More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3620 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02415  aminopeptidase B  76.65 
 
 
427 aa  684    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1145  PepB aminopeptidase  76.42 
 
 
427 aa  681    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2675  aminopeptidase B  76.42 
 
 
427 aa  681    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.334715  normal  0.941339 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1175  aminopeptidase B  83.76 
 
 
432 aa  719    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02379  hypothetical protein  76.65 
 
 
427 aa  684    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2674  aminopeptidase B  76.65 
 
 
427 aa  684    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2735  aminopeptidase B  76.65 
 
 
427 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1111  aminopeptidase B  81.4 
 
 
431 aa  725    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2807  aminopeptidase B  76.65 
 
 
427 aa  683    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1154  aminopeptidase B  76.65 
 
 
427 aa  684    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.571702  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1251  aminopeptidase B  79.59 
 
 
436 aa  723    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2910  aminopeptidase B  76.42 
 
 
427 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2798  aminopeptidase B  76.42 
 
 
427 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0428  aminopeptidase B  83.99 
 
 
432 aa  719    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0152446 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2691  aminopeptidase B  76.65 
 
 
427 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1284  aminopeptidase B  83.99 
 
 
432 aa  719    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3024  aminopeptidase B  80.05 
 
 
436 aa  706    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3620  aminopeptidase B  100 
 
 
431 aa  887    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.412227 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2776  aminopeptidase B  76.42 
 
 
427 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.127629  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3754  aminopeptidase B  76.42 
 
 
427 aa  684    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0773649  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2744  aminopeptidase B  77.67 
 
 
431 aa  706    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3020  aminopeptidase B  78.69 
 
 
428 aa  701    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.486069  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2898  aminopeptidase B  76.18 
 
 
427 aa  681    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0284  aminopeptidase B  63.26 
 
 
444 aa  552  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000940358  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004353  peptidase B  61.48 
 
 
432 aa  543  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01063  aminopeptidase B  61.25 
 
 
432 aa  538  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0724  aminopeptidase B  58.35 
 
 
428 aa  514  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0388  aminopeptidase B  54.86 
 
 
432 aa  482  1e-135  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1331  aminopeptidase B  52.45 
 
 
430 aa  429  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03542  aminopeptidase B  50.12 
 
 
427 aa  387  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.542344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3939  aminopeptidase B  49.65 
 
 
427 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0177872  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0732  aminopeptidase B  49.41 
 
 
430 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.354298  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3290  aminopeptidase B  49.41 
 
 
430 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0811496  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3402  aminopeptidase B  49.41 
 
 
430 aa  368  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329172  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3897  aminopeptidase B  48.83 
 
 
425 aa  368  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000551018  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0876  aminopeptidase B  48.95 
 
 
430 aa  368  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0851  aminopeptidase B  48.71 
 
 
430 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0564322  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0886  aminopeptidase B  49.18 
 
 
430 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00154552  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3126  aminopeptidase B  48.95 
 
 
430 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0275669  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0874  aminopeptidase B  48.95 
 
 
430 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0348435  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3488  aminopeptidase B  48.71 
 
 
430 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120363  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0782  aminopeptidase B  49.77 
 
 
427 aa  364  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3274  aminopeptidase B  49.29 
 
 
424 aa  362  6e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00646362  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0700  aminopeptidase B  49.42 
 
 
425 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0481686  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3168  aminopeptidase B  48.71 
 
 
425 aa  351  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000320963  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3127  aminopeptidase B  46.95 
 
 
425 aa  347  2e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.353364  normal  0.0427055 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3796  aminopeptidase B  45.54 
 
 
425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.103934  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  44.61 
 
 
463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  42.63 
 
 
482 aa  220  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0281  leucyl aminopeptidase  41.44 
 
 
455 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  42.37 
 
 
487 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0252  Leucyl aminopeptidase  46.69 
 
 
481 aa  216  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.749602  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0713  leucyl aminopeptidase  41.1 
 
 
467 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2559  hypothetical protein  41.25 
 
 
454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0148  Leucyl aminopeptidase  42.27 
 
 
476 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736784  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8418  Leucyl aminopeptidase  41.25 
 
 
491 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00871794  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2687  hypothetical protein  41.07 
 
 
454 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1112  leucyl aminopeptidase  44.58 
 
 
460 aa  212  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149662  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  41.43 
 
 
488 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0823  leucyl aminopeptidase  42.28 
 
 
503 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0242  leucyl aminopeptidase  41.69 
 
 
458 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2181  cytosol aminopeptidase family protein  40.94 
 
 
460 aa  211  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2093  cytosol aminopeptidase family protein  40.94 
 
 
460 aa  210  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0979393  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  41.98 
 
 
503 aa  211  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  41.8 
 
 
503 aa  210  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  41.49 
 
 
503 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0880  leucyl aminopeptidase  43.44 
 
 
616 aa  209  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1264  cytosol aminopeptidase family protein  39.14 
 
 
465 aa  209  8e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  41.49 
 
 
503 aa  209  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0686  cytosol aminopeptidase family protein  39.61 
 
 
458 aa  209  1e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1491  cytosol aminopeptidase  39.29 
 
 
458 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  41.67 
 
 
503 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0672  leucyl aminopeptidase  41.67 
 
 
503 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131904  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  41.67 
 
 
503 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1180  Leucyl aminopeptidase  39.62 
 
 
485 aa  208  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746121  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  41.67 
 
 
503 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  41.67 
 
 
503 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  41.67 
 
 
503 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16420  leucyl aminopeptidase  42.41 
 
 
492 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  41.67 
 
 
503 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2471  leucyl aminopeptidase  41.49 
 
 
503 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3188  leucyl aminopeptidase  38.44 
 
 
453 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4484  Leucyl aminopeptidase  40.26 
 
 
463 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1858  Leucyl aminopeptidase  34.54 
 
 
461 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1855  leucyl aminopeptidase  41.49 
 
 
503 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2466  leucyl aminopeptidase  41.49 
 
 
503 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2759  leucyl aminopeptidase  38.51 
 
 
453 aa  206  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.168747  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  40.89 
 
 
487 aa  206  9e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4196  Leucyl aminopeptidase  40.26 
 
 
463 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0292  leucine aminopeptidase  41.58 
 
 
462 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144461  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2684  hypothetical protein  39.3 
 
 
483 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1080  Leucyl aminopeptidase  39.19 
 
 
463 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1466  Leucyl aminopeptidase  41.41 
 
 
490 aa  205  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445132 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2556  hypothetical protein  39.3 
 
 
483 aa  205  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02867  leucine aminopeptidase  42.95 
 
 
456 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1488  leucyl aminopeptidase  38.32 
 
 
453 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  41.82 
 
 
503 aa  204  3e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0419  leucyl aminopeptidase  47.42 
 
 
411 aa  204  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00151993  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  39.38 
 
 
497 aa  203  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1677  leucyl aminopeptidase  38.39 
 
 
453 aa  202  7e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>