More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4956 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4956  cytosol aminopeptidase family protein  100 
 
 
453 aa  936    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3188  leucyl aminopeptidase  64.98 
 
 
453 aa  617  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2759  leucyl aminopeptidase  63.88 
 
 
453 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.168747  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1677  leucyl aminopeptidase  62.91 
 
 
453 aa  596  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1488  leucyl aminopeptidase  62.11 
 
 
453 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1858  Leucyl aminopeptidase  48.46 
 
 
461 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2687  hypothetical protein  49.77 
 
 
454 aa  415  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2559  hypothetical protein  49.77 
 
 
454 aa  413  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1491  cytosol aminopeptidase  48.17 
 
 
458 aa  396  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0242  leucyl aminopeptidase  48.77 
 
 
458 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0686  cytosol aminopeptidase family protein  48.39 
 
 
458 aa  398  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0713  leucyl aminopeptidase  46.53 
 
 
467 aa  392  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0428  leucyl aminopeptidase  44.4 
 
 
454 aa  391  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1264  cytosol aminopeptidase family protein  46.67 
 
 
465 aa  385  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0047  leucyl aminopeptidase  45.05 
 
 
461 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168796  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4207  Leucyl aminopeptidase  45.9 
 
 
460 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.72513  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1126  Leucyl aminopeptidase  50 
 
 
491 aa  384  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150295 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0261  Leucyl aminopeptidase  46.77 
 
 
455 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.614863 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7039  leucine aminopeptidase  46.95 
 
 
442 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0292  leucine aminopeptidase  47.42 
 
 
462 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144461  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1080  Leucyl aminopeptidase  45.49 
 
 
463 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0148  Leucyl aminopeptidase  46.83 
 
 
476 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736784  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2181  cytosol aminopeptidase family protein  46.85 
 
 
460 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2093  cytosol aminopeptidase family protein  46.85 
 
 
460 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0979393  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  47.19 
 
 
463 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0730  leucyl aminopeptidase  48.47 
 
 
460 aa  378  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0294  peptidase M17, leucyl aminopeptidase  47.02 
 
 
462 aa  378  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1379  cytosol aminopeptidase  45.5 
 
 
479 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4484  Leucyl aminopeptidase  48.89 
 
 
463 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4196  Leucyl aminopeptidase  49.51 
 
 
463 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3040  leucyl aminopeptidase  49.88 
 
 
491 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156342  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4585  leucyl aminopeptidase  44.03 
 
 
473 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3455  leucyl aminopeptidase  45.01 
 
 
472 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0038  leucyl aminopeptidase  46.17 
 
 
461 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3953  peptidase M17, leucyl aminopeptidase-like  49.52 
 
 
455 aa  368  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3359  leucyl aminopeptidase  46.3 
 
 
465 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452222  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1112  leucyl aminopeptidase  45.96 
 
 
460 aa  363  4e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149662  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0215  leucyl aminopeptidase  44.87 
 
 
455 aa  363  4e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0281  leucyl aminopeptidase  43.42 
 
 
455 aa  362  8e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0245  leucyl aminopeptidase  44.87 
 
 
455 aa  362  9e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.597485  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02867  leucine aminopeptidase  44.01 
 
 
456 aa  361  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1777  leucyl aminopeptidase  43.08 
 
 
460 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356947  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3582  leucyl aminopeptidase  47.3 
 
 
466 aa  359  6e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369762  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3720  leucyl aminopeptidase  46.67 
 
 
460 aa  359  6e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0384  leucyl aminopeptidase  45.23 
 
 
460 aa  356  5.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2707  leucyl aminopeptidase  45.71 
 
 
467 aa  351  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0098  leucyl aminopeptidase  45.86 
 
 
465 aa  349  7e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2976  leucyl aminopeptidase  43.82 
 
 
469 aa  348  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.32018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3527  leucyl aminopeptidase  44.97 
 
 
459 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0722387  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3234  leucine aminopeptidase  45.5 
 
 
463 aa  344  2e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179734  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0106  leucyl aminopeptidase  46.93 
 
 
456 aa  344  2e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3202  Leucyl aminopeptidase  44.23 
 
 
469 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.489554  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3158  Leucyl aminopeptidase  44.57 
 
 
469 aa  329  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6782  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  44.42 
 
 
455 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0252  Leucyl aminopeptidase  44.84 
 
 
481 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.749602  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0419  leucyl aminopeptidase  50.78 
 
 
411 aa  309  9e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00151993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6389  leucyl aminopeptidase  46.15 
 
 
452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4427  leucyl aminopeptidase  52.22 
 
 
547 aa  304  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.213843  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  38.21 
 
 
497 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  41.27 
 
 
500 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  42.27 
 
 
498 aa  242  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  42.23 
 
 
498 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  42.35 
 
 
497 aa  240  4e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  42.35 
 
 
497 aa  240  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2684  hypothetical protein  40.76 
 
 
483 aa  239  5.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  39.39 
 
 
482 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  40 
 
 
497 aa  239  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  40.83 
 
 
500 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2556  hypothetical protein  40.47 
 
 
483 aa  238  2e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1178  leucyl aminopeptidase  42.12 
 
 
502 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  38.67 
 
 
496 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  37.77 
 
 
508 aa  237  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  37.99 
 
 
496 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02660  leucyl aminopeptidase  40.52 
 
 
490 aa  236  7e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  40.16 
 
 
500 aa  236  7e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2314  leucyl aminopeptidase  43.03 
 
 
499 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  41.76 
 
 
497 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  41.34 
 
 
498 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  39.04 
 
 
500 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  36.6 
 
 
496 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  41.47 
 
 
497 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3109  leucyl aminopeptidase  41.26 
 
 
502 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000897805  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0871  leucyl aminopeptidase  40.4 
 
 
502 aa  234  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238632  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3262  leucyl aminopeptidase  41.26 
 
 
502 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0507418  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1257  leucyl aminopeptidase  41.26 
 
 
502 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0396745  hitchhiker  0.0000114036 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2965  leucyl aminopeptidase  39.89 
 
 
500 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434941  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2909  leucyl aminopeptidase  40.97 
 
 
502 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.112327  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3119  leucyl aminopeptidase  41.26 
 
 
502 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000969621  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1368  leucyl aminopeptidase  42.49 
 
 
502 aa  233  6e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3016  leucyl aminopeptidase  41.59 
 
 
479 aa  233  6e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3006  leucyl aminopeptidase  40.97 
 
 
502 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.132109  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  40.73 
 
 
497 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2827  leucyl aminopeptidase  40.69 
 
 
502 aa  232  9e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.246514  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0924  leucyl aminopeptidase  40.69 
 
 
502 aa  232  9e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317075  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  40.17 
 
 
497 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  40.73 
 
 
497 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0795  leucyl aminopeptidase  39.83 
 
 
502 aa  232  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0315  leucyl aminopeptidase  43.71 
 
 
499 aa  231  2e-59  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  40.18 
 
 
496 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0536  leucyl aminopeptidase  39.53 
 
 
492 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>