More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0412 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0412  leucyl aminopeptidase  100 
 
 		 489 aa  971    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0249677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0890  leucyl aminopeptidase  68.08 
 
 		 485 aa  576  1.0000000000000001e-163  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119935  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1761  leucyl aminopeptidase  65.38 
 
 		 481 aa  556  1e-157  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  54.17 
 
 		 497 aa  475  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  51.39 
 
 		 500 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  52.81 
 
 		 497 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  53.03 
 
 		 497 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  52.31 
 
 		 498 aa  435  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  48.89 
 
 		 496 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  48.59 
 
 		 500 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  52.34 
 
 		 499 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2531  leucyl aminopeptidase  53.59 
 
 		 493 aa  426  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.353426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  48.92 
 
 		 496 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  50 
 
 		 495 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  55.61 
 
 		 514 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  49.78 
 
 		 500 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  47.17 
 
 		 498 aa  415  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  53.77 
 
 		 487 aa  416  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  47.07 
 
 		 500 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3937  Leucyl aminopeptidase  51.55 
 
 		 497 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0971426 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2314  leucyl aminopeptidase  48.72 
 
 		 499 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0650  leucyl aminopeptidase  48.76 
 
 		 542 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2965  leucyl aminopeptidase  49.13 
 
 		 500 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3944  Leucyl aminopeptidase  50.11 
 
 		 497 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2339  leucyl aminopeptidase  45.56 
 
 		 500 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2221  Leucyl aminopeptidase  57.95 
 
 		 539 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.258541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0557  leucyl aminopeptidase  48.62 
 
 		 503 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0287473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3651  leucyl aminopeptidase  49.57 
 
 		 497 aa  405  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1191  leucyl aminopeptidase  58.33 
 
 		 488 aa  403  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239585  normal  0.359971 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  46.98 
 
 		 497 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_002978  WD0054  leucyl aminopeptidase  46.31 
 
 		 500 aa  396  1e-109  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1545  leucyl aminopeptidase  52.26 
 
 		 497 aa  398  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.87214  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0369  leucyl aminopeptidase  45.26 
 
 		 500 aa  397  1e-109  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5097  leucyl aminopeptidase  50.11 
 
 		 500 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803796  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0642  leucyl aminopeptidase  44.49 
 
 		 500 aa  390  1e-107  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1815  leucyl aminopeptidase  52.84 
 
 		 488 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5835  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  48.12 
 
 		 500 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1227  leucyl aminopeptidase  48.43 
 
 		 494 aa  386  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.494822 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1122  leucyl aminopeptidase  52.82 
 
 		 489 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0950  leucyl aminopeptidase  58.51 
 
 		 491 aa  353  4e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  44.11 
 
 		 506 aa  348  9e-95  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1543  leucyl aminopeptidase  52.69 
 
 		 489 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2899  leucyl aminopeptidase  52.69 
 
 		 489 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.886783  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  42.51 
 
 		 491 aa  335  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0903  leucyl aminopeptidase  59.06 
 
 		 533 aa  335  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2595  leucyl aminopeptidase  46.77 
 
 		 486 aa  330  3e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0344474 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0568  leucyl aminopeptidase  43.45 
 
 		 514 aa  327  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  45.41 
 
 		 493 aa  325  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  44.44 
 
 		 497 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  41.61 
 
 		 492 aa  323  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2807  leucyl aminopeptidase  42.89 
 
 		 510 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.494526  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  42.79 
 
 		 496 aa  323  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  41.78 
 
 		 506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  41.65 
 
 		 496 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  40.46 
 
 		 496 aa  318  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  42.92 
 
 		 498 aa  318  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  39.92 
 
 		 496 aa  317  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  46.72 
 
 		 500 aa  317  5e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  45.73 
 
 		 497 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  42.7 
 
 		 492 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1942  leucyl aminopeptidase  50.83 
 
 		 484 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.189087  normal  0.0962979 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  40.6 
 
 		 510 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2683  leucyl aminopeptidase  41.84 
 
 		 510 aa  312  9e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417849  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  42.58 
 
 		 503 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  41.3 
 
 		 508 aa  311  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  42.19 
 
 		 496 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  40.17 
 
 		 510 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  40.17 
 
 		 518 aa  312  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  40.17 
 
 		 510 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  42.46 
 
 		 497 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  43.39 
 
 		 497 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  39.91 
 
 		 501 aa  310  4e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1921  PepA aminopeptidase  45.48 
 
 		 496 aa  310  5e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  39.96 
 
 		 510 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  42 
 
 		 497 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1725  Leucyl aminopeptidase  44.42 
 
 		 496 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1372  PepA aminopeptidase  46.83 
 
 		 500 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00219967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2389  leucyl aminopeptidase  45.1 
 
 		 556 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0738051 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  40.76 
 
 		 496 aa  307  3e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  44.9 
 
 		 497 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1233  Leucyl aminopeptidase  45.9 
 
 		 536 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1538  Leucyl aminopeptidase  39.33 
 
 		 521 aa  306  6e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  39.49 
 
 		 496 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  42.01 
 
 		 503 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3638  leucyl aminopeptidase  42.11 
 
 		 508 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0623  leucyl aminopeptidase  50.93 
 
 		 536 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022147  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  39.65 
 
 		 511 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  39.65 
 
 		 511 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0672  leucyl aminopeptidase  41.21 
 
 		 503 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131904  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  41.21 
 
 		 503 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  46.39 
 
 		 495 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2519  leucyl aminopeptidase  46.13 
 
 		 522 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.164338  normal  0.0174769 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  41.21 
 
 		 503 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  41.21 
 
 		 503 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  41.63 
 
 		 503 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0053  leucyl aminopeptidase  35.85 
 
 		 548 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  41.63 
 
 		 503 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  39.65 
 
 		 511 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  41.63 
 
 		 503 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14470  leucyl aminopeptidase  46.39 
 
 		 495 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>