More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0292 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3359  leucyl aminopeptidase  78.82 
 
 		 465 aa  759    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4484  Leucyl aminopeptidase  79.48 
 
 		 463 aa  768    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4196  Leucyl aminopeptidase  80.35 
 
 		 463 aa  771    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0292  leucine aminopeptidase  100 
 
 		 462 aa  932    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144461  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0730  leucyl aminopeptidase  59.1 
 
 		 460 aa  504  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2181  cytosol aminopeptidase family protein  58.2 
 
 		 460 aa  495  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2093  cytosol aminopeptidase family protein  58.2 
 
 		 460 aa  496  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0979393  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3953  peptidase M17, leucyl aminopeptidase-like  56.29 
 
 		 455 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1264  cytosol aminopeptidase family protein  51.35 
 
 		 465 aa  465  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4207  Leucyl aminopeptidase  52.18 
 
 		 460 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.72513  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7039  leucine aminopeptidase  54.98 
 
 		 442 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0294  peptidase M17, leucyl aminopeptidase  53.2 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0242  leucyl aminopeptidase  54.92 
 
 		 458 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1777  leucyl aminopeptidase  53.15 
 
 		 460 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356947  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0384  leucyl aminopeptidase  53.48 
 
 		 460 aa  451  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2707  leucyl aminopeptidase  51.87 
 
 		 467 aa  439  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0281  leucyl aminopeptidase  52.73 
 
 		 455 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3040  leucyl aminopeptidase  53.81 
 
 		 491 aa  434  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  52.78 
 
 		 463 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0047  leucyl aminopeptidase  54.55 
 
 		 461 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0106  leucyl aminopeptidase  52.55 
 
 		 456 aa  422  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3720  leucyl aminopeptidase  53.62 
 
 		 460 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1126  Leucyl aminopeptidase  53.49 
 
 		 491 aa  419  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150295 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3455  leucyl aminopeptidase  51.42 
 
 		 472 aa  420  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3188  leucyl aminopeptidase  49.88 
 
 		 453 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1488  leucyl aminopeptidase  49.63 
 
 		 453 aa  412  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2976  leucyl aminopeptidase  53.1 
 
 		 469 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.32018 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2759  leucyl aminopeptidase  46.71 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.168747  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1677  leucyl aminopeptidase  47.12 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3202  Leucyl aminopeptidase  53.1 
 
 		 469 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3527  leucyl aminopeptidase  54.18 
 
 		 459 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0722387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0428  leucyl aminopeptidase  51.21 
 
 		 454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1379  cytosol aminopeptidase  54.31 
 
 		 479 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4585  leucyl aminopeptidase  51.57 
 
 		 473 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2687  hypothetical protein  47.1 
 
 		 454 aa  401  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2559  hypothetical protein  46.88 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0148  Leucyl aminopeptidase  47.88 
 
 		 476 aa  399  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0686  cytosol aminopeptidase family protein  45.92 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1858  Leucyl aminopeptidase  47.33 
 
 		 461 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1491  cytosol aminopeptidase  46.14 
 
 		 458 aa  398  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0038  leucyl aminopeptidase  54.07 
 
 		 461 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3158  Leucyl aminopeptidase  55.79 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3582  leucyl aminopeptidase  48.99 
 
 		 466 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369762  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4956  cytosol aminopeptidase family protein  47.42 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0261  Leucyl aminopeptidase  50.12 
 
 		 455 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.614863 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02867  leucine aminopeptidase  46 
 
 		 456 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3234  leucine aminopeptidase  51.06 
 
 		 463 aa  372  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1112  leucyl aminopeptidase  50.37 
 
 		 460 aa  371  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149662  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6389  leucyl aminopeptidase  52.7 
 
 		 452 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1080  Leucyl aminopeptidase  46.06 
 
 		 463 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0215  leucyl aminopeptidase  45.58 
 
 		 455 aa  359  5e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6782  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  50.72 
 
 		 455 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0713  leucyl aminopeptidase  45.99 
 
 		 467 aa  355  6.999999999999999e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0245  leucyl aminopeptidase  45.35 
 
 		 455 aa  355  7.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.597485  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0098  leucyl aminopeptidase  50.71 
 
 		 465 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0252  Leucyl aminopeptidase  45.58 
 
 		 481 aa  333  4e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.749602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0419  leucyl aminopeptidase  49.87 
 
 		 411 aa  319  5e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00151993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4427  leucyl aminopeptidase  41.53 
 
 		 547 aa  286  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.213843  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  41.45 
 
 		 497 aa  257  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  39.78 
 
 		 493 aa  256  4e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  39.52 
 
 		 493 aa  256  9e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  44.5 
 
 		 497 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  41.98 
 
 		 492 aa  249  8e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  43.04 
 
 		 497 aa  245  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  41.33 
 
 		 491 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  43.1 
 
 		 497 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  41.26 
 
 		 508 aa  244  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  42.78 
 
 		 497 aa  244  3e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  42.78 
 
 		 495 aa  244  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  41.8 
 
 		 488 aa  243  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  41.64 
 
 		 500 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  42.43 
 
 		 498 aa  242  9e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  40.91 
 
 		 498 aa  242  9e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  41.22 
 
 		 499 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2314  leucyl aminopeptidase  42.08 
 
 		 499 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  38.39 
 
 		 500 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  41.64 
 
 		 496 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  39.49 
 
 		 500 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  40.92 
 
 		 487 aa  239  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06390  leucyl aminopeptidase  42.15 
 
 		 488 aa  236  7e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0650  leucyl aminopeptidase  41.16 
 
 		 542 aa  236  7e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  42.94 
 
 		 518 aa  236  9e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0315  leucyl aminopeptidase  41.96 
 
 		 499 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  41.9 
 
 		 496 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  41.24 
 
 		 496 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0642  leucyl aminopeptidase  40.48 
 
 		 500 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2965  leucyl aminopeptidase  46.9 
 
 		 500 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  40.48 
 
 		 500 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  42.9 
 
 		 496 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0536  leucyl aminopeptidase  42.82 
 
 		 492 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  40.68 
 
 		 482 aa  232  8.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  40.62 
 
 		 503 aa  232  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  41.95 
 
 		 496 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  40.85 
 
 		 503 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  40.62 
 
 		 503 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  40.5 
 
 		 487 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  41.72 
 
 		 498 aa  231  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2339  leucyl aminopeptidase  40.37 
 
 		 500 aa  231  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  38.36 
 
 		 514 aa  230  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2471  leucyl aminopeptidase  40.56 
 
 		 503 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>