More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2996 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0388  leucyl aminopeptidase  77.64 
 
 
510 aa  782    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00389759  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2996  leucyl aminopeptidase  100 
 
 
515 aa  1048    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  55.47 
 
 
511 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  55.47 
 
 
511 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  55.47 
 
 
511 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  55.42 
 
 
510 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  55.42 
 
 
510 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  55.42 
 
 
510 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  55.22 
 
 
510 aa  535  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  55.02 
 
 
518 aa  532  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0959  cytosol aminopeptidase  54.78 
 
 
511 aa  526  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  53.59 
 
 
508 aa  501  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  42.39 
 
 
497 aa  358  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  43.67 
 
 
495 aa  346  5e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  42.04 
 
 
496 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  42.66 
 
 
496 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  41.46 
 
 
500 aa  342  7e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  44.12 
 
 
500 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  41.18 
 
 
500 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2339  leucyl aminopeptidase  41.18 
 
 
500 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3944  Leucyl aminopeptidase  41.05 
 
 
497 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3651  leucyl aminopeptidase  41.05 
 
 
497 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2314  leucyl aminopeptidase  41.4 
 
 
499 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  41.56 
 
 
499 aa  326  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  41.46 
 
 
500 aa  325  9e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0369  leucyl aminopeptidase  40.83 
 
 
500 aa  324  3e-87  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  40.81 
 
 
497 aa  323  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3937  Leucyl aminopeptidase  40.09 
 
 
497 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0971426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  39.13 
 
 
498 aa  320  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0054  leucyl aminopeptidase  41.2 
 
 
500 aa  319  7e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0557  leucyl aminopeptidase  41.24 
 
 
503 aa  319  7e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0287473 
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  39.87 
 
 
497 aa  317  4e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  39.87 
 
 
497 aa  316  5e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2221  Leucyl aminopeptidase  37.84 
 
 
539 aa  316  7e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.258541 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  40.46 
 
 
487 aa  315  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2965  leucyl aminopeptidase  40.85 
 
 
500 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434941  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  39.15 
 
 
498 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5835  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  39.69 
 
 
500 aa  309  8e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0642  leucyl aminopeptidase  40.76 
 
 
500 aa  309  9e-83  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1545  leucyl aminopeptidase  40.96 
 
 
497 aa  302  9e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.87214  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1761  leucyl aminopeptidase  41.39 
 
 
481 aa  300  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  40.21 
 
 
506 aa  298  2e-79  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0650  leucyl aminopeptidase  36.22 
 
 
542 aa  297  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1191  leucyl aminopeptidase  39.25 
 
 
488 aa  296  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239585  normal  0.359971 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  40.13 
 
 
497 aa  296  8e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2531  leucyl aminopeptidase  39.82 
 
 
493 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.353426  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5097  leucyl aminopeptidase  38.58 
 
 
500 aa  295  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803796  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1227  leucyl aminopeptidase  37.23 
 
 
494 aa  292  8e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.494822 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  39.74 
 
 
497 aa  289  9e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  38.84 
 
 
514 aa  287  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1122  leucyl aminopeptidase  37 
 
 
489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  38.64 
 
 
497 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  39.75 
 
 
496 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  38.55 
 
 
496 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  38.84 
 
 
497 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  38.84 
 
 
497 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  39.86 
 
 
491 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  40.74 
 
 
487 aa  280  4e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0412  leucyl aminopeptidase  38.01 
 
 
489 aa  280  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0249677 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  38.78 
 
 
488 aa  278  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  37.58 
 
 
496 aa  277  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  36.42 
 
 
492 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  36.94 
 
 
495 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1815  leucyl aminopeptidase  35.99 
 
 
488 aa  274  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1500  Leucyl aminopeptidase  37.1 
 
 
482 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  38.06 
 
 
496 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  36.59 
 
 
501 aa  272  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  36.59 
 
 
496 aa  272  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  38.35 
 
 
512 aa  272  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  36.06 
 
 
511 aa  270  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2684  hypothetical protein  38.66 
 
 
483 aa  270  7e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2556  hypothetical protein  38.9 
 
 
483 aa  269  8.999999999999999e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1543  leucyl aminopeptidase  41.92 
 
 
489 aa  267  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0008  Leucyl aminopeptidase  38.16 
 
 
502 aa  266  8e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2899  leucyl aminopeptidase  41.92 
 
 
489 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.886783  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  36.55 
 
 
506 aa  265  2e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  38.27 
 
 
503 aa  264  3e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0098  leucyl aminopeptidase  38.41 
 
 
491 aa  264  3e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15181  leucyl aminopeptidase  38.88 
 
 
490 aa  264  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0950  leucyl aminopeptidase  43.3 
 
 
491 aa  264  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111685  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  38.37 
 
 
495 aa  264  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  37.04 
 
 
503 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1430  leucyl aminopeptidase  38.65 
 
 
490 aa  263  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  36.9 
 
 
518 aa  263  6e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0332  leucyl aminopeptidase  37.58 
 
 
496 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00199325  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1855  leucyl aminopeptidase  36.4 
 
 
503 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2466  leucyl aminopeptidase  36.4 
 
 
503 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0114  leucyl aminopeptidase  38.2 
 
 
491 aa  263  8e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0623  leucyl aminopeptidase  38.96 
 
 
536 aa  262  8e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14470  leucyl aminopeptidase  37.05 
 
 
495 aa  263  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  37.04 
 
 
503 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17591  leucyl aminopeptidase  35.31 
 
 
495 aa  262  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.697239  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  39.86 
 
 
482 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0795  leucyl aminopeptidase  36.44 
 
 
502 aa  261  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0903  leucyl aminopeptidase  35.54 
 
 
495 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  37.01 
 
 
503 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3109  leucyl aminopeptidase  35.88 
 
 
502 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000897805  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0315  leucyl aminopeptidase  37.33 
 
 
499 aa  260  3e-68  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2471  leucyl aminopeptidase  36.2 
 
 
503 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3119  leucyl aminopeptidase  35.88 
 
 
502 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000969621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>