More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2221 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2221  Leucyl aminopeptidase  100 
 
 
539 aa  1062    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.258541 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0650  leucyl aminopeptidase  69.53 
 
 
542 aa  724    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  59.45 
 
 
500 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  62.29 
 
 
499 aa  600  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  59.07 
 
 
500 aa  592  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  61.22 
 
 
498 aa  578  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2339  leucyl aminopeptidase  57.83 
 
 
500 aa  578  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  58.42 
 
 
500 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5835  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  60.19 
 
 
500 aa  568  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2314  leucyl aminopeptidase  58.23 
 
 
499 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2965  leucyl aminopeptidase  58.2 
 
 
500 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434941  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  58.75 
 
 
497 aa  552  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  59.58 
 
 
496 aa  551  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0557  leucyl aminopeptidase  57.14 
 
 
503 aa  545  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0287473 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  60.21 
 
 
496 aa  547  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3944  Leucyl aminopeptidase  57.67 
 
 
497 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3651  leucyl aminopeptidase  57.5 
 
 
497 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3937  Leucyl aminopeptidase  57.12 
 
 
497 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0971426 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  59.45 
 
 
495 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  60.04 
 
 
497 aa  537  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  65.53 
 
 
497 aa  533  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  65.53 
 
 
497 aa  533  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5097  leucyl aminopeptidase  59.57 
 
 
500 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803796  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  63.92 
 
 
498 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1545  leucyl aminopeptidase  59.92 
 
 
497 aa  506  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.87214  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  54.77 
 
 
500 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2531  leucyl aminopeptidase  56.09 
 
 
493 aa  467  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.353426  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  60 
 
 
487 aa  429  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  57.84 
 
 
514 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1227  leucyl aminopeptidase  48.67 
 
 
494 aa  432  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.494822 
 
 
-
 
NC_002978  WD0054  leucyl aminopeptidase  52.9 
 
 
500 aa  422  1e-117  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1191  leucyl aminopeptidase  58.13 
 
 
488 aa  423  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239585  normal  0.359971 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0642  leucyl aminopeptidase  57.52 
 
 
500 aa  419  1e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0369  leucyl aminopeptidase  54 
 
 
500 aa  413  1e-114  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1815  leucyl aminopeptidase  46.47 
 
 
488 aa  410  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1122  leucyl aminopeptidase  45.45 
 
 
489 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0412  leucyl aminopeptidase  58.31 
 
 
489 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0249677 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1761  leucyl aminopeptidase  47.88 
 
 
481 aa  397  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1543  leucyl aminopeptidase  45.56 
 
 
489 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0890  leucyl aminopeptidase  57.07 
 
 
485 aa  385  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119935  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2899  leucyl aminopeptidase  45.37 
 
 
489 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.886783  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0903  leucyl aminopeptidase  47.62 
 
 
533 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0950  leucyl aminopeptidase  48.76 
 
 
491 aa  366  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111685  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  41.57 
 
 
508 aa  352  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  51.57 
 
 
506 aa  349  7e-95  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  47.98 
 
 
497 aa  332  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  38.43 
 
 
510 aa  330  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2996  leucyl aminopeptidase  38.63 
 
 
515 aa  327  5e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  38.19 
 
 
510 aa  326  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  38.19 
 
 
510 aa  326  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  38.39 
 
 
510 aa  326  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  37.43 
 
 
511 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  37.43 
 
 
511 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  37.43 
 
 
511 aa  324  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  37.4 
 
 
518 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  40.66 
 
 
496 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  47.63 
 
 
491 aa  317  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0959  cytosol aminopeptidase  37.62 
 
 
511 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2389  leucyl aminopeptidase  48.27 
 
 
556 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0738051 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  45.74 
 
 
492 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  42.14 
 
 
496 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  42.47 
 
 
496 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  42.11 
 
 
497 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  47.64 
 
 
487 aa  309  6.999999999999999e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  41.58 
 
 
497 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  47.93 
 
 
492 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  41.45 
 
 
496 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  44.94 
 
 
482 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  38.79 
 
 
496 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  41.45 
 
 
497 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  41.67 
 
 
496 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  41.2 
 
 
512 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  41.5 
 
 
497 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  47.15 
 
 
488 aa  303  6.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  39.15 
 
 
496 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4007  leucyl aminopeptidase  47.52 
 
 
486 aa  302  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.502988 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1233  Leucyl aminopeptidase  49.85 
 
 
536 aa  301  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  43.92 
 
 
493 aa  299  7e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3638  leucyl aminopeptidase  39.96 
 
 
508 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  51.68 
 
 
500 aa  298  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0623  leucyl aminopeptidase  52.35 
 
 
536 aa  297  3e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022147  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0388  leucyl aminopeptidase  37.77 
 
 
510 aa  297  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00389759  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1372  PepA aminopeptidase  46.31 
 
 
500 aa  296  4e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00219967  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0871  leucyl aminopeptidase  39.21 
 
 
502 aa  297  4e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238632  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0516  leucyl aminopeptidase  46.59 
 
 
495 aa  297  4e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.204663  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0043  PepA aminopeptidase  41.73 
 
 
552 aa  296  5e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.727266  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2519  leucyl aminopeptidase  43.95 
 
 
522 aa  296  7e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.164338  normal  0.0174769 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  43.13 
 
 
493 aa  296  9e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  39.61 
 
 
495 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  45.17 
 
 
503 aa  295  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2787  leucyl aminopeptidase  46.61 
 
 
499 aa  295  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151843  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  40.12 
 
 
495 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  39.23 
 
 
498 aa  295  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0984  leucyl aminopeptidase  41.45 
 
 
508 aa  295  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  44.09 
 
 
503 aa  295  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  42.64 
 
 
497 aa  295  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  45.93 
 
 
503 aa  295  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1076  leucyl aminopeptidase  38.56 
 
 
502 aa  294  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0190451  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  39.05 
 
 
511 aa  294  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0910  leucyl aminopeptidase  38.34 
 
 
502 aa  293  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000452493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>