More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2898 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02415  aminopeptidase B  99.53 
 
 
427 aa  877    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1145  PepB aminopeptidase  99.3 
 
 
427 aa  874    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2776  aminopeptidase B  91.1 
 
 
427 aa  810    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.127629  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3020  aminopeptidase B  88.29 
 
 
428 aa  794    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.486069  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2910  aminopeptidase B  91.57 
 
 
427 aa  811    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1251  aminopeptidase B  75.12 
 
 
436 aa  669    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3024  aminopeptidase B  75.35 
 
 
436 aa  650    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1284  aminopeptidase B  75.35 
 
 
432 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1111  aminopeptidase B  75 
 
 
431 aa  665    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0428  aminopeptidase B  75.35 
 
 
432 aa  638    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0152446 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2898  aminopeptidase B  100 
 
 
427 aa  880    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3754  aminopeptidase B  99.53 
 
 
427 aa  877    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0773649  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3620  aminopeptidase B  76.18 
 
 
431 aa  672    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.412227 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1175  aminopeptidase B  75.35 
 
 
432 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2744  aminopeptidase B  74.53 
 
 
431 aa  667    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2691  aminopeptidase B  91.33 
 
 
427 aa  810    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2807  aminopeptidase B  99.53 
 
 
427 aa  877    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1154  aminopeptidase B  99.53 
 
 
427 aa  877    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.571702  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2675  aminopeptidase B  98.83 
 
 
427 aa  872    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.334715  normal  0.941339 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2735  aminopeptidase B  91.33 
 
 
427 aa  810    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02379  hypothetical protein  99.53 
 
 
427 aa  877    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2798  aminopeptidase B  91.1 
 
 
427 aa  810    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2674  aminopeptidase B  99.53 
 
 
427 aa  877    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004353  peptidase B  60.56 
 
 
432 aa  535  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0284  aminopeptidase B  60 
 
 
444 aa  533  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000940358  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01063  aminopeptidase B  59.39 
 
 
432 aa  527  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0724  aminopeptidase B  58.08 
 
 
428 aa  515  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0388  aminopeptidase B  54.1 
 
 
432 aa  479  1e-134  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1331  aminopeptidase B  51.4 
 
 
430 aa  423  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3939  aminopeptidase B  51.18 
 
 
427 aa  395  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0177872  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03542  aminopeptidase B  49.88 
 
 
427 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.542344  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3897  aminopeptidase B  51.05 
 
 
425 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000551018  normal  0.710949 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0874  aminopeptidase B  49.65 
 
 
430 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0348435  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0732  aminopeptidase B  49.88 
 
 
430 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.354298  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3290  aminopeptidase B  49.88 
 
 
430 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0811496  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0886  aminopeptidase B  49.65 
 
 
430 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00154552  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3402  aminopeptidase B  49.88 
 
 
430 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329172  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0851  aminopeptidase B  49.41 
 
 
430 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0564322  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0782  aminopeptidase B  49.65 
 
 
427 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3488  aminopeptidase B  49.41 
 
 
430 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3796  aminopeptidase B  48.24 
 
 
425 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.103934  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3127  aminopeptidase B  50.12 
 
 
425 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.353364  normal  0.0427055 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0876  aminopeptidase B  49.3 
 
 
430 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3274  aminopeptidase B  48.7 
 
 
424 aa  366  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00646362  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3126  aminopeptidase B  48.95 
 
 
430 aa  368  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0275669  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0700  aminopeptidase B  49.41 
 
 
425 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0481686  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3168  aminopeptidase B  49.41 
 
 
425 aa  356  5e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000320963  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0138  leucyl aminopeptidase  43.53 
 
 
463 aa  236  7e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16420  leucyl aminopeptidase  42.72 
 
 
492 aa  224  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0713  leucyl aminopeptidase  43.4 
 
 
467 aa  223  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.543726 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  43.3 
 
 
482 aa  221  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0686  cytosol aminopeptidase family protein  42.07 
 
 
458 aa  216  5e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2181  cytosol aminopeptidase family protein  40.45 
 
 
460 aa  216  5.9999999999999996e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2093  cytosol aminopeptidase family protein  40.45 
 
 
460 aa  216  5.9999999999999996e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0979393  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2559  hypothetical protein  38.11 
 
 
454 aa  216  7e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2687  hypothetical protein  37.82 
 
 
454 aa  216  8e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0148  Leucyl aminopeptidase  41.99 
 
 
476 aa  215  9e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736784  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1491  cytosol aminopeptidase  41.75 
 
 
458 aa  215  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0880  leucyl aminopeptidase  44 
 
 
616 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1112  leucyl aminopeptidase  44.38 
 
 
460 aa  214  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149662  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  42.32 
 
 
503 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  42.37 
 
 
487 aa  213  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  42.01 
 
 
503 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0823  leucyl aminopeptidase  42.32 
 
 
503 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3188  leucyl aminopeptidase  40.31 
 
 
453 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0252  Leucyl aminopeptidase  45.64 
 
 
481 aa  211  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.749602  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  42.01 
 
 
503 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0672  leucyl aminopeptidase  42.01 
 
 
503 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131904  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  42.01 
 
 
503 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1677  leucyl aminopeptidase  40.94 
 
 
453 aa  209  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  42.01 
 
 
503 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  42.01 
 
 
503 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  42.01 
 
 
503 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  42.01 
 
 
503 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1858  Leucyl aminopeptidase  37.9 
 
 
461 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  39.53 
 
 
487 aa  209  7e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2471  leucyl aminopeptidase  41.69 
 
 
503 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  42.06 
 
 
488 aa  209  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1488  leucyl aminopeptidase  39.66 
 
 
453 aa  209  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0823  leucyl aminopeptidase  41.46 
 
 
528 aa  207  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1855  leucyl aminopeptidase  41.69 
 
 
503 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2759  leucyl aminopeptidase  38.25 
 
 
453 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.168747  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  41.38 
 
 
503 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2466  leucyl aminopeptidase  41.69 
 
 
503 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  41.38 
 
 
503 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1126  Leucyl aminopeptidase  43.01 
 
 
491 aa  206  6e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150295 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0730  leucyl aminopeptidase  38.94 
 
 
460 aa  206  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  43.89 
 
 
518 aa  206  8e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  40 
 
 
497 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4956  cytosol aminopeptidase family protein  37.85 
 
 
453 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0419  leucyl aminopeptidase  46.42 
 
 
411 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00151993  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0292  leucine aminopeptidase  40.13 
 
 
462 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144461  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1180  Leucyl aminopeptidase  42.01 
 
 
485 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746121  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4484  Leucyl aminopeptidase  38.39 
 
 
463 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3455  leucyl aminopeptidase  41.87 
 
 
472 aa  204  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3016  leucyl aminopeptidase  38.63 
 
 
479 aa  203  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  41.43 
 
 
503 aa  203  5e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0242  leucyl aminopeptidase  37.83 
 
 
458 aa  202  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  42.5 
 
 
503 aa  202  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17591  leucyl aminopeptidase  37.05 
 
 
495 aa  202  9e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.697239  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>