More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1126 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1126  Leucyl aminopeptidase  100 
 
 
491 aa  968    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150295 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3040  leucyl aminopeptidase  65.89 
 
 
491 aa  590  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156342  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4207  Leucyl aminopeptidase  60.79 
 
 
460 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.72513  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7039  leucine aminopeptidase  60.95 
 
 
442 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3582  leucyl aminopeptidase  62.17 
 
 
466 aa  509  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369762  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1777  leucyl aminopeptidase  58.94 
 
 
460 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356947  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_004310  BR2181  cytosol aminopeptidase family protein  58.68 
 
 
460 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2093  cytosol aminopeptidase family protein  58.9 
 
 
460 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0979393  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3720  leucyl aminopeptidase  60.4 
 
 
460 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0730  leucyl aminopeptidase  58.68 
 
 
460 aa  487  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0384  leucyl aminopeptidase  58.94 
 
 
460 aa  488  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0294  peptidase M17, leucyl aminopeptidase  56.7 
 
 
462 aa  482  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3527  leucyl aminopeptidase  60.04 
 
 
459 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0722387  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2976  leucyl aminopeptidase  61.11 
 
 
469 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.32018 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0242  leucyl aminopeptidase  57.65 
 
 
458 aa  467  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3202  Leucyl aminopeptidase  60.75 
 
 
469 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489554  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6782  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  63.25 
 
 
455 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3359  leucyl aminopeptidase  54.85 
 
 
465 aa  458  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452222  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6389  leucyl aminopeptidase  64.08 
 
 
452 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4196  Leucyl aminopeptidase  52.47 
 
 
463 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0292  leucine aminopeptidase  52.02 
 
 
462 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144461  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4484  Leucyl aminopeptidase  52.02 
 
 
463 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0281  leucyl aminopeptidase  59.79 
 
 
455 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3158  Leucyl aminopeptidase  60.26 
 
 
469 aa  433  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0428  leucyl aminopeptidase  53.08 
 
 
454 aa  424  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3953  peptidase M17, leucyl aminopeptidase-like  56.64 
 
 
455 aa  421  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0047  leucyl aminopeptidase  53.48 
 
 
461 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168796  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1264  cytosol aminopeptidase family protein  46.58 
 
 
465 aa  414  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  54.91 
 
 
463 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4585  leucyl aminopeptidase  49.89 
 
 
473 aa  405  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1379  cytosol aminopeptidase  54.16 
 
 
479 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2707  leucyl aminopeptidase  54.84 
 
 
467 aa  403  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3188  leucyl aminopeptidase  50 
 
 
453 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2759  leucyl aminopeptidase  46.94 
 
 
453 aa  396  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.168747  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3455  leucyl aminopeptidase  50 
 
 
472 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1858  Leucyl aminopeptidase  48.8 
 
 
461 aa  395  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4956  cytosol aminopeptidase family protein  45.67 
 
 
453 aa  392  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1677  leucyl aminopeptidase  46.07 
 
 
453 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1488  leucyl aminopeptidase  49.51 
 
 
453 aa  391  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0106  leucyl aminopeptidase  51.34 
 
 
456 aa  385  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0713  leucyl aminopeptidase  53.81 
 
 
467 aa  385  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0038  leucyl aminopeptidase  52.58 
 
 
461 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3234  leucine aminopeptidase  55.58 
 
 
463 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179734  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2559  hypothetical protein  44.2 
 
 
454 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2687  hypothetical protein  44.42 
 
 
454 aa  363  3e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0148  Leucyl aminopeptidase  45.83 
 
 
476 aa  357  2.9999999999999997e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736784  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0098  leucyl aminopeptidase  50.11 
 
 
465 aa  355  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02867  leucine aminopeptidase  46.61 
 
 
456 aa  354  2.9999999999999997e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0261  Leucyl aminopeptidase  47.36 
 
 
455 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.614863 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1112  leucyl aminopeptidase  47.05 
 
 
460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149662  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0252  Leucyl aminopeptidase  50.59 
 
 
481 aa  352  1e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.749602  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1080  Leucyl aminopeptidase  45.62 
 
 
463 aa  344  2e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1491  cytosol aminopeptidase  45.2 
 
 
458 aa  343  5e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0686  cytosol aminopeptidase family protein  44.96 
 
 
458 aa  342  7e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0215  leucyl aminopeptidase  49.31 
 
 
455 aa  322  7e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0245  leucyl aminopeptidase  49.31 
 
 
455 aa  322  9.999999999999999e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.597485  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0419  leucyl aminopeptidase  54.37 
 
 
411 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00151993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4427  leucyl aminopeptidase  43.72 
 
 
547 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.213843  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  41.92 
 
 
497 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0315  leucyl aminopeptidase  43.93 
 
 
499 aa  224  2e-57  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2556  hypothetical protein  44.9 
 
 
483 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2646  Leucyl aminopeptidase  41.67 
 
 
507 aa  223  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2684  hypothetical protein  44.59 
 
 
483 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  37.56 
 
 
496 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0999  leucyl aminopeptidase  41.96 
 
 
511 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  40.43 
 
 
503 aa  221  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0536  leucyl aminopeptidase  37.64 
 
 
492 aa  220  5e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1178  leucyl aminopeptidase  43 
 
 
502 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2827  leucyl aminopeptidase  43.32 
 
 
502 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.246514  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2909  leucyl aminopeptidase  43 
 
 
502 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.112327  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0795  leucyl aminopeptidase  43.32 
 
 
502 aa  219  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  36.39 
 
 
493 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8418  Leucyl aminopeptidase  45.48 
 
 
491 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00871794  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2787  leucyl aminopeptidase  42.3 
 
 
499 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151843  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  41.03 
 
 
503 aa  217  4e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3006  leucyl aminopeptidase  42.67 
 
 
502 aa  217  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.132109  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3262  leucyl aminopeptidase  43 
 
 
502 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0507418  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1257  leucyl aminopeptidase  43 
 
 
502 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0396745  hitchhiker  0.0000114036 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1368  leucyl aminopeptidase  42.67 
 
 
502 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  39.57 
 
 
497 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3119  leucyl aminopeptidase  43 
 
 
502 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000969621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  36.04 
 
 
493 aa  216  9e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3109  leucyl aminopeptidase  42.67 
 
 
502 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000897805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  37.47 
 
 
491 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0924  leucyl aminopeptidase  42.35 
 
 
502 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317075  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0871  leucyl aminopeptidase  42.35 
 
 
502 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238632  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  41.33 
 
 
501 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  38.89 
 
 
496 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  36.94 
 
 
495 aa  213  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  39.95 
 
 
496 aa  213  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  36.89 
 
 
492 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  39.42 
 
 
497 aa  213  9e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1251  aminopeptidase B  43.71 
 
 
436 aa  211  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0098  leucyl aminopeptidase  42.3 
 
 
491 aa  210  5e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  40.68 
 
 
498 aa  209  8e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0823  leucyl aminopeptidase  39.64 
 
 
528 aa  209  9e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  42.35 
 
 
496 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  38.17 
 
 
514 aa  208  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02660  leucyl aminopeptidase  42.05 
 
 
490 aa  209  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0114  leucyl aminopeptidase  41.97 
 
 
491 aa  209  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>