More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2595 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2595  leucyl aminopeptidase  100 
 
 		 486 aa  965    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0344474 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1942  leucyl aminopeptidase  69.42 
 
 		 484 aa  631  1e-180  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.189087  normal  0.0962979 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2169  leucyl aminopeptidase  58.14 
 
 		 510 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.176164 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2683  leucyl aminopeptidase  57.8 
 
 		 510 aa  501  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417849  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2408  PepA aminopeptidase  59.68 
 
 		 507 aa  497  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.729851  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1921  PepA aminopeptidase  59.69 
 
 		 496 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1725  Leucyl aminopeptidase  59.69 
 
 		 496 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2807  leucyl aminopeptidase  57.58 
 
 		 510 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.494526  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  56.7 
 
 		 503 aa  488  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2730  Leucyl aminopeptidase  57.81 
 
 		 511 aa  488  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.387562  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  56.17 
 
 		 503 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  55.51 
 
 		 503 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  55.95 
 
 		 503 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  55.95 
 
 		 503 aa  481  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1855  leucyl aminopeptidase  55.51 
 
 		 503 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2466  leucyl aminopeptidase  55.51 
 
 		 503 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2116  leucyl aminopeptidase  56.47 
 
 		 479 aa  478  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2471  leucyl aminopeptidase  55.29 
 
 		 503 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2219  leucyl aminopeptidase  58.67 
 
 		 502 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2679  leucyl aminopeptidase  58.67 
 
 		 502 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0823  leucyl aminopeptidase  56.17 
 
 		 503 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3539  leucyl aminopeptidase  60.13 
 
 		 525 aa  472  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102895 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  54.53 
 
 		 496 aa  474  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  53.47 
 
 		 503 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  53.47 
 
 		 503 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  53.47 
 
 		 503 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0984  leucyl aminopeptidase  55.8 
 
 		 508 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0672  leucyl aminopeptidase  53.47 
 
 		 503 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131904  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  53.27 
 
 		 503 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2787  leucyl aminopeptidase  56.67 
 
 		 499 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151843  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  53.47 
 
 		 503 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3638  leucyl aminopeptidase  56.25 
 
 		 508 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  53.47 
 
 		 503 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2415  leucyl aminopeptidase  57.93 
 
 		 506 aa  464  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1233  Leucyl aminopeptidase  52.11 
 
 		 536 aa  464  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  54.57 
 
 		 496 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  52.5 
 
 		 496 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3162  PepA aminopeptidase  56.4 
 
 		 528 aa  455  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0623  leucyl aminopeptidase  51.4 
 
 		 536 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022147  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  49.9 
 
 		 501 aa  449  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  53.19 
 
 		 496 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  53.33 
 
 		 497 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  53.67 
 
 		 518 aa  451  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  52.89 
 
 		 497 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  54.12 
 
 		 495 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4922  leucyl aminopeptidase  56.06 
 
 		 519 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  52.67 
 
 		 497 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  53.01 
 
 		 496 aa  445  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  51.21 
 
 		 496 aa  443  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0580  leucyl aminopeptidase  49.17 
 
 		 503 aa  444  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458799  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  50.31 
 
 		 498 aa  439  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  52.17 
 
 		 497 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2099  aminopeptidase A/I  51.44 
 
 		 497 aa  435  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14470  leucyl aminopeptidase  53.9 
 
 		 495 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  47.81 
 
 		 493 aa  435  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  52.52 
 
 		 500 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  50.22 
 
 		 497 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  50.89 
 
 		 512 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1372  PepA aminopeptidase  61.79 
 
 		 500 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00219967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  49.78 
 
 		 506 aa  415  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  50.67 
 
 		 492 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0795  leucyl aminopeptidase  47.44 
 
 		 502 aa  413  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0910  leucyl aminopeptidase  47.22 
 
 		 502 aa  413  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000452493  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01576  leucyl aminopeptidase  46.78 
 
 		 513 aa  413  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.327034  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0395  leucyl aminopeptidase  45.45 
 
 		 504 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1076  leucyl aminopeptidase  46.62 
 
 		 502 aa  411  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0190451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0939  leucyl aminopeptidase  47.01 
 
 		 502 aa  409  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.245826  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0740  leucyl aminopeptidase  46.25 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002428  cytosol aminopeptidase PepA  46.47 
 
 		 502 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00175472  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3109  leucyl aminopeptidase  46.79 
 
 		 502 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000897805  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03635  leucyl aminopeptidase  46.47 
 
 		 502 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4047  leucyl aminopeptidase  47.75 
 
 		 503 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00149505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1178  leucyl aminopeptidase  46.79 
 
 		 502 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3557  leucyl aminopeptidase  48.78 
 
 		 502 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3679  leucyl aminopeptidase  47.75 
 
 		 503 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0257256  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3562  leucyl aminopeptidase  45.16 
 
 		 501 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.025023  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2827  leucyl aminopeptidase  46.58 
 
 		 502 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.246514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2909  leucyl aminopeptidase  46.37 
 
 		 502 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.112327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0924  leucyl aminopeptidase  45.73 
 
 		 502 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317075  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3006  leucyl aminopeptidase  46.37 
 
 		 502 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.132109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3543  leucyl aminopeptidase  47.75 
 
 		 503 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00770626  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1368  leucyl aminopeptidase  45.94 
 
 		 502 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1257  leucyl aminopeptidase  46.58 
 
 		 502 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0396745  hitchhiker  0.0000114036 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3119  leucyl aminopeptidase  46.58 
 
 		 502 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000969621  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0871  leucyl aminopeptidase  45.94 
 
 		 502 aa  404  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238632  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3262  leucyl aminopeptidase  46.58 
 
 		 502 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0507418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2083  leucyl aminopeptidase  47.22 
 
 		 503 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000600102  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1014  leucyl aminopeptidase  46.15 
 
 		 502 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0465604  normal  0.808003 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04126  leucyl aminopeptidase  48.45 
 
 		 503 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0158539  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3737  Leucyl aminopeptidase  48.45 
 
 		 503 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662158  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4007  leucyl aminopeptidase  58.81 
 
 		 486 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.502988 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4832  leucyl aminopeptidase  48.45 
 
 		 503 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000259407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04090  hypothetical protein  48.45 
 
 		 503 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0200795  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5781  leucyl aminopeptidase  48.45 
 
 		 503 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0325394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4821  leucyl aminopeptidase  48.45 
 
 		 503 aa  401  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000301619  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3720  leucyl aminopeptidase  47.44 
 
 		 502 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3752  leucyl aminopeptidase  48.45 
 
 		 503 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00102834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4516  leucyl aminopeptidase  48.45 
 
 		 503 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000167051  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4740  leucyl aminopeptidase  48.45 
 
 		 503 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000218455  normal  0.712457 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0562  leucyl aminopeptidase  46.9 
 
 		 503 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00163208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>