0419  leucyl aminopeptidase  52.27 
 
 		 411 aa  332  9e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00151993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4427  leucyl aminopeptidase  46.6 
 
 		 547 aa  322  9.000000000000001e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.213843  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  40.92 
 
 		 495 aa  231  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  36.13 
 
 		 493 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1251  aminopeptidase B  43.85 
 
 		 436 aa  224  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  40.71 
 
 		 497 aa  223  6e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0315  leucyl aminopeptidase  40.21 
 
 		 499 aa  223  7e-57  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  35.26 
 
 		 493 aa  223  8e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  37.47 
 
 		 496 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  39.3 
 
 		 503 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  39.6 
 
 		 497 aa  217  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  40.27 
 
 		 488 aa  216  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3020  aminopeptidase B  44.48 
 
 		 428 aa  215  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.486069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3620  aminopeptidase B  42.62 
 
 		 431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.412227 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2221  Leucyl aminopeptidase  41.64 
 
 		 539 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.258541 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2910  aminopeptidase B  42.81 
 
 		 427 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3073  Leucyl aminopeptidase  37.02 
 
 		 515 aa  213  7e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0332  leucyl aminopeptidase  41.26 
 
 		 496 aa  213  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00199325  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  40.59 
 
 		 497 aa  213  7e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  40.53 
 
 		 498 aa  213  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2798  aminopeptidase B  42.48 
 
 		 427 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1111  aminopeptidase B  43.29 
 
 		 431 aa  212  9e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2691  aminopeptidase B  42.48 
 
 		 427 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  39.22 
 
 		 496 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  40.59 
 
 		 497 aa  212  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  43.64 
 
 		 497 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2735  aminopeptidase B  42.48 
 
 		 427 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  38.75 
 
 		 487 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2556  hypothetical protein  40.23 
 
 		 483 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2776  aminopeptidase B  42.16 
 
 		 427 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.127629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  39.59 
 
 		 498 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2675  aminopeptidase B  42.16 
 
 		 427 aa  210  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.334715  normal  0.941339 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2898  aminopeptidase B  41.83 
 
 		 427 aa  210  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0369  leucyl aminopeptidase  36.87 
 
 		 500 aa  210  5e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  39.22 
 
 		 496 aa  210  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2807  aminopeptidase B  41.83 
 
 		 427 aa  209  6e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3754  aminopeptidase B  41.5 
 
 		 427 aa  209  8e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0773649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  39.94 
 
 		 503 aa  209  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  34.94 
 
 		 508 aa  209  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  40.35 
 
 		 500 aa  209  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  36.02 
 
 		 500 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  37.93 
 
 		 492 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  38.6 
 
 		 506 aa  208  1e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  40.8 
 
 		 501 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>