More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0242 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0242  leucyl aminopeptidase  100 
 
 
458 aa  914    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2181  cytosol aminopeptidase family protein  62.09 
 
 
460 aa  524  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2093  cytosol aminopeptidase family protein  62.09 
 
 
460 aa  523  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0979393  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0730  leucyl aminopeptidase  60.09 
 
 
460 aa  512  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4207  Leucyl aminopeptidase  58.13 
 
 
460 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.72513  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1264  cytosol aminopeptidase family protein  54.98 
 
 
465 aa  484  1e-135  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3953  peptidase M17, leucyl aminopeptidase-like  61.24 
 
 
455 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3359  leucyl aminopeptidase  58 
 
 
465 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452222  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1777  leucyl aminopeptidase  57.05 
 
 
460 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356947  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1126  Leucyl aminopeptidase  60.33 
 
 
491 aa  473  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150295 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0292  leucine aminopeptidase  55.16 
 
 
462 aa  470  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144461  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7039  leucine aminopeptidase  59.76 
 
 
442 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0294  peptidase M17, leucyl aminopeptidase  59.14 
 
 
462 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3040  leucyl aminopeptidase  58.31 
 
 
491 aa  467  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156342  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3720  leucyl aminopeptidase  58.13 
 
 
460 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0384  leucyl aminopeptidase  58.13 
 
 
460 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4484  Leucyl aminopeptidase  52.35 
 
 
463 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3527  leucyl aminopeptidase  58.21 
 
 
459 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0722387  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4196  Leucyl aminopeptidase  51.45 
 
 
463 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  56.25 
 
 
463 aa  449  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0281  leucyl aminopeptidase  60.49 
 
 
455 aa  451  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3188  leucyl aminopeptidase  49.78 
 
 
453 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3582  leucyl aminopeptidase  55.16 
 
 
466 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369762  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6782  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  57.4 
 
 
455 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0428  leucyl aminopeptidase  54.57 
 
 
454 aa  432  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2707  leucyl aminopeptidase  52.41 
 
 
467 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1488  leucyl aminopeptidase  48.46 
 
 
453 aa  428  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2759  leucyl aminopeptidase  50.11 
 
 
453 aa  430  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.168747  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1858  Leucyl aminopeptidase  49.57 
 
 
461 aa  428  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1677  leucyl aminopeptidase  49.55 
 
 
453 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6389  leucyl aminopeptidase  58.35 
 
 
452 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0047  leucyl aminopeptidase  53.29 
 
 
461 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168796  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2976  leucyl aminopeptidase  55.13 
 
 
469 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.32018 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4956  cytosol aminopeptidase family protein  48.77 
 
 
453 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0148  Leucyl aminopeptidase  50.66 
 
 
476 aa  416  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736784  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1379  cytosol aminopeptidase  53.22 
 
 
479 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3455  leucyl aminopeptidase  50.66 
 
 
472 aa  412  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1491  cytosol aminopeptidase  46.41 
 
 
458 aa  410  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4585  leucyl aminopeptidase  50.55 
 
 
473 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3202  Leucyl aminopeptidase  54.91 
 
 
469 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489554  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0686  cytosol aminopeptidase family protein  46.62 
 
 
458 aa  411  1e-113  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0106  leucyl aminopeptidase  52.24 
 
 
456 aa  408  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0038  leucyl aminopeptidase  52.76 
 
 
461 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3158  Leucyl aminopeptidase  55.58 
 
 
469 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0713  leucyl aminopeptidase  55.38 
 
 
467 aa  394  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2687  hypothetical protein  49.03 
 
 
454 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3234  leucine aminopeptidase  52.89 
 
 
463 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179734  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2559  hypothetical protein  48.55 
 
 
454 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02867  leucine aminopeptidase  48.45 
 
 
456 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1080  Leucyl aminopeptidase  49.65 
 
 
463 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0261  Leucyl aminopeptidase  46.58 
 
 
455 aa  372  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.614863 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0098  leucyl aminopeptidase  52.29 
 
 
465 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0252  Leucyl aminopeptidase  48.85 
 
 
481 aa  363  3e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.749602  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0245  leucyl aminopeptidase  46.92 
 
 
455 aa  358  9.999999999999999e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.597485  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0215  leucyl aminopeptidase  46.92 
 
 
455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1112  leucyl aminopeptidase  50.12 
 
 
460 aa  357  1.9999999999999998e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149662  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0419  leucyl aminopeptidase  49.37 
 
 
411 aa  326  5e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00151993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4427  leucyl aminopeptidase  44.81 
 
 
547 aa  299  7e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.213843  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  36.6 
 
 
503 aa  230  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  35.86 
 
 
497 aa  227  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  39.29 
 
 
501 aa  226  9e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8418  Leucyl aminopeptidase  43.6 
 
 
491 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00871794  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  36.02 
 
 
493 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  35.48 
 
 
493 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  38.67 
 
 
482 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  37.5 
 
 
487 aa  221  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_002620  TC0315  leucyl aminopeptidase  33.95 
 
 
499 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  39.24 
 
 
488 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0823  leucyl aminopeptidase  36.4 
 
 
528 aa  220  5e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  36.12 
 
 
497 aa  219  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  34.25 
 
 
508 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  38.34 
 
 
492 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  38.13 
 
 
498 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2646  Leucyl aminopeptidase  37.33 
 
 
507 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  37.67 
 
 
496 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3073  Leucyl aminopeptidase  36.78 
 
 
515 aa  216  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1251  aminopeptidase B  40.06 
 
 
436 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10530  leucyl aminopeptidase  40.44 
 
 
498 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46137  normal  0.123845 
 
 
-
 
NC_002936  DET1030  cytosol aminopeptidase family protein  37.13 
 
 
495 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.414121  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3620  aminopeptidase B  41.69 
 
 
431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.412227 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  39.42 
 
 
503 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2847  Leucyl aminopeptidase  38.52 
 
 
462 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0098  leucyl aminopeptidase  38.07 
 
 
491 aa  214  3.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  36.59 
 
 
491 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06390  leucyl aminopeptidase  38.7 
 
 
488 aa  213  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1518  Leucyl aminopeptidase  38.64 
 
 
505 aa  213  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2121  Leucyl aminopeptidase  38.12 
 
 
465 aa  213  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0945  Leucyl aminopeptidase  38.04 
 
 
495 aa  213  7.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.593268  normal  0.199741 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3020  aminopeptidase B  41.79 
 
 
428 aa  212  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.486069  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0114  leucyl aminopeptidase  37.8 
 
 
491 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3091  Leucyl aminopeptidase  39.29 
 
 
545 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00268238  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1111  aminopeptidase B  40.18 
 
 
431 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  35.12 
 
 
500 aa  210  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15321  leucyl aminopeptidase  35.93 
 
 
490 aa  211  3e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113645  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  38.48 
 
 
503 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  38.48 
 
 
503 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  37 
 
 
495 aa  209  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0913  leucyl aminopeptidase  37.76 
 
 
497 aa  209  8e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00605227  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  38.2 
 
 
503 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3638  leucyl aminopeptidase  39.78 
 
 
508 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>