More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3527 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0294  peptidase M17, leucyl aminopeptidase  73.86 
 
 		 462 aa  666    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4207  Leucyl aminopeptidase  85.53 
 
 		 460 aa  771    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.72513  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1777  leucyl aminopeptidase  90.43 
 
 		 460 aa  804    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356947  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3720  leucyl aminopeptidase  77.41 
 
 		 460 aa  680    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3527  leucyl aminopeptidase  100 
 
 		 459 aa  922    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0722387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0384  leucyl aminopeptidase  76.37 
 
 		 460 aa  672    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7039  leucine aminopeptidase  74.43 
 
 		 442 aa  662    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3040  leucyl aminopeptidase  62.19 
 
 		 491 aa  514  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1126  Leucyl aminopeptidase  60.04 
 
 		 491 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150295 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0281  leucyl aminopeptidase  61.61 
 
 		 455 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0730  leucyl aminopeptidase  59.78 
 
 		 460 aa  498  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2181  cytosol aminopeptidase family protein  59.33 
 
 		 460 aa  492  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2093  cytosol aminopeptidase family protein  59.55 
 
 		 460 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0979393  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0242  leucyl aminopeptidase  57.99 
 
 		 458 aa  484  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4484  Leucyl aminopeptidase  53.81 
 
 		 463 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3582  leucyl aminopeptidase  57.78 
 
 		 466 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369762  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4196  Leucyl aminopeptidase  53.36 
 
 		 463 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0292  leucine aminopeptidase  54.18 
 
 		 462 aa  465  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144461  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3359  leucyl aminopeptidase  53.56 
 
 		 465 aa  465  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2976  leucyl aminopeptidase  59.24 
 
 		 469 aa  463  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.32018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3202  Leucyl aminopeptidase  59.02 
 
 		 469 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  56.86 
 
 		 463 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3953  peptidase M17, leucyl aminopeptidase-like  57.24 
 
 		 455 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6389  leucyl aminopeptidase  60.4 
 
 		 452 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6782  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  59.15 
 
 		 455 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3158  Leucyl aminopeptidase  58.8 
 
 		 469 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4585  leucyl aminopeptidase  49.68 
 
 		 473 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3455  leucyl aminopeptidase  49.78 
 
 		 472 aa  421  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1264  cytosol aminopeptidase family protein  48.47 
 
 		 465 aa  420  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0047  leucyl aminopeptidase  50.65 
 
 		 461 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0428  leucyl aminopeptidase  50.45 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2707  leucyl aminopeptidase  53.13 
 
 		 467 aa  406  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3188  leucyl aminopeptidase  45.54 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1379  cytosol aminopeptidase  51.87 
 
 		 479 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1858  Leucyl aminopeptidase  46.32 
 
 		 461 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4956  cytosol aminopeptidase family protein  45.8 
 
 		 453 aa  392  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3234  leucine aminopeptidase  52.93 
 
 		 463 aa  392  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2759  leucyl aminopeptidase  44.77 
 
 		 453 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.168747  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0038  leucyl aminopeptidase  50.55 
 
 		 461 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0106  leucyl aminopeptidase  50.66 
 
 		 456 aa  385  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0148  Leucyl aminopeptidase  48.36 
 
 		 476 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1491  cytosol aminopeptidase  47.79 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0686  cytosol aminopeptidase family protein  47.55 
 
 		 458 aa  382  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2687  hypothetical protein  44.52 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2559  hypothetical protein  44.52 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1488  leucyl aminopeptidase  43.37 
 
 		 453 aa  378  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1677  leucyl aminopeptidase  43.72 
 
 		 453 aa  373  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02867  leucine aminopeptidase  47.79 
 
 		 456 aa  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0098  leucyl aminopeptidase  52.35 
 
 		 465 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0261  Leucyl aminopeptidase  45.39 
 
 		 455 aa  363  3e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.614863 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0713  leucyl aminopeptidase  50.52 
 
 		 467 aa  356  5e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1080  Leucyl aminopeptidase  45.58 
 
 		 463 aa  355  1e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0215  leucyl aminopeptidase  50 
 
 		 455 aa  348  8e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1112  leucyl aminopeptidase  51.3 
 
 		 460 aa  347  2e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149662  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0245  leucyl aminopeptidase  49.74 
 
 		 455 aa  346  4e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.597485  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0252  Leucyl aminopeptidase  47.33 
 
 		 481 aa  344  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.749602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0419  leucyl aminopeptidase  52.55 
 
 		 411 aa  334  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00151993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4427  leucyl aminopeptidase  43.85 
 
 		 547 aa  313  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.213843  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  37.25 
 
 		 497 aa  226  7e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  37.82 
 
 		 496 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  36.46 
 
 		 488 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  39.89 
 
 		 487 aa  216  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2556  hypothetical protein  36.88 
 
 		 483 aa  215  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  35.67 
 
 		 497 aa  215  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2684  hypothetical protein  36.64 
 
 		 483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  31.71 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  36.18 
 
 		 497 aa  213  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  36.41 
 
 		 497 aa  213  7e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0315  leucyl aminopeptidase  39.23 
 
 		 499 aa  213  7.999999999999999e-54  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  36.36 
 
 		 495 aa  212  9e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  36.9 
 
 		 500 aa  212  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  43.86 
 
 		 495 aa  212  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  30.8 
 
 		 493 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2646  Leucyl aminopeptidase  37.77 
 
 		 507 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  36.77 
 
 		 498 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1251  aminopeptidase B  43.71 
 
 		 436 aa  211  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8418  Leucyl aminopeptidase  43.66 
 
 		 491 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00871794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  37.46 
 
 		 503 aa  209  7e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17591  leucyl aminopeptidase  31.56 
 
 		 495 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.697239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0903  leucyl aminopeptidase  31.33 
 
 		 495 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3091  Leucyl aminopeptidase  37.53 
 
 		 545 aa  208  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00268238  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10530  leucyl aminopeptidase  40.16 
 
 		 498 aa  208  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46137  normal  0.123845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  37.33 
 
 		 482 aa  207  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3020  aminopeptidase B  43.71 
 
 		 428 aa  207  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.486069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06390  leucyl aminopeptidase  38 
 
 		 488 aa  207  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  41.16 
 
 		 501 aa  207  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3894  Leucyl aminopeptidase  38.41 
 
 		 505 aa  206  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0332  leucyl aminopeptidase  38.57 
 
 		 496 aa  206  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00199325  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02660  leucyl aminopeptidase  39.83 
 
 		 490 aa  206  7e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  36.56 
 
 		 496 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  37.77 
 
 		 492 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  41.05 
 
 		 503 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0536  leucyl aminopeptidase  40.06 
 
 		 492 aa  205  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3016  leucyl aminopeptidase  41.69 
 
 		 479 aa  205  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  38.89 
 
 		 497 aa  205  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  39.55 
 
 		 496 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  34.78 
 
 		 514 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  37.53 
 
 		 498 aa  204  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1545  leucyl aminopeptidase  41.54 
 
 		 497 aa  203  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.87214  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3073  Leucyl aminopeptidase  37.47 
 
 		 515 aa  202  7e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>