More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2730 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2730  Leucyl aminopeptidase  100 
 
 		 511 aa  1020    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.387562  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2169  leucyl aminopeptidase  64.01 
 
 		 510 aa  625  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.176164 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1725  Leucyl aminopeptidase  65.59 
 
 		 496 aa  621  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2116  leucyl aminopeptidase  65.01 
 
 		 479 aa  620  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1921  PepA aminopeptidase  64.59 
 
 		 496 aa  615  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2408  PepA aminopeptidase  63.99 
 
 		 507 aa  612  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.729851  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4922  leucyl aminopeptidase  64.3 
 
 		 519 aa  581  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3162  PepA aminopeptidase  62.58 
 
 		 528 aa  556  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3539  leucyl aminopeptidase  63.05 
 
 		 525 aa  554  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102895 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1942  leucyl aminopeptidase  58.11 
 
 		 484 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.189087  normal  0.0962979 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2595  leucyl aminopeptidase  57.81 
 
 		 486 aa  471  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0344474 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  50.69 
 
 		 503 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  50.7 
 
 		 503 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  54.12 
 
 		 496 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  51.09 
 
 		 503 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2683  leucyl aminopeptidase  50.68 
 
 		 510 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417849  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2471  leucyl aminopeptidase  50.7 
 
 		 503 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1855  leucyl aminopeptidase  50.5 
 
 		 503 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  49.7 
 
 		 503 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2466  leucyl aminopeptidase  50.5 
 
 		 503 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  49.9 
 
 		 503 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2679  leucyl aminopeptidase  52.28 
 
 		 502 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0984  leucyl aminopeptidase  49.41 
 
 		 508 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2787  leucyl aminopeptidase  56.4 
 
 		 499 aa  450  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151843  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  50.9 
 
 		 503 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3638  leucyl aminopeptidase  49.02 
 
 		 508 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2807  leucyl aminopeptidase  49.9 
 
 		 510 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.494526  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2219  leucyl aminopeptidase  51.88 
 
 		 502 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  50.7 
 
 		 503 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  50.7 
 
 		 503 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  50.5 
 
 		 503 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0672  leucyl aminopeptidase  50.7 
 
 		 503 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131904  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  50.5 
 
 		 503 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0823  leucyl aminopeptidase  50.5 
 
 		 503 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  50.7 
 
 		 503 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1233  Leucyl aminopeptidase  52.03 
 
 		 536 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2415  leucyl aminopeptidase  51.68 
 
 		 506 aa  435  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0623  leucyl aminopeptidase  51.07 
 
 		 536 aa  433  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022147  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0580  leucyl aminopeptidase  47.81 
 
 		 503 aa  431  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458799  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2099  aminopeptidase A/I  49.5 
 
 		 497 aa  427  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41187  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  51.23 
 
 		 496 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  49.45 
 
 		 496 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  50.43 
 
 		 518 aa  423  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  51.19 
 
 		 497 aa  423  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  51.04 
 
 		 496 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  50 
 
 		 498 aa  422  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14470  leucyl aminopeptidase  49.49 
 
 		 495 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  50.11 
 
 		 501 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  47.72 
 
 		 500 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  49.49 
 
 		 495 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  49.89 
 
 		 496 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  46.68 
 
 		 493 aa  413  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  48.6 
 
 		 506 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  51.2 
 
 		 496 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  50 
 
 		 512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  50.11 
 
 		 497 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  55.83 
 
 		 492 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  49.89 
 
 		 497 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1372  PepA aminopeptidase  60.58 
 
 		 500 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00219967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  49.89 
 
 		 497 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3557  leucyl aminopeptidase  46.26 
 
 		 502 aa  403  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  50.11 
 
 		 497 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3543  leucyl aminopeptidase  43.63 
 
 		 503 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00770626  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3679  leucyl aminopeptidase  43.63 
 
 		 503 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0257256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4047  leucyl aminopeptidase  43.63 
 
 		 503 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00149505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3720  leucyl aminopeptidase  45.37 
 
 		 502 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03635  leucyl aminopeptidase  45.59 
 
 		 502 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3109  leucyl aminopeptidase  46.04 
 
 		 502 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000897805  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1178  leucyl aminopeptidase  46.48 
 
 		 502 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0795  leucyl aminopeptidase  46.49 
 
 		 502 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2083  leucyl aminopeptidase  46.49 
 
 		 503 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000600102  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04126  leucyl aminopeptidase  44.44 
 
 		 503 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0158539  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3737  Leucyl aminopeptidase  44.44 
 
 		 503 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662158  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0395  leucyl aminopeptidase  44.4 
 
 		 504 aa  391  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1257  leucyl aminopeptidase  45.81 
 
 		 502 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0396745  hitchhiker  0.0000114036 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4832  leucyl aminopeptidase  44.44 
 
 		 503 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000259407  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4821  leucyl aminopeptidase  43.59 
 
 		 503 aa  391  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000301619  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4516  leucyl aminopeptidase  44.44 
 
 		 503 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000167051  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3262  leucyl aminopeptidase  45.81 
 
 		 502 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0507418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3752  leucyl aminopeptidase  44.44 
 
 		 503 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00102834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0526  leucyl aminopeptidase  44.96 
 
 		 502 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0735759  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002428  cytosol aminopeptidase PepA  45.37 
 
 		 502 aa  392  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00175472  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4740  leucyl aminopeptidase  44.44 
 
 		 503 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000218455  normal  0.712457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5781  leucyl aminopeptidase  44.44 
 
 		 503 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0325394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2827  leucyl aminopeptidase  45.59 
 
 		 502 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.246514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2909  leucyl aminopeptidase  45.81 
 
 		 502 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.112327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3119  leucyl aminopeptidase  45.81 
 
 		 502 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000969621  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3006  leucyl aminopeptidase  45.59 
 
 		 502 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.132109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04090  hypothetical protein  44.44 
 
 		 503 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0200795  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0910  leucyl aminopeptidase  44.93 
 
 		 502 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000452493  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0740  leucyl aminopeptidase  45.71 
 
 		 501 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4826  leucyl aminopeptidase  43.65 
 
 		 503 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.956713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4733  leucyl aminopeptidase  43.65 
 
 		 503 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.138793  normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3648  leucyl aminopeptidase  44.02 
 
 		 503 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.433879  normal  0.196646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0562  leucyl aminopeptidase  44.62 
 
 		 503 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00163208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4882  leucyl aminopeptidase  43.65 
 
 		 503 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.417344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4007  leucyl aminopeptidase  51.97 
 
 		 486 aa  388  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.502988 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4863  leucyl aminopeptidase  43.65 
 
 		 503 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0321011  normal  0.585074 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0939  leucyl aminopeptidase  46.04 
 
 		 502 aa  388  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.245826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0924  leucyl aminopeptidase  44.71 
 
 		 502 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>