More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3527 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  78.99 
 
 
497 aa  802    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  79.8 
 
 
497 aa  809    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  78.02 
 
 
496 aa  795    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  77.02 
 
 
496 aa  795    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  79.6 
 
 
497 aa  807    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  77.58 
 
 
496 aa  798    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  77.13 
 
 
496 aa  792    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  100 
 
 
512 aa  1036    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  77.78 
 
 
495 aa  782    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14470  leucyl aminopeptidase  77.98 
 
 
495 aa  760    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  79.39 
 
 
497 aa  807    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  58.67 
 
 
496 aa  579  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  56.65 
 
 
496 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3679  leucyl aminopeptidase  56.22 
 
 
503 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0257256  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0395  leucyl aminopeptidase  55.53 
 
 
504 aa  565  1e-160  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4047  leucyl aminopeptidase  56.22 
 
 
503 aa  566  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00149505  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3543  leucyl aminopeptidase  56.22 
 
 
503 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00770626  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0740  leucyl aminopeptidase  55.04 
 
 
501 aa  563  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03635  leucyl aminopeptidase  55.13 
 
 
502 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  56.65 
 
 
498 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0737217 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04126  leucyl aminopeptidase  55.62 
 
 
503 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0158539  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3737  Leucyl aminopeptidase  55.62 
 
 
503 aa  560  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662158  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002428  cytosol aminopeptidase PepA  54.93 
 
 
502 aa  560  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00175472  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4882  leucyl aminopeptidase  55.42 
 
 
503 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.417344  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0795  leucyl aminopeptidase  54.31 
 
 
502 aa  560  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4832  leucyl aminopeptidase  55.62 
 
 
503 aa  560  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000259407  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4763  leucyl aminopeptidase  55.42 
 
 
503 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000189037  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5781  leucyl aminopeptidase  55.62 
 
 
503 aa  560  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0325394  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4733  leucyl aminopeptidase  55.42 
 
 
503 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.138793  normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4516  leucyl aminopeptidase  55.62 
 
 
503 aa  560  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000167051  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3648  leucyl aminopeptidase  55.62 
 
 
503 aa  559  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.433879  normal  0.196646 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4740  leucyl aminopeptidase  55.62 
 
 
503 aa  560  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000218455  normal  0.712457 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4863  leucyl aminopeptidase  55.42 
 
 
503 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0321011  normal  0.585074 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01576  leucyl aminopeptidase  54.22 
 
 
513 aa  560  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.327034  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4826  leucyl aminopeptidase  55.42 
 
 
503 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.956713  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3752  leucyl aminopeptidase  55.62 
 
 
503 aa  560  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00102834  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04090  hypothetical protein  55.62 
 
 
503 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0200795  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  57.26 
 
 
497 aa  560  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  54.12 
 
 
501 aa  555  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0562  leucyl aminopeptidase  55.02 
 
 
503 aa  557  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00163208  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2083  leucyl aminopeptidase  54.73 
 
 
503 aa  556  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000600102  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0526  leucyl aminopeptidase  53.72 
 
 
502 aa  555  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0735759  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4821  leucyl aminopeptidase  55.22 
 
 
503 aa  556  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000301619  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1178  leucyl aminopeptidase  54.11 
 
 
502 aa  556  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1368  leucyl aminopeptidase  53.51 
 
 
502 aa  554  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3557  leucyl aminopeptidase  54.53 
 
 
502 aa  554  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3562  leucyl aminopeptidase  53.01 
 
 
501 aa  554  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.025023  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2827  leucyl aminopeptidase  53.51 
 
 
502 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.246514  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2909  leucyl aminopeptidase  53.71 
 
 
502 aa  554  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.112327  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0939  leucyl aminopeptidase  53.71 
 
 
502 aa  553  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.245826  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3006  leucyl aminopeptidase  53.51 
 
 
502 aa  552  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.132109  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1257  leucyl aminopeptidase  53.51 
 
 
502 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0396745  hitchhiker  0.0000114036 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3720  leucyl aminopeptidase  54.73 
 
 
502 aa  551  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3262  leucyl aminopeptidase  53.51 
 
 
502 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0507418  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3109  leucyl aminopeptidase  53.51 
 
 
502 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000897805  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0924  leucyl aminopeptidase  52.51 
 
 
502 aa  549  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3119  leucyl aminopeptidase  53.51 
 
 
502 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000969621  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0910  leucyl aminopeptidase  52.71 
 
 
502 aa  549  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000452493  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  55.71 
 
 
518 aa  547  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0871  leucyl aminopeptidase  52.3 
 
 
502 aa  545  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238632  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1014  leucyl aminopeptidase  53.11 
 
 
502 aa  546  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0465604  normal  0.808003 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0444  leucyl aminopeptidase  54.22 
 
 
503 aa  539  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0388  leucyl aminopeptidase  54.22 
 
 
503 aa  539  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1076  leucyl aminopeptidase  52.71 
 
 
502 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0190451  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2099  aminopeptidase A/I  54.33 
 
 
497 aa  533  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41187  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2787  leucyl aminopeptidase  56.63 
 
 
499 aa  531  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151843  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  51.81 
 
 
506 aa  519  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0681  leucyl aminopeptidase  53.83 
 
 
499 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.516579  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  54.23 
 
 
492 aa  510  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0580  leucyl aminopeptidase  51.2 
 
 
503 aa  503  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458799  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  52.79 
 
 
500 aa  499  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2683  leucyl aminopeptidase  52.24 
 
 
510 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417849  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2807  leucyl aminopeptidase  53.27 
 
 
510 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.494526  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0516  leucyl aminopeptidase  48.69 
 
 
495 aa  493  9.999999999999999e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.204663  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4007  leucyl aminopeptidase  52.88 
 
 
486 aa  491  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.502988 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  53.1 
 
 
503 aa  491  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  51.65 
 
 
503 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  51.86 
 
 
503 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1855  leucyl aminopeptidase  51.86 
 
 
503 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2466  leucyl aminopeptidase  51.86 
 
 
503 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0984  leucyl aminopeptidase  52.27 
 
 
508 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2471  leucyl aminopeptidase  51.65 
 
 
503 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0823  leucyl aminopeptidase  53.31 
 
 
503 aa  480  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3638  leucyl aminopeptidase  52.07 
 
 
508 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0287  leucyl aminopeptidase  47.98 
 
 
500 aa  481  1e-134  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  51.65 
 
 
503 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2918  leucyl aminopeptidase  54.03 
 
 
507 aa  477  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  51.75 
 
 
503 aa  478  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  52.48 
 
 
503 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0672  leucyl aminopeptidase  52.48 
 
 
503 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131904  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  52.48 
 
 
503 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  52.48 
 
 
503 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  52.27 
 
 
503 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  52.27 
 
 
503 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  52.48 
 
 
503 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2679  leucyl aminopeptidase  51.13 
 
 
502 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273234  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2219  leucyl aminopeptidase  51.34 
 
 
502 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2201  cytosol aminopeptidase  49.1 
 
 
500 aa  464  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152379  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1857  Leucyl aminopeptidase  49.1 
 
 
500 aa  464  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2415  leucyl aminopeptidase  50.62 
 
 
506 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>