More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0568 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0568  leucyl aminopeptidase  100 
 
 
514 aa  1045    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2519  leucyl aminopeptidase  55.64 
 
 
522 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.164338  normal  0.0174769 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1538  Leucyl aminopeptidase  57.36 
 
 
521 aa  561  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2206  Leucyl aminopeptidase  46.37 
 
 
501 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00206778  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2081  leucyl aminopeptidase  44.88 
 
 
505 aa  414  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  45.81 
 
 
491 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  43.17 
 
 
492 aa  364  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2057  Leucyl aminopeptidase  44.94 
 
 
491 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.099482  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  41.1 
 
 
496 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0580  leucyl aminopeptidase  39.02 
 
 
503 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458799  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  41.09 
 
 
493 aa  336  7e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  39.11 
 
 
503 aa  329  7e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  37.74 
 
 
506 aa  326  6e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  41.1 
 
 
496 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  40.85 
 
 
496 aa  323  5e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  39.04 
 
 
503 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0823  leucyl aminopeptidase  38.46 
 
 
528 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  41.91 
 
 
500 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  40.39 
 
 
497 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  38.25 
 
 
518 aa  320  6e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  39.74 
 
 
501 aa  319  7e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  40.7 
 
 
495 aa  319  7e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0412  leucyl aminopeptidase  42.92 
 
 
489 aa  317  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0249677 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2099  aminopeptidase A/I  40.09 
 
 
497 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41187  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2787  leucyl aminopeptidase  41.23 
 
 
499 aa  312  6.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151843  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  41.09 
 
 
503 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0984  leucyl aminopeptidase  39.87 
 
 
508 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  41.31 
 
 
503 aa  311  2e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3638  leucyl aminopeptidase  41.05 
 
 
508 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  40.56 
 
 
503 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2807  leucyl aminopeptidase  39.52 
 
 
510 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.494526  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  40.22 
 
 
497 aa  309  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  40.35 
 
 
503 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2683  leucyl aminopeptidase  38.66 
 
 
510 aa  306  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417849  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  40.26 
 
 
497 aa  306  7e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  40.35 
 
 
503 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  39.36 
 
 
511 aa  305  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2679  leucyl aminopeptidase  40.04 
 
 
502 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273234  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0954  leucyl aminopeptidase  39.44 
 
 
508 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  40.13 
 
 
503 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  38.48 
 
 
496 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3765  Leucyl aminopeptidase  37.3 
 
 
493 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  37.3 
 
 
498 aa  302  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0628  leucyl aminopeptidase  38.63 
 
 
496 aa  302  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.052928  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0823  leucyl aminopeptidase  40.61 
 
 
503 aa  300  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  41 
 
 
503 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  41 
 
 
503 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  41 
 
 
503 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  40.65 
 
 
497 aa  300  4e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2219  leucyl aminopeptidase  39.63 
 
 
502 aa  300  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  39.43 
 
 
497 aa  300  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0296  leucyl aminopeptidase  34.65 
 
 
488 aa  299  8e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00770459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  38.79 
 
 
495 aa  299  9e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  40.43 
 
 
497 aa  298  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0672  leucyl aminopeptidase  40.78 
 
 
503 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131904  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  40.78 
 
 
503 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  36.96 
 
 
496 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2471  leucyl aminopeptidase  39.87 
 
 
503 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2595  leucyl aminopeptidase  40.12 
 
 
486 aa  298  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0344474 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  40.78 
 
 
503 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  40.78 
 
 
503 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  39.57 
 
 
500 aa  298  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1855  leucyl aminopeptidase  39.48 
 
 
503 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  39.3 
 
 
482 aa  298  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2466  leucyl aminopeptidase  39.48 
 
 
503 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01576  leucyl aminopeptidase  38.26 
 
 
513 aa  297  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.327034  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  40.32 
 
 
492 aa  297  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  37.97 
 
 
496 aa  296  6e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1124  leucyl aminopeptidase  41.87 
 
 
485 aa  296  7e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.67356  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1372  PepA aminopeptidase  46.04 
 
 
500 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00219967  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  38.48 
 
 
496 aa  295  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0999  leucyl aminopeptidase  36.6 
 
 
511 aa  294  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3557  leucyl aminopeptidase  35.03 
 
 
502 aa  293  4e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  38.82 
 
 
487 aa  293  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  39.68 
 
 
496 aa  293  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  37.99 
 
 
497 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  39.57 
 
 
498 aa  291  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  38.55 
 
 
498 aa  291  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0332  leucyl aminopeptidase  39.47 
 
 
496 aa  290  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00199325  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  37.99 
 
 
497 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0910  leucyl aminopeptidase  36.4 
 
 
502 aa  290  6e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000452493  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3562  leucyl aminopeptidase  33.85 
 
 
501 aa  290  6e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.025023  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  38.39 
 
 
500 aa  289  7e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14470  leucyl aminopeptidase  37.05 
 
 
495 aa  289  9e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  41.94 
 
 
495 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1942  leucyl aminopeptidase  48.8 
 
 
484 aa  288  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.189087  normal  0.0962979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  38.78 
 
 
488 aa  288  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1545  leucyl aminopeptidase  45.74 
 
 
497 aa  287  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.87214  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1233  Leucyl aminopeptidase  44.63 
 
 
536 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1761  leucyl aminopeptidase  42.51 
 
 
481 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  36.29 
 
 
493 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0562  leucyl aminopeptidase  33.79 
 
 
503 aa  286  4e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00163208  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0795  leucyl aminopeptidase  35.76 
 
 
502 aa  286  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0924  leucyl aminopeptidase  35.33 
 
 
502 aa  286  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317075  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  37.34 
 
 
497 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0740  leucyl aminopeptidase  33.9 
 
 
501 aa  286  5.999999999999999e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  35.11 
 
 
493 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1076  leucyl aminopeptidase  35.58 
 
 
502 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0190451  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0890  leucyl aminopeptidase  50 
 
 
485 aa  286  7e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119935  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  41.2 
 
 
514 aa  286  7e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>