More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1538 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2519  leucyl aminopeptidase  68.14 
 
 		 522 aa  684    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.164338  normal  0.0174769 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1538  Leucyl aminopeptidase  100 
 
 		 521 aa  1033    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0568  leucyl aminopeptidase  57.36 
 
 		 514 aa  598  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2206  Leucyl aminopeptidase  51.63 
 
 		 501 aa  509  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00206778  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2081  leucyl aminopeptidase  48.37 
 
 		 505 aa  420  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2057  Leucyl aminopeptidase  52.45 
 
 		 491 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.099482  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  43.27 
 
 		 496 aa  378  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  41.87 
 
 		 492 aa  365  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  41.87 
 
 		 491 aa  360  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0823  leucyl aminopeptidase  42.14 
 
 		 528 aa  352  1e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  40.61 
 
 		 518 aa  346  5e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0580  leucyl aminopeptidase  40.12 
 
 		 503 aa  344  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458799  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  41.97 
 
 		 498 aa  342  9e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  43.72 
 
 		 497 aa  342  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  38.93 
 
 		 506 aa  342  1e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  39.96 
 
 		 503 aa  340  5e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  38.08 
 
 		 501 aa  332  1e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  39.16 
 
 		 496 aa  329  7e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  40.3 
 
 		 496 aa  329  8e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0628  leucyl aminopeptidase  41.56 
 
 		 496 aa  327  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.052928  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  40.67 
 
 		 503 aa  325  9e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2787  leucyl aminopeptidase  49.28 
 
 		 499 aa  325  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151843  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  43.78 
 
 		 497 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  48.13 
 
 		 493 aa  325  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1537  leucyl aminopeptidase  39.37 
 
 		 503 aa  325  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.692981  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  39.88 
 
 		 496 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  39.72 
 
 		 512 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  40.73 
 
 		 487 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  46.86 
 
 		 497 aa  319  7e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  40.85 
 
 		 488 aa  319  7.999999999999999e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0954  leucyl aminopeptidase  41.5 
 
 		 508 aa  319  9e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  40.24 
 
 		 496 aa  318  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  42.64 
 
 		 497 aa  318  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1124  leucyl aminopeptidase  44.84 
 
 		 485 aa  317  3e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.67356  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  46.46 
 
 		 482 aa  317  4e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0999  leucyl aminopeptidase  37.9 
 
 		 511 aa  317  4e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  43.11 
 
 		 495 aa  316  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2099  aminopeptidase A/I  40.66 
 
 		 497 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41187  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3557  leucyl aminopeptidase  37.4 
 
 		 502 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  39.85 
 
 		 511 aa  314  2.9999999999999996e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  38.68 
 
 		 496 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3679  leucyl aminopeptidase  36.57 
 
 		 503 aa  310  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0257256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4047  leucyl aminopeptidase  36.57 
 
 		 503 aa  310  4e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00149505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2083  leucyl aminopeptidase  37.67 
 
 		 503 aa  310  4e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000600102  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3543  leucyl aminopeptidase  36.57 
 
 		 503 aa  310  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00770626  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0740  leucyl aminopeptidase  37.79 
 
 		 501 aa  310  5e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0296  leucyl aminopeptidase  35.73 
 
 		 488 aa  310  5e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00770459 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  39.32 
 
 		 496 aa  310  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03635  leucyl aminopeptidase  36.54 
 
 		 502 aa  310  5.9999999999999995e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0412  leucyl aminopeptidase  49.69 
 
 		 489 aa  309  6.999999999999999e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0249677 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  39.83 
 
 		 495 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0516  leucyl aminopeptidase  36.84 
 
 		 495 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.204663  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  41.11 
 
 		 497 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14470  leucyl aminopeptidase  46.88 
 
 		 495 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002428  cytosol aminopeptidase PepA  36.35 
 
 		 502 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00175472  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  49.85 
 
 		 492 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  41.33 
 
 		 497 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0939  leucyl aminopeptidase  37.06 
 
 		 502 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.245826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0910  leucyl aminopeptidase  37.2 
 
 		 502 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000452493  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0795  leucyl aminopeptidase  37.01 
 
 		 502 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  41.11 
 
 		 497 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3765  Leucyl aminopeptidase  37.57 
 
 		 493 aa  306  6e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1076  leucyl aminopeptidase  36.81 
 
 		 502 aa  306  6e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0190451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2730  Leucyl aminopeptidase  50.93 
 
 		 511 aa  306  6e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.387562  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0395  leucyl aminopeptidase  35.26 
 
 		 504 aa  306  7e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0562  leucyl aminopeptidase  35.62 
 
 		 503 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00163208  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04126  leucyl aminopeptidase  36.95 
 
 		 503 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0158539  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3737  Leucyl aminopeptidase  36.95 
 
 		 503 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662158  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3752  leucyl aminopeptidase  36.95 
 
 		 503 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00102834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4740  leucyl aminopeptidase  36.95 
 
 		 503 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000218455  normal  0.712457 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0871  leucyl aminopeptidase  36.24 
 
 		 502 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238632  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4516  leucyl aminopeptidase  36.95 
 
 		 503 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000167051  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4832  leucyl aminopeptidase  36.95 
 
 		 503 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000259407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04090  hypothetical protein  36.95 
 
 		 503 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0200795  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0924  leucyl aminopeptidase  36.24 
 
 		 502 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317075  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5781  leucyl aminopeptidase  36.95 
 
 		 503 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0325394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2807  leucyl aminopeptidase  39.88 
 
 		 510 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.494526  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4821  leucyl aminopeptidase  36.76 
 
 		 503 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000301619  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1178  leucyl aminopeptidase  36.42 
 
 		 502 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  41.22 
 
 		 503 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  38.57 
 
 		 503 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2827  leucyl aminopeptidase  35.92 
 
 		 502 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.246514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  41.22 
 
 		 503 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  45.74 
 
 		 495 aa  302  8.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0623  leucyl aminopeptidase  47.09 
 
 		 536 aa  302  9e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022147  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2909  leucyl aminopeptidase  36.42 
 
 		 502 aa  302  9e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.112327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3119  leucyl aminopeptidase  36.61 
 
 		 502 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000969621  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0984  leucyl aminopeptidase  38.98 
 
 		 508 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3720  leucyl aminopeptidase  36.64 
 
 		 502 aa  302  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3262  leucyl aminopeptidase  36.61 
 
 		 502 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0507418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1257  leucyl aminopeptidase  36.61 
 
 		 502 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0396745  hitchhiker  0.0000114036 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0536  leucyl aminopeptidase  41.33 
 
 		 492 aa  302  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3109  leucyl aminopeptidase  36.61 
 
 		 502 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000897805  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1368  leucyl aminopeptidase  36.42 
 
 		 502 aa  301  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1233  Leucyl aminopeptidase  47.09 
 
 		 536 aa  301  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1014  leucyl aminopeptidase  37.01 
 
 		 502 aa  301  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0465604  normal  0.808003 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01576  leucyl aminopeptidase  36.07 
 
 		 513 aa  301  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.327034  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0526  leucyl aminopeptidase  35.37 
 
 		 502 aa  301  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0735759  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3006  leucyl aminopeptidase  36.42 
 
 		 502 aa  301  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.132109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  40.41 
 
 		 503 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>