More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5835 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3944  Leucyl aminopeptidase  68.74 
 
 
497 aa  673    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3937  Leucyl aminopeptidase  69.74 
 
 
497 aa  682    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0971426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3651  leucyl aminopeptidase  68.94 
 
 
497 aa  670    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0557  leucyl aminopeptidase  64.74 
 
 
503 aa  634    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0287473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5097  leucyl aminopeptidase  89.58 
 
 
500 aa  834    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803796  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5835  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  100 
 
 
500 aa  994    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  62.82 
 
 
500 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  62.79 
 
 
498 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  61.55 
 
 
500 aa  600  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  61.08 
 
 
499 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2339  leucyl aminopeptidase  59.76 
 
 
500 aa  590  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  60.56 
 
 
500 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2965  leucyl aminopeptidase  60.36 
 
 
500 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434941  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2314  leucyl aminopeptidase  59.92 
 
 
499 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2221  Leucyl aminopeptidase  59.18 
 
 
539 aa  558  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.258541 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0650  leucyl aminopeptidase  56.75 
 
 
542 aa  552  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  58.47 
 
 
497 aa  552  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  56.66 
 
 
496 aa  545  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  56.43 
 
 
496 aa  542  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  56.92 
 
 
495 aa  540  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  60.04 
 
 
497 aa  521  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  56.8 
 
 
497 aa  509  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  56.36 
 
 
498 aa  509  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  53.75 
 
 
497 aa  508  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1545  leucyl aminopeptidase  60.91 
 
 
497 aa  498  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.87214  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  52.28 
 
 
500 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2531  leucyl aminopeptidase  52 
 
 
493 aa  439  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.353426  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1227  leucyl aminopeptidase  49.26 
 
 
494 aa  434  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.494822 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1191  leucyl aminopeptidase  51.1 
 
 
488 aa  416  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239585  normal  0.359971 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  50.51 
 
 
487 aa  418  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  49.8 
 
 
514 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1815  leucyl aminopeptidase  50.88 
 
 
488 aa  414  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0642  leucyl aminopeptidase  50.23 
 
 
500 aa  402  1e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0369  leucyl aminopeptidase  47.84 
 
 
500 aa  397  1e-109  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1761  leucyl aminopeptidase  48.88 
 
 
481 aa  395  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_002978  WD0054  leucyl aminopeptidase  48.49 
 
 
500 aa  394  1e-108  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1122  leucyl aminopeptidase  45.96 
 
 
489 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0412  leucyl aminopeptidase  55.07 
 
 
489 aa  388  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0249677 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1543  leucyl aminopeptidase  47.73 
 
 
489 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0903  leucyl aminopeptidase  47.88 
 
 
533 aa  369  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0577205 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2899  leucyl aminopeptidase  47.52 
 
 
489 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.886783  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0890  leucyl aminopeptidase  48.83 
 
 
485 aa  364  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119935  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0950  leucyl aminopeptidase  46.36 
 
 
491 aa  361  2e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111685  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  42.16 
 
 
506 aa  343  2.9999999999999997e-93  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  42.02 
 
 
508 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  43.17 
 
 
497 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2996  leucyl aminopeptidase  39.91 
 
 
515 aa  325  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  37.14 
 
 
510 aa  319  6e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  37.14 
 
 
510 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  37.14 
 
 
510 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  37.97 
 
 
518 aa  318  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  36.93 
 
 
510 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2389  leucyl aminopeptidase  44.54 
 
 
556 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0738051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  37.06 
 
 
511 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  37.06 
 
 
511 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  36.85 
 
 
511 aa  312  9e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0959  cytosol aminopeptidase  38.02 
 
 
511 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0516  leucyl aminopeptidase  36.7 
 
 
495 aa  307  4.0000000000000004e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.204663  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  42.16 
 
 
487 aa  306  8.000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  39.82 
 
 
496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  39.53 
 
 
496 aa  301  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  42.44 
 
 
488 aa  301  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0388  leucyl aminopeptidase  38.36 
 
 
510 aa  300  6e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00389759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  40.35 
 
 
491 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  41.39 
 
 
500 aa  297  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  41.31 
 
 
496 aa  297  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  38.81 
 
 
506 aa  297  3e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0795  leucyl aminopeptidase  37.19 
 
 
502 aa  296  4e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1368  leucyl aminopeptidase  37.79 
 
 
502 aa  296  5e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  40.47 
 
 
496 aa  296  6e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0924  leucyl aminopeptidase  37.16 
 
 
502 aa  296  6e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317075  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2827  leucyl aminopeptidase  37.79 
 
 
502 aa  296  7e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.246514  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  39.1 
 
 
497 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  38.01 
 
 
493 aa  295  1e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2909  leucyl aminopeptidase  37.58 
 
 
502 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.112327  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3006  leucyl aminopeptidase  37.58 
 
 
502 aa  295  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.132109  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3119  leucyl aminopeptidase  37.16 
 
 
502 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000969621  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3109  leucyl aminopeptidase  37.16 
 
 
502 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000897805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  39.55 
 
 
492 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1257  leucyl aminopeptidase  37.16 
 
 
502 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0396745  hitchhiker  0.0000114036 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0871  leucyl aminopeptidase  37.42 
 
 
502 aa  294  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238632  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3262  leucyl aminopeptidase  37.16 
 
 
502 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0507418  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1178  leucyl aminopeptidase  37.16 
 
 
502 aa  294  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  40.04 
 
 
496 aa  294  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2683  leucyl aminopeptidase  39.83 
 
 
510 aa  293  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417849  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  40.48 
 
 
495 aa  292  9e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  43.44 
 
 
482 aa  292  9e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  38.9 
 
 
512 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  37.39 
 
 
493 aa  291  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  38.4 
 
 
498 aa  291  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  39 
 
 
497 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  41.87 
 
 
495 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14470  leucyl aminopeptidase  39.12 
 
 
495 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2807  leucyl aminopeptidase  39.57 
 
 
510 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.494526  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  43.36 
 
 
493 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  38.78 
 
 
497 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  39.67 
 
 
496 aa  289  7e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2595  leucyl aminopeptidase  42.73 
 
 
486 aa  289  9e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0344474 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2102  leucyl aminopeptidase  36.84 
 
 
512 aa  289  9e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2519  leucyl aminopeptidase  37.62 
 
 
522 aa  288  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.164338  normal  0.0174769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>