More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3359 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3359  leucyl aminopeptidase  100 
 
 		 465 aa  936    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4484  Leucyl aminopeptidase  82.31 
 
 		 463 aa  799    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0292  leucine aminopeptidase  78.82 
 
 		 462 aa  759    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144461  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4196  Leucyl aminopeptidase  81.88 
 
 		 463 aa  795    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0730  leucyl aminopeptidase  60.18 
 
 		 460 aa  514  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2093  cytosol aminopeptidase family protein  59.04 
 
 		 460 aa  497  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0979393  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2181  cytosol aminopeptidase family protein  59.04 
 
 		 460 aa  497  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1264  cytosol aminopeptidase family protein  52.97 
 
 		 465 aa  473  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3953  peptidase M17, leucyl aminopeptidase-like  58.84 
 
 		 455 aa  472  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7039  leucine aminopeptidase  58.57 
 
 		 442 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0294  peptidase M17, leucyl aminopeptidase  55.82 
 
 		 462 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0242  leucyl aminopeptidase  57.76 
 
 		 458 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4207  Leucyl aminopeptidase  53.52 
 
 		 460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.72513  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0281  leucyl aminopeptidase  55.35 
 
 		 455 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1777  leucyl aminopeptidase  53.99 
 
 		 460 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356947  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0384  leucyl aminopeptidase  55.88 
 
 		 460 aa  448  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1126  Leucyl aminopeptidase  56.42 
 
 		 491 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150295 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3040  leucyl aminopeptidase  55.61 
 
 		 491 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2707  leucyl aminopeptidase  53.16 
 
 		 467 aa  441  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0428  leucyl aminopeptidase  55.56 
 
 		 454 aa  433  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0047  leucyl aminopeptidase  56.37 
 
 		 461 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0106  leucyl aminopeptidase  52.53 
 
 		 456 aa  424  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3720  leucyl aminopeptidase  55.08 
 
 		 460 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3455  leucyl aminopeptidase  50.55 
 
 		 472 aa  417  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1379  cytosol aminopeptidase  57.08 
 
 		 479 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3527  leucyl aminopeptidase  53.56 
 
 		 459 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0722387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  52 
 
 		 463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2759  leucyl aminopeptidase  45.82 
 
 		 453 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.168747  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1488  leucyl aminopeptidase  47.48 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2976  leucyl aminopeptidase  55.79 
 
 		 469 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.32018 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3188  leucyl aminopeptidase  47.48 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1858  Leucyl aminopeptidase  47.65 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4585  leucyl aminopeptidase  51.82 
 
 		 473 aa  396  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1677  leucyl aminopeptidase  45.78 
 
 		 453 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0148  Leucyl aminopeptidase  46.62 
 
 		 476 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0038  leucyl aminopeptidase  56.22 
 
 		 461 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3582  leucyl aminopeptidase  51.24 
 
 		 466 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369762  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3202  Leucyl aminopeptidase  55.56 
 
 		 469 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2687  hypothetical protein  46.65 
 
 		 454 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2559  hypothetical protein  46.65 
 
 		 454 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1491  cytosol aminopeptidase  46.43 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0686  cytosol aminopeptidase family protein  46.67 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0261  Leucyl aminopeptidase  49.88 
 
 		 455 aa  376  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.614863 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3234  leucine aminopeptidase  53.57 
 
 		 463 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02867  leucine aminopeptidase  46.53 
 
 		 456 aa  376  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3158  Leucyl aminopeptidase  52.93 
 
 		 469 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6389  leucyl aminopeptidase  53.75 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4956  cytosol aminopeptidase family protein  46.3 
 
 		 453 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6782  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  53.27 
 
 		 455 aa  363  4e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0215  leucyl aminopeptidase  46.04 
 
 		 455 aa  359  6e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0713  leucyl aminopeptidase  47.45 
 
 		 467 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0245  leucyl aminopeptidase  45.81 
 
 		 455 aa  355  8.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.597485  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1112  leucyl aminopeptidase  49.5 
 
 		 460 aa  349  6e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149662  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1080  Leucyl aminopeptidase  43.41 
 
 		 463 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0098  leucyl aminopeptidase  48.69 
 
 		 465 aa  332  7.000000000000001e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0252  Leucyl aminopeptidase  44.7 
 
 		 481 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.749602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0419  leucyl aminopeptidase  47.97 
 
 		 411 aa  306  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00151993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4427  leucyl aminopeptidase  41.75 
 
 		 547 aa  283  6.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.213843  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  35.46 
 
 		 493 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  41.06 
 
 		 497 aa  245  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  39.42 
 
 		 493 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0315  leucyl aminopeptidase  40.44 
 
 		 499 aa  242  1e-62  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  42.9 
 
 		 497 aa  242  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  40.05 
 
 		 500 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  37.21 
 
 		 508 aa  233  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0650  leucyl aminopeptidase  43.02 
 
 		 542 aa  233  8.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  39.23 
 
 		 491 aa  232  9e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  41.08 
 
 		 500 aa  230  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  39.56 
 
 		 497 aa  229  6e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  39.56 
 
 		 497 aa  229  7e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  40 
 
 		 500 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  41.07 
 
 		 499 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  40.56 
 
 		 497 aa  228  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  39.78 
 
 		 492 aa  227  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  41.93 
 
 		 496 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  41.11 
 
 		 498 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2221  Leucyl aminopeptidase  43.99 
 
 		 539 aa  226  6e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.258541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  42.61 
 
 		 496 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13861  leucyl aminopeptidase  39.25 
 
 		 493 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0993846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  42.57 
 
 		 500 aa  224  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  41.21 
 
 		 495 aa  224  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  35.03 
 
 		 511 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  35.03 
 
 		 511 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2965  leucyl aminopeptidase  37.63 
 
 		 500 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  36.28 
 
 		 518 aa  223  6e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  35.03 
 
 		 511 aa  223  7e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  36.05 
 
 		 510 aa  222  9e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1500  Leucyl aminopeptidase  32.03 
 
 		 482 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  41.74 
 
 		 498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  35.81 
 
 		 510 aa  220  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  35.81 
 
 		 510 aa  220  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  35.81 
 
 		 510 aa  220  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06390  leucyl aminopeptidase  41.62 
 
 		 488 aa  219  6e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  39.4 
 
 		 496 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  38.15 
 
 		 495 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1251  aminopeptidase B  41.12 
 
 		 436 aa  217  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  41.19 
 
 		 496 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  38.62 
 
 		 488 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2996  leucyl aminopeptidase  35.85 
 
 		 515 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3073  Leucyl aminopeptidase  38.84 
 
 		 515 aa  216  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>